Helicobacter pylori - résistance à la clarithromycine

Helicobacter pylori - résistance à la clarithromycine
L'augmentation des échecs du traitement d'éradication observée en Europe est
essentiellement due à la progression du taux de résistance primaire à la clarithromycine. Le
germe étant fastidieux et exigeant, la mise en évidence de cette résistance est difficile et
longue par les moyens bactériologiques classiques sur antibiogramme. Les tests de
sensibilité par culture ne sont pas généralisés, ils sont réservés aux laboratoires spécialisés.
Depuis 1996 on connaît le mécanisme de résistance aux macrolides. Des mutations
ponctuelles dans le gène de l'ARNr 23S entraînent une perte d'affinité de la clarithromycine
au ribosome bactérien, le cible de l'antibiotique. En Europe, environ 10 à 20% des souches
de patients sans antécédents d'un traitement sont résistantes, chez les individus traités sans
succès elles sont au-dessus de 90%. Pour la Suisse, quelques chiffres ont été publiés: au
canton de Bâle on a trouvé 3% de souches résistantes en 1994 et 7.5% en 2000; au canton
du Tessin 12% en 2000 et une enquête dans la région Zurichoise, publiée en 2005, parle de
22%.
Sur la base de plusieurs protocoles décrits, nous avons developpé une méthode moléculaire
pour la recherche des mutations actuellement connues. La région du gène de l'ARNr 23S,
dans laquelle les mutations sont localisées, est amplifiée par PCR, ensuite, le produit
d'amplification subit le séquençage et la séquence est comparée à la séquence de référence
U27270. Nous avons évalué cette méthode sur des biopsies gastriques stockées,
préalablement testées positives pour la présence d'ADN de Helicobacter pylori. La sensibilité
de l'analyse moléculaire pour la recherche de la résistance à la clarithromycine est à 96%.
Etant donné que l'on n'analyse que les prélèvements positifs pour l'ADN de Helicobacter
pylori, la spécificité est à 100%. Le résultat est disponible dans 1 à 2 jours. Pour l'analyse de
selles, la méthode n'est pas utilisable.
Cette technique rapide et performante permet l'évaluation de la résistance bactérienne de
routine afin d'éviter au patient un traitement inutile. En plus, par un traitement adapté à la
sensibilité, on ne contribue pas à l'accroissement de souches résistantes à la clarithromycine
de Helicobacter pylori et d'autres bactéries.