Cohorte dans l`infection VIH menée sous l`égide de l`Agence

Cohorte dans l’infection VIH menée sous l'égide de l'Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (Novembre 2010)
ANRS CO15 ALT (ex- EP 02)
Étude des paramètres immuno-virologiques des sujets asymptomatiques à long terme (ALT) au cours de
l'infection par VIH
Nombre de centres 14
Nb de sujets inclus / attendus 71/70
Situation Suivi annuel de patients – (4 patients suivis en 2010)
Équipe de coordination
Investigateur coordonnateur Brigitte Autran (Hôpital Pitié Salpêtrière, Inserm U945, Paris),
Co-investigateurs Henri Agut (Hôpital Pitié Salpêtrière, Paris), Christine Rouzioux (Hôpital Necker, Paris)
Coordination Méthodologique Dominique Costagliola (Inserm U943, Paris)
Promoteur ANRS
Objectif principal Définir un ensemble de paramètres cliniques, virologiques et immunologiques associés à la
persistance d’un état clinique asymptomatique depuis 8 ans et plus après infection par le VIH.
Sous études Caractérisation moléculaire du VIH ; Génétique de l’Hôte ; Réponses T CD4 et CD8 anti-VIH ;
Anticorps anti-VIH et Ac Neutralisants ; Immunité Innée ; Co-infections virales (HCV, CMV,
HHV8, …) et Réponses Immunes aux Co-Infections.
Méthodologie cohorte prospective, multicentrique établie depuis 1994
Principaux critères de sélection Critères d’inclusion :
Groupe ALT : homme ou femme de plus de 18 ans, homo ou bisexuel,
toxicomane sevré, transfusé ou hémophile,
séropositif depuis au moins 8 ans, sans aucun traitement anti-
rétroviral,
(stade II) ou (stade III), les lymphocytes CD4 étant supérieurs à 20 % et 600/mm
3
(plus ou
moins 10 %) avec un
taux stable ou en augmentation sur au minimum 3 examens durant les 5
dernières années , ayant signé un consentement éclairé. Groupe témoin: l’âge (plus ou moins 5 ans), le
sexe, séropositif depuis au moins 8 ans, n'ayant pas eu de traitement anti-rétroviral,
asymptomatique
(stade B) ou porteur d'adénopathies (stade TT1)
;
dont le taux de lymphocytes CD4 est inférieur à
400/mm3, supérieur ou égal à 300/mm3 en diminution de 25 % ou plus durant les 3 années précédentes.
Critères d’exclusion :
Age <18 ans , sujet non suivi durant les 3 années précédentes, n'ayant pas
une mesure annuelle des lymphocytes CD4 ou dont le taux de lymphocytes CD4 est < à
300/mm
3
, poursuite de la toxicomanie, traitement anti-rétroviral suivi impossible, tout symptôme
excluant les sujets des groupes II et III (classification de 1987) du CDC
.
Modalités du suivi Annuel (conformément à la pratique habituelle) pour les sujets ALT non traités
Informations collectées Données virologiques, immunologiques et génétiques: constitution d’une biothèque (plasma, cellules
et DNA-thèque (J0 puis annuel)).
Autres : Cliniques, biologiques, virologiques, mode de contamination
Principaux résultats Virologie : H Agut
VIH : de type R5 ; Faible réplication virale (charge virale (CV) plasmatique, ADN viral associé aux
cellules, virémie cellulaire), charge en ADN viral prédictrice de l’évolution; séquences virales non
délétées.
Co-infections par HCV, HHV8, HCMV, HHV7: caractérisées par un faible niveau de réplication virale
Génétique de l’Hôte : I Theodorou, P Debré
Profil génétique particulier défini par l’association de: Mutations de CCR5,CCR2, SDF-1 et HLA (-B17
(57), B27, notamment), présent chez 66% ALT;
Autres Mutations : CX3CR1 gènes de morts cellulaire…..
Immunologie :
 Anticorps : H Agut, C Rouzioux, F Barin, V Vieillard et P Debré
 Neutralisants présents et corrélés de façon positive à la CV, présentant certaines caractéristiques
des Ac monoclonaux humains de référence (2F5, 4E10, B12, 2G12)

 Isotypes : présence d’anticorps de type IgG2 anti-VIH notamment gp41 en association étroite
(corrélation positive) avec une faible CV et des réponses CD4 anti-VIH de type Th1 : facteur prédictif
puissant de non-progression.
 3S : l’expression de NKp44L (ligand d’un récepteur activateur des NK) sur les lymphocytes T CD4 est
inversement corrélée aux taux de CD4 et directement corrélée à la CV VIH chez les patients ALT.
NKp44L est induit par un motif de la gp41 du VIH-1 (motif 3S). La présence d’anticorps anti-3S est
très significativement corrélée au taux de CD4, mais pas à la CV indiquant l’implication d’un
mécanisme de déplétion CD4 dépendant de NKp44L et sous le contrôle de la réponse anticorps anti-
3S.
o
 Immunité cellulaire : B Autran et V Appay
o Anti-VIH :
o Cellules T CD4 Th1 anti-VIH (IFN- et IL-2): présentes et négativement corrélées aux
charges virales et provirales, prédictives de la non progression (taux stables de CD4) si
associées aux IgG2.
o Cellules T CD8 anti-VIH : intenses et diverses, caractéristiques multi-fonctionnelles de
cellules mémoires-effectrices ; seuls les taux de cellules anti-Gag, mais non anti-Nef, sont
négativement corrélés à charge provirale; l’impact des molécules HLA-B27 et -B57 a été
particulièrement étudié, les corrélations entre réponses CD8 anti-Gag et charge provirale
dépendant de HLA-B27. Ces 2 molécules HLA induisent un profil protecteur particulier des
cellules CD8 anti-VIH via des mécanismes différents en fonction du HLA (avidité pour B27
notamment)
o Dirigée contre les autres virus : réponses intenses, diverses et protectrices dirigées
contre HCV, HCMV, HHV8
Évolution : Réduction progressive du nombre de patients ALT activement suivis du fait de l’initiation de traitements
antirétroviraux : 24 suivis en 2001. Ces patients correspondent essentiellement à une définition
d’ «Elite Controllers »
Amendement n°1: prolongation de 5 ans du suivi annuel des patients ALT non traités : 18 ont été
suivis : 6 (33%) avaient des taux de CD4>600/mm3
Amendement n°2 : évaluation ponctuelle des patients ALT traités
Amendement n°3 : soumis en Février 2009: 1) poursuite de la surveillance annuelle ALT ; 2) inclusion
de nouveaux patients ALT
Pour information Pr Brigitte Autran
Hôpital Pitié-Salpêtrière
Laboratoire d’Immunologie Cellulaire UMR-S 945, UPMC Univ Paris 06
83 boulevard de l’Hôpital 75013 Paris
Tél : [phone]
Fax : [phone]
E-mail: [email protected]
Mme Dominique Costagliola
Hôpital Pitié-Salpêtrière
Épidémiologie, stratégies thérapeutiques et virologie cliniques dans l’infection à
VIH, U943 INSERM et UPMC Univ Paris 06
56, boulevard Vincent Auriol 75013 Paris
Tél : [phone]
Fax : [phone]
E-mail: [email protected]
Publications principales (3 à 5) au cours des 3 dernières années
- Almeida JR, Price DA, Papagno L, et al. Superior control of HIV-1 replication by CD8+ T cells is reflected by their avidity, polyfunctionality, and
clonal turnover. J Exp Med 2007,204:2473-2485.
- Braibant M, Brunet S, Costagliola D, et al. Antibodies to conserved epitopes of HIV-1 envelope in sera from long-term non-progressors:
prevalence and association with neutralizing activity. Aids 2006, 20:1923-1930
- Braibant M, Agut H, Rouzioux C, Costagliola D, Autran B, Barin F. Characteristics of the env genes of HIV type 1 quasispecies in long-term
non progressors with broadly neutralizing antibodies. J Acquir Immune Defic Syndr 2008, 47:274-284.
- Vieillard V, Costagliola D, Simon A, Debre P. Specific adaptive humoral response against a gp41 motif inhibits CD4 T-cell sensitivity to NK
lysis during HIV-1infection. Aids 2006, 20:1795-1804

- Martinez V, Diemert MC, Braibant M, et al. Anticardiolipin Antibodies in HIV Infection Are Independently Associated with Antibodies to the
Membrane Proximal External Region of gp41 and with Cell-Associated HIV DNA and Immune Activation. Clin Infect Dis 2008.
Travaux effectués et en cours
 Virologie : H Agut et C. Rouzioux
- Poursuite des déterminations des CV ARN-VIH plasmatiques et de l’étude quantitative de certaines infections virales
associées (herpèsvirus leucotropes, virus des hépatites B et C, polyomavirus) (H Agut).
- Séquences : analyse complémentaire des séquences du VIH, éventuellement clonales (séquençage « en profondeur », par
pyroséquençage par exemple) orientée sur les gènes interférant avec les effecteurs de la réponse immunitaire (gènes
accessoires, env, gag) à la recherche de signatures génétiques expliquant la meilleure efficacité de la réponse immune ;
analyse étendue des virus VIH-1 non-B éventuellement présents dans la cohorte. Notamment séquençage de la gp41 du VIH-
1 dans les isolats viraux des sujets ALT (H Agut).
- Tropisme : étude génétique des phénotypes R5, X4 et R5X4 (H Agut).
- Études des réservoirs de VIH (cf. plus bas) et poursuite des déterminations de la CV ADN-VIH cellulaire (C. Rouzioux).
 Études des cellules hôtes responsables des réservoirs de VIH: B. Autran et C Rouzioux
 Les relations importantes entre données immunologiques et contrôle du virus a induit un programme d’exploration approfondie
de caractéristiques immunologiques des cellules CD4 hôtes du réservoir viral et de l’inductibilité de ce réservoir chez ces
sujets, particulièrement chez les «Elite Controllers». Ces travaux ont permis l’identification d’une sous-population de cellules T
CD4 mémoires abritant la moitié du réservoir viral. Ces travaux en cours de publication se poursuivent par la caractérisation
des facteurs régulant cette transcription dans ces populations cellulaires (en collaboration avec d’autres équipes françaises).
 Immunogénétique de l’hôte : I. Théodorou
 Le groupe de I. Théodorou a utilisé l’approche d’analyse expansive du génome humain (Genome Wide Analysis –GWAS) en
utilisant la plateforme génomique de l’ANRS à la Pitié-Salpêtrière.
 Immunité cellulaire : B Autran, V Appay
 Poursuite de l’analyse des réponses T CD4 et CD8 anti-VIH notamment ayant un tropisme intestinal. Analyse de la
multifonctionnalité (IFN, TNF, IL2, MIP-1, IL-17) des réponses anti-VIH et analyse de l’avidité cellulaire.
 Immunité humorale:
 Anticorps neutralisants : F Barin
 Poursuite de l’analyse fine des propriétés des anticorps d’enveloppe de large spectre et des mécanismes d’échappement en
relation avec l’immunité cellulaire.
 Anticorps 3S : V Vieillard, P Debré
 Poursuite des mesures de l’expression de NKp44L en relation avec les séquences de la gp41et de Nef.
Faits marquants
- Cohorte: Réduction progressive du nombre de sujets suivis au phénotype «Elite Controllers».
- Faits scientifiques :
* Définition des mécanismes d’action protectrice des molécules HLA-B27 et -B57, rôle de l’avidité cellulaire
* Démonstration d’un nouveau mécanisme de déplétion CD4 médié par les cellules NK
* Caractérisation des anticorps neutralisants anti-VIH en relation avec les séquences virales
* Présence d’auto-anticorps de type anti-phospholipides corrélée à la charge virale
* Définition du profil génétique par étude GWAS
* Définition de la distribution immunologique des réservoirs de VIH
Collaborations nationales et internationales
- Nationales :
- Avec Francis Barin intégré en tant que membre actif du Comité Scientifique de la Cohorte sur l’étude des anticorps
neutralisants anti-VIH
- Avec l’observatoire ANRS EP36 « HIV controllers » études communes de l’immunité cellulaire anti-VIH et des profils
génétiques.. Cette collaboration a conduit à un accord sur la création d’une nouvelle cohorte « Cohorte des extrêmes » qui
regroupera les Cohortes préexistantes CO15 et CO18.
- Avec Moncef Benkirane (Montpellier) dans le cadre de l’AC réservoirs : études des micro-RNA dans ces différentes
populations cellulaires.

- Internationales :
- Programme Européen GISHEAL : Constitution d’une supra-cohorte européenne de LTNP/Elite Controllers incluant les
cohortes ALT –ANRSCO15, Italienne (ELVIS), Anglaise et Ougandaise (n ≈220) pour l’exploration des profils génétiques et
immunologiques.