Cancer colorectal

publicité
Cancer colorectal
Deux types génétiques alternatifs
- Instabilité chromosomique: CIN (MSS, LOH)
KRAS (40%)
Epithelium
normal
APC (60-70%)
5q- (25%)
MYH
STK11
Crypte
aberrante
85-92%
APC (80%)
5q- (50%)/APC (30%)
18q- (80%)/SMAD (27%)
17p- (70%)/p53 (50%)
Dissémination
par voie sanguine
Adénome
MMR
KRAS (40%)
- Instabilité génomique: MIN (MSI, RER)
Cancer
Envahissement
ganglionnaire
TGFBR2 (80%)
BAX (30%)
IGF2R
8-15%
Autres: CTNNB1, PTEN, TCF4 …
Métastases
à distance
Risque évolutif des cancers coliques
8p-/8q+
4pType génétique MSS (90%)
19q-
???
APC: 1er hit
Epithelium
normal
Crypte
aberrante
Adénome
Grade de dysplasie
Cancer
Stade
T
Envahissement
ganglionnaire
N
T4 (5-10%) +/- perforation
différenciation colloïde (10%)
envahissement vasculaire (30%)
Métastases
à distance
M
Les prédispositions génétiques majeures
Polyposes: M(âge) 39-55 ans, P(mut) 0.2-0.4, contribution <5%
Polypose adénomateuse familiale (FAP)
Polyposes adénomateuses atténuées (MAP)
Polypose de Peutz-Jeghers
Polyposes juvéniles
(Li-Fraumeni)
Tumeurs MSS
Epithelium
normal
APC
MYH
STK11
Crypte
aberrante
SMAD
p53
Adénome
Cancer
Envahissement
ganglionnaire
Tumeurs MSI
MMR
TGFBR2
Syndrome de Lynch (HNPCC) M(âge) 45 ans, P(mut) > 0.8, contribution 2-3%
Métastases
à distance
Les allèles à faible pénétrance
GWAS: 8q23.3, 8q24
9p24
10p14
11q23
14q22.2
15q13.3
16q22.1
18q21 (SMAD7)
20p12.3
Tumeurs MSS
Epithelium
normal
Tumeurs MSI
Gènes candidats:
MMP
PAI1
APC p.Ile1307Lys
Crypte
aberrante
Adénome
Cancer
Envahissement
ganglionnaire
Métastases
à distance
Le projet iCOMET
Inherited COlon cancer METastases
GWAS
Tumeurs MSS N0 au diagnostic
Suivi des patients 4.5 ans
Epithelium
normal
Crypte
aberrante
Adénome
Type génétique
Cancer
Envahissement
ganglionnaire
Éléments pronostiques:
T4 (5-10%) +/- perforation
différenciation colloïde (10%)
envahissement vasculaire (30%)
Métastases
à distance
Etude de faisabilité
Hypothèses:
- Modèle génétique additif (multiplicatif)
- Fréquence de l’allèle « à risque »: 0.1-0.4
- OR: 1.25-1.50
- Déséquilibre de liaison avec l’allèle fonctionnel r2=0.8
Génotypage initial:
- 650 M+/1 300 M- (série rétrospective, 550 000 SNPs avec MAF=0.05)
Confirmation:
- 650 M+/1 300 M- (série rétrospective, 550 000 SNPs avec MAF=0.05)
- 1 300 M+/2 600 M- (série prospective, 25 000 associations les + fortes)
Modélisation
-seuil retenu: 10-7
Minor All. Freq.
0.10
0.20
0.40
OR 1.25
0.11
0.56
0.90
OR 1.50
0.99
1.00
1.00
Soutien du projet: GERCOR, FRENCH, AFC – SNFGE, ANGH, SFED – SFP
- Collaborations: Belgique, Suisse, Algérie, Chine
- Soutien financier: ARC – partie rétrospective (Gene Discovery) 1950 patients, Laboratoire
SERVIER (participation de la Chine)
Téléchargement