4V134 - Master BMC
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Intitulé de l’UE : STRUCTURE, ASSEMBLAGE ET INGÉNIERIE DES PROTÉINES Code de l’UE : 4V134 Responsable de l’UE : Secrétariat : Julien HENRI, Maître de Conférences Mel : [email protected] Carine JOSEPH Tél. : 01 44 27 35 35 Mel : [email protected] 1. Descriptif de l’UE Volumes horaires globaux (CM, TD, TP, stage, autre) : 60h (21h CM, 12h TD, 16h TP, 11h conférences scientifiques et visite de plateforme technologique) Nombre de crédits de l’UE : 6 ECTS Mention de master où l’UE est proposée : Mention Biologie Moléculaire et Cellulaire ; parcours Biochimie et Biologie Moléculaire. Semestre où l’enseignement est proposé : Semestre 2 du Master Effectifs prévus : 24 2 . Présentation pédagogique de l’UE a) Objectifs de l'Unité d'Enseignement Issues de 4 milliards d’années d’évolution, les protéines sont des machines moléculaires d’une grande complexité. Cependant, en dépit de leur sophistication, elles se structurent selon quelques règles universelles. Destinée aux étudiants en biologie, cette unité d’enseignement présente les principes d’organisation des protéines en objets physiologiquement fonctionnels, ainsi que les relations structures-fonctions qui aboutissent aux processus naturels ou pathologiques. b) Thèmes abordés Chez l’Homme, 20 000 séquences protéiques constituent 55% du poids sec des cellules dont elles contrôlent l’architecture et les réactions chimiques. L’analyse de la structure des protéines permet de décrypter leurs fonctions cellulaires et d’expliquer certains dysfonctionnements, notamment dans des cas de cancers et de neurodégénérescences. Mobilisables pour les défis scientifiques d’avenir tels que la production d’énergie ou la conception de thérapies nouvelles, les protéines sont un des sujets prioritaires des bioindustries. L’équipe d’enseignement décrira des systèmes multiprotéiques intégrés, leur utilisation en ingénierie thérapeutique et la création de fonctions par évolution dirigée. Elle mettra en avant des recherches académiques lors de conférences animées par des spécialistes du domaine. L’enseignement utilisera les moteurs de recherche bioinformatique, la visualisation sur mur vidéo et la simulation par jeu interactif. Les travaux pratiques seront consacrés à la purification à homogénéité d’une protéine modèle, le lysozyme, son analyse par spectrométrie de masse et sa cristallisation. • Repliement des protéines, domaines, fonctions des chaperons moléculaires Protéomique structurale • Cryo-microscopie électronique, applications à l'étude des protéines membranaires • Protéines thérapeutiques • Evolution dirigée des protéines • Interactions protéines-acides nucléiques b) Organisation pédagogique L'unité d'enseignement se déroulera sur deux semaines à plein temps. L’évaluation prendra en compte le travail de TP (20%), une analyse bibliographique (20%) et un examen écrit (60%). c) Pré-requis Il n’y a aucun pré-requis strict. Cette unité d’enseignement est destinée aux étudiants en biologie. Les connaissances en biologie moléculaire, biochimie et biologie cellulaire acquises en Licence sont suffisantes pour découvrir et acquérir l’ensemble des notions proposées pendant les enseignements. 1. Equipe pédagogique Animateur de l’équipe : Julien Henri. Cours magistraux : Julien Henri, Chahrazade El Amri, Bruno Collinet, Hubert Becker, Catherine Venien-Bryan, Manuela Dezi. Travaux dirigés : Julien Henri, Catherine Venien-Bryan. Travaux pratiques : Manuela Dezi. Conférences scientifiques : intervenants extérieurs.
