PATHOLOGIE DE LA FAUNE et de l`Environnement

PTM 4240
Daniel Martineau, DMV, M.Sc. Ph.D. Dipl., ACVP
Professeur, Département de pathologie
Faculté de Médecine Vétérinaire, Université de Montréal
[e-mail]
Janvier 2001
Département de Microbiologie et Pathologie
Faculté de Médecine Vétérinaire
Université de Montréal
PATHOLOGIE DE LA FAUNE
et de l'Environnement

Pathologie de la faune 2001 Daniel
Martineau
TABLES DES MATIÈRES
RÔLES DES VÉTÉRINAIRES DANS LA FAUNE.............................................................................2
GÉNÉRALITÉS ..................................................................................................................................2
DIAGNOSTIC DE MALADIES ................................................................................................................2
ÉPIDÉMIOLOGIE................................................................................................................................2
DÉTERMINER DES MÉTHODES POUR PRÉVENIR, CONTRÔLER OU ÉLIMINER DES MALADIES IMPORTANTES
CHEZ LA FAUNE ................................................................................................................................2
AMÉLIORER LES TECHNIQUES DE CAPTURE, LA MÉDECINE ET L'ANESTHÉSIE .........................................3
RÉHABILITATION...............................................................................................................................3
PRÉSERVER LES ESPÈCES MENACÉES ...............................................................................................3
TOXICOLOGIE ET TOXICOLOGIE ENVIRONNEMENTALE ..........................................................................4
BIODIVERSITÉ1,30 .............................................................................................................................4
INTRODUCTION.................................................................................................................................4
Principes de base......................................................................................................................4
Variété:................................................................................................................................................4
Abondance relative :............................................................................................................................4
DES NOMBRES.................................................................................................................................4
ORIGINE DE LA BIODIVERSITÉ ............................................................................................................5
ÉVOLUTION, SÉLECTION NATURELLE, GÉNÉTIQUE, ENVIRONNEMENT ET BIODIVERSITÉ ..........................8
Paléontologie.............................................................................................................................8
Évolution et sélection ................................................................................................................9
Génétique et environnement...................................................................................................10
Importance de la biodiversité ..................................................................................................12
Préservation de la biodiversité................................................................................................15
NOTIONS D'ÉCOLOGIE.....................................................................................................................21
Écologie :.................................................................................................................................21
Écologie des écosystèmes......................................................................................................21
Écologie de populations ..........................................................................................................21
Écosystème.............................................................................................................................21
Stabilité..............................................................................................................................................22
Résilience..........................................................................................................................................22
Producteurs.......................................................................................................................................24
Consommateurs................................................................................................................................24
Production nette ................................................................................................................................25
Chaîne alimentaire ............................................................................................................................25
Niveau trophique ...............................................................................................................................25
Implications directes des principes d'écologie dans les maladies animales.....................................26
RÉGULATION DES POPULATIONS......................................................................................................26
Modèle "bottom-up".................................................................................................................26
Modèle "top-down" ..................................................................................................................27
ALTERATION DE L'ENVIRONNEMENT PAR L'HOMME ............................................................................29
Surface terrestre......................................................................................................................29

Pathologie de la faune 2001 Daniel
Martineau
Océans....................................................................................................................................29
Azote.......................................................................................................................................30
Carbone ..................................................................................................................................30
Effet de serre.....................................................................................................................................31
Niveau des mers et réchauffement global....................................................................................32
Réchauffement global et Canada.................................................................................................33
Eau..........................................................................................................................................33
Pollution ..................................................................................................................................35
Composés à base de chlore .............................................................................................................35
Effets oestrogéniques des produits à base de chlore ..................................................................36
Autres effets des composés à base de chlore .............................................................................37
Effets immunodépresseurs des polluants.........................................................................................37
Effets cancérigènes des polluants ....................................................................................................37
Mutations......................................................................................................................................37
Autres mécanismes de carcinogenèse ........................................................................................40
Pluies acides.....................................................................................................................................40
Trou dans la couche d’ozone............................................................................................................40
Mercure.............................................................................................................................................40
Déversements d'huile........................................................................................................................41
Déversements "opérationnels".....................................................................................................41
Déversements majeurs accidentels .............................................................................................42
Prévention ....................................................................................................................................42
Inspection ................................................................................................................................42
Effets des déversements d'huile...................................................................................................42
Nettoyage.....................................................................................................................................43
Un cas typique de déversement: l'Exxon Valdez, Prince William Sound, Alaska.........................43
Impact sur les animaux............................................................................................................43
Loutres................................................................................................................................43
Phoques..............................................................................................................................44
Orques épaulards ...............................................................................................................44
Oiseaux...............................................................................................................................45
Poissons .............................................................................................................................45
Moules ................................................................................................................................45
Humains..............................................................................................................................45
Conclusions générales à tirer de l'Exxon.................................................................................45
PROTECTION DES ESPECES MENACEES ........................................................................................... 46
Techniques de reproduction assistée ..................................................................................... 46
Insémination artificielle......................................................................................................................46
Fertilisation in vitro............................................................................................................................46
Clonage...................................................................................................................................46
Méthodes anticonceptionnelles...............................................................................................47
Contrôle des pestes par des virus ..........................................................................................47
Lapin et renard australiens................................................................................................................47
PCR.........................................................................................................................................48
MALADIES DE LA FAUNE............................................................................................................. 49
POURQUOI DIAGNOSTIQUER LES MALADIES DE LA FAUNE?.................................................................49
MICROPARASITES ....................................................................................................................50
MACROPARASITES...................................................................................................................50
ÉPIDEMIOLOGIE ............................................................................................................................. 50
Prévalence..............................................................................................................................51
Incidence.................................................................................................................................51
Taux reproducteur (Ro)...........................................................................................................51
IMPACT DES MALADIES SUR LA FAUNE.............................................................................................. 52
Le passé.................................................................................................................................. 52

Pathologie de la faune 2001 Daniel
Martineau
Le présent ...............................................................................................................................53
Impact de la maladie et biologie de l'hôte ...............................................................................53
Impact sur la reproduction.......................................................................................................54
Récupération des carcasses...................................................................................................54
MALADIES EMERGENTES.................................................................................................................54
Définition..................................................................................................................................54
Pourquoi des maladies émergentes ?.....................................................................................55
Changements environnementaux......................................................................................................55
Hôtes.................................................................................................................................................57
Translocation................................................................................................................................57
Agent.................................................................................................................................................57
Production animale industrielle ....................................................................................................57
Xénotransplantations....................................................................................................................57
Apparition de nouveaux agents infectieux....................................................................................58
Problèmes causés par les maladies émergentes....................................................................59
Problèmes pratiques posés par la recherche sur les effets des maladies émergentes sur les
animaux domestiques. ............................................................................................................59
Maladies émergentes spécifiques...........................................................................................60
Prion..................................................................................................................................................60
La maladie de la vache folle (Mad cow disease) et autres encéphalopathies spongiformes.......60
Virus ..................................................................................................................................................64
Hantavirus.....................................................................................................................................64
"Morbillivirus" équin ......................................................................................................................67
« Distemper » des lions................................................................................................................68
Morbillivirus des mammifères marins ...........................................................................................68
Influenza chez le phoque..............................................................................................................70
Autres virus récents de mammifères marins ................................................................................72
Maladie hémorragique du chevreuil due à un adénovirus............................................................72
Fièvre hémorragique du virus Ebola.............................................................................................72
Virus de l'immunodéficience humain ...........................................................................................73
Western Nile Virus........................................................................................................................73
Maladie de Lyme (Borreliose)............................................................................................................77
Amphibiens: un cas particulier
Chytridiomycose...........................................................................................................................81
Iridovirus.......................................................................................................................................82
Bactéries ......................................................................................................................................77
GENETIQUE, ENVIRONNEMENT, MALADIES ET CONSERVATION ...........................................................82
Molécules du complexe majeur d'histocompatibilité................................................................82
Guépard ..................................................................................................................................83
Pumas (panthères) (couguars) de Floride. (Felis concolor coryi)...........................................84
Les loups de l’Île Royale..........................................................................................................85
Baleine à bosse.......................................................................................................................86
AGENTS INFECTIEUX.......................................................................................................................86
Virus........................................................................................................................................86
Rage..................................................................................................................................................86
Bluetongue ........................................................................................................................................91
Maladie hémorragique épizootique du cerf (Hemorrhagic disease)..................................................92
Distemper..........................................................................................................................................93
Parvovirus..........................................................................................................................................93
Pseudorage.......................................................................................................................................95
Fièvre catarrhale maligne..................................................................................................................95
Herpèsvirus bovin 1 (IBR) .................................................................................................................96
BVD...................................................................................................................................................97
Parainfluenza-3 .................................................................................................................................97

Pathologie de la faune 2001 Daniel
Martineau
Maladie hémorragique du lapin.........................................................................................................97
Lésions prolifératives à Pox..............................................................................................................98
Ecthyma contagieux.....................................................................................................................98
Fibromatose du lapin....................................................................................................................98
Fibromatose de l'écureuil. ............................................................................................................98
Tumeurs induites par les papovavirus...............................................................................................98
Fibromes et fibropapillomes des ongulés.....................................................................................98
Papillomatose orale des carnivores .............................................................................................99
Rétrovirus: Lentivirus.........................................................................................................................99
Bactéries..........................................................................................................................................99
Anthrax..............................................................................................................................................99
Maladie de Lyme (Borreliose) .........................................................................................................101
Brucellose .......................................................................................................................................105
Tuberculose ....................................................................................................................................107
Paratuberculose..............................................................................................................................110
Leptospirose....................................................................................................................................110
Septicémies des rongeurs et des lagomorphes..............................................................................113
Tularémie....................................................................................................................................113
Maladie de Tyzzer......................................................................................................................115
Pseudotuberculose.....................................................................................................................115
Peste ..........................................................................................................................................116
Nécrobacillose.................................................................................................................................116
Kérato-conjonctivite à Chlamydia....................................................................................................117
Complexe de la pneumonie chez le mouflon ..................................................................................117
Pasteurella multocida......................................................................................................................117
Protozoaires...................................................................................................................................118
Toxoplasmose.................................................................................................................................118
Giardiose.........................................................................................................................................118
Sarcocystis sp.................................................................................................................................119
Fongi..............................................................................................................................................119
Trichophyton verrucosum................................................................................................................119
Adiaspiromycose.............................................................................................................................119
Parasites........................................................................................................................................119
Rappels...........................................................................................................................................119
Herbivores.......................................................................................................................................120
Généralités.................................................................................................................................120
Elaphostrongylus cervi rangiferi ............................................................................................123
Fascioloides magna...............................................................................................................120
Gale sarcoptique, Cuterebra, Psoroptes, Oestres.................................................................121
Orignal........................................................................................................................................121
Parelaphostrongylus tenuis ...................................................................................................122
Parelaphostrongylus andersoni.............................................................................................122
Fascioloides magna...............................................................................................................123
Taenia krabbei (Cysticercus tarandi).....................................................................................123
Taenia hydatigena (Cysticercus tenuicollis) .........................................................................123
Echinococcus granulosus (kyste hydatique) .........................................................................123
Wehrdikmansia cervipedis.....................................................................................................124
Dictyocaulus viviparus...........................................................................................................124
Dermacentor albipictus..........................................................................................................124
Caribou.......................................................................................................................................124
Cerf de Virginie...........................................................................................................................124
Wapiti .........................................................................................................................................125
Lièvre d'Amérique.......................................................................................................................125
Omnivores.......................................................................................................................................125
Moufette, raton-laveur ................................................................................................................125
Baylisascaris procyonis.........................................................................................................125
Capilaria plica........................................................................................................................126