PATHOLOGIE DE LA FAUNE et de l`Environnement

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PATHOLOGIE DE LA FAUNE
PTM 4240
et de l'Environnement
Daniel Martineau, DMV, M.Sc. Ph.D. Dipl., ACVP
Professeur, Département de pathologie
Faculté de Médecine Vétérinaire, Université de Montréal
[email protected]

Janvier 2001
Département de Microbiologie et Pathologie
Faculté de Médecine Vétérinaire
Université de Montréal
Pathologie de la faune 2001
Martineau
Daniel
TABLES DES MATIÈRES
RÔLES DES VÉTÉRINAIRES DANS LA FAUNE............................................................................. 2
GÉNÉRALITÉS .................................................................................................................................. 2
DIAGNOSTIC DE MALADIES ................................................................................................................ 2
ÉPIDÉMIOLOGIE................................................................................................................................ 2
DÉTERMINER DES MÉTHODES POUR PRÉVENIR, CONTRÔLER OU ÉLIMINER DES MALADIES IMPORTANTES
CHEZ LA FAUNE ................................................................................................................................ 2
AMÉLIORER LES TECHNIQUES DE CAPTURE, LA MÉDECINE ET L'ANESTHÉSIE ......................................... 3
RÉHABILITATION ............................................................................................................................... 3
PRÉSERVER LES ESPÈCES MENACÉES ............................................................................................... 3
TOXICOLOGIE ET TOXICOLOGIE ENVIRONNEMENTALE .......................................................................... 4
1,30
BIODIVERSITÉ
............................................................................................................................. 4
INTRODUCTION................................................................................................................................. 4
Principes de base...................................................................................................................... 4
Variété: ................................................................................................................................................4
Abondance relative :............................................................................................................................4
DES NOMBRES... .............................................................................................................................. 4
ORIGINE DE LA BIODIVERSITÉ ............................................................................................................ 5
ÉVOLUTION, SÉLECTION NATURELLE, GÉNÉTIQUE, ENVIRONNEMENT ET BIODIVERSITÉ .......................... 8
Paléontologie............................................................................................................................. 8
Évolution et sélection ................................................................................................................ 9
Génétique et environnement ................................................................................................... 10
Importance de la biodiversité .................................................................................................. 12
Préservation de la biodiversité ................................................................................................ 15
NOTIONS D'ÉCOLOGIE ..................................................................................................................... 21
Écologie :................................................................................................................................. 21
Écologie des écosystèmes...................................................................................................... 21
Écologie de populations .......................................................................................................... 21
Écosystème............................................................................................................................. 21
Stabilité..............................................................................................................................................22
Résilience..........................................................................................................................................22
Producteurs .......................................................................................................................................24
Consommateurs ................................................................................................................................24
Production nette ................................................................................................................................25
Chaîne alimentaire ............................................................................................................................25
Niveau trophique ...............................................................................................................................25
Implications directes des principes d'écologie dans les maladies animales .....................................26
RÉGULATION DES POPULATIONS ...................................................................................................... 26
Modèle "bottom-up" ................................................................................................................. 26
Modèle "top-down" .................................................................................................................. 27
ALTERATION DE L'ENVIRONNEMENT PAR L'HOMME ............................................................................ 29
Surface terrestre...................................................................................................................... 29
Pathologie de la faune 2001
Martineau
Daniel
Océans.................................................................................................................................... 29
Azote ....................................................................................................................................... 30
Carbone .................................................................................................................................. 30
Effet de serre..................................................................................................................................... 31
Niveau des mers et réchauffement global. ................................................................................... 32
Réchauffement global et Canada. ................................................................................................ 33
Eau.......................................................................................................................................... 33
Pollution .................................................................................................................................. 35
Composés à base de chlore ............................................................................................................. 35
Effets oestrogéniques des produits à base de chlore .................................................................. 36
Autres effets des composés à base de chlore ............................................................................. 37
Effets immunodépresseurs des polluants .........................................................................................37
Effets cancérigènes des polluants .................................................................................................... 37
Mutations ...................................................................................................................................... 37
Autres mécanismes de carcinogenèse ........................................................................................ 40
Pluies acides ..................................................................................................................................... 40
Trou dans la couche d’ozone ............................................................................................................ 40
Mercure ............................................................................................................................................. 40
Déversements d'huile........................................................................................................................ 41
Déversements "opérationnels" ..................................................................................................... 41
Déversements majeurs accidentels ............................................................................................. 42
Prévention .................................................................................................................................... 42
Inspection ................................................................................................................................ 42
Effets des déversements d'huile................................................................................................... 42
Nettoyage ..................................................................................................................................... 43
Un cas typique de déversement: l'Exxon Valdez, Prince William Sound, Alaska......................... 43
Impact sur les animaux............................................................................................................ 43
Loutres ................................................................................................................................ 43
Phoques.............................................................................................................................. 44
Orques épaulards ...............................................................................................................44
Oiseaux............................................................................................................................... 45
Poissons ............................................................................................................................. 45
Moules ................................................................................................................................ 45
Humains.............................................................................................................................. 45
Conclusions générales à tirer de l'Exxon................................................................................. 45
PROTECTION DES ESPECES MENACEES ........................................................................................... 46
Techniques de reproduction assistée ..................................................................................... 46
Insémination artificielle...................................................................................................................... 46
Fertilisation in vitro ............................................................................................................................ 46
Clonage................................................................................................................................... 46
Méthodes anticonceptionnelles............................................................................................... 47
Contrôle des pestes par des virus .......................................................................................... 47
Lapin et renard australiens................................................................................................................ 47
PCR......................................................................................................................................... 48
MALADIES DE LA FAUNE ............................................................................................................. 49
POURQUOI DIAGNOSTIQUER LES MALADIES DE LA FAUNE?................................................................. 49
MICROPARASITES .................................................................................................................... 50
MACROPARASITES ................................................................................................................... 50
ÉPIDEMIOLOGIE ............................................................................................................................. 50
Prévalence .............................................................................................................................. 51
Incidence................................................................................................................................. 51
Taux reproducteur (Ro)........................................................................................................... 51
IMPACT DES MALADIES SUR LA FAUNE .............................................................................................. 52
Le passé.................................................................................................................................. 52
Pathologie de la faune 2001
Martineau
Daniel
Le présent ............................................................................................................................... 53
Impact de la maladie et biologie de l'hôte ............................................................................... 53
Impact sur la reproduction....................................................................................................... 54
Récupération des carcasses ................................................................................................... 54
MALADIES EMERGENTES ................................................................................................................. 54
Définition.................................................................................................................................. 54
Pourquoi des maladies émergentes ?..................................................................................... 55
Changements environnementaux......................................................................................................55
Hôtes .................................................................................................................................................57
Translocation ................................................................................................................................57
Agent .................................................................................................................................................57
Production animale industrielle ....................................................................................................57
Xénotransplantations ....................................................................................................................57
Apparition de nouveaux agents infectieux ....................................................................................58
Problèmes causés par les maladies émergentes.................................................................... 59
Problèmes pratiques posés par la recherche sur les effets des maladies émergentes sur les
animaux domestiques. ............................................................................................................ 59
Maladies émergentes spécifiques ........................................................................................... 60
Prion ..................................................................................................................................................60
La maladie de la vache folle (Mad cow disease) et autres encéphalopathies spongiformes .......60
Virus ..................................................................................................................................................64
Hantavirus.....................................................................................................................................64
"Morbillivirus" équin ......................................................................................................................67
« Distemper » des lions ................................................................................................................68
Morbillivirus des mammifères marins ...........................................................................................68
Influenza chez le phoque..............................................................................................................70
Autres virus récents de mammifères marins ................................................................................72
Maladie hémorragique du chevreuil due à un adénovirus. ...........................................................72
Fièvre hémorragique du virus Ebola.............................................................................................72
Virus de l'immunodéficience humain ...........................................................................................73
Western Nile Virus........................................................................................................................73
Maladie de Lyme (Borreliose)............................................................................................................77
Amphibiens: un cas particulier
Chytridiomycose ...........................................................................................................................81
Iridovirus .......................................................................................................................................82
Bactéries ......................................................................................................................................77
GENETIQUE, ENVIRONNEMENT, MALADIES ET CONSERVATION ........................................................... 82
Molécules du complexe majeur d'histocompatibilité................................................................ 82
Guépard .................................................................................................................................. 83
Pumas (panthères) (couguars) de Floride. (Felis concolor coryi). .......................................... 84
Les loups de l’Île Royale.......................................................................................................... 85
Baleine à bosse....................................................................................................................... 86
AGENTS INFECTIEUX ....................................................................................................................... 86
Virus ........................................................................................................................................ 86
Rage ..................................................................................................................................................86
Bluetongue ........................................................................................................................................91
Maladie hémorragique épizootique du cerf (Hemorrhagic disease) ..................................................92
Distemper ..........................................................................................................................................93
Parvovirus..........................................................................................................................................93
Pseudorage .......................................................................................................................................95
Fièvre catarrhale maligne ..................................................................................................................95
Herpèsvirus bovin 1 (IBR) .................................................................................................................96
BVD ...................................................................................................................................................97
Parainfluenza-3 .................................................................................................................................97
Pathologie de la faune 2001
Martineau
Daniel
Maladie hémorragique du lapin ......................................................................................................... 97
Lésions prolifératives à Pox .............................................................................................................. 98
Ecthyma contagieux. .................................................................................................................... 98
Fibromatose du lapin.................................................................................................................... 98
Fibromatose de l'écureuil. ............................................................................................................ 98
Tumeurs induites par les papovavirus............................................................................................... 98
Fibromes et fibropapillomes des ongulés..................................................................................... 98
Papillomatose orale des carnivores ............................................................................................. 99
Rétrovirus: Lentivirus......................................................................................................................... 99
Bactéries .......................................................................................................................................... 99
Anthrax .............................................................................................................................................. 99
Maladie de Lyme (Borreliose) ......................................................................................................... 101
Brucellose ....................................................................................................................................... 105
Tuberculose .................................................................................................................................... 107
Paratuberculose .............................................................................................................................. 110
Leptospirose.................................................................................................................................... 110
Septicémies des rongeurs et des lagomorphes. ............................................................................. 113
Tularémie.................................................................................................................................... 113
Maladie de Tyzzer ...................................................................................................................... 115
Pseudotuberculose..................................................................................................................... 115
Peste .......................................................................................................................................... 116
Nécrobacillose................................................................................................................................. 116
Kérato-conjonctivite à Chlamydia.................................................................................................... 117
Complexe de la pneumonie chez le mouflon .................................................................................. 117
Pasteurella multocida...................................................................................................................... 117
Protozoaires................................................................................................................................... 118
Toxoplasmose ................................................................................................................................. 118
Giardiose......................................................................................................................................... 118
Sarcocystis sp ................................................................................................................................. 119
Fongi .............................................................................................................................................. 119
Trichophyton verrucosum................................................................................................................ 119
Adiaspiromycose............................................................................................................................. 119
Parasites ........................................................................................................................................ 119
Rappels ........................................................................................................................................... 119
Herbivores ....................................................................................................................................... 120
Généralités ................................................................................................................................. 120
Elaphostrongylus cervi rangiferi ............................................................................................ 123
Fascioloides magna............................................................................................................... 120
Gale sarcoptique, Cuterebra, Psoroptes, Oestres................................................................. 121
Orignal ........................................................................................................................................ 121
Parelaphostrongylus tenuis ................................................................................................... 122
Parelaphostrongylus andersoni ............................................................................................. 122
Fascioloides magna............................................................................................................... 123
Taenia krabbei (Cysticercus tarandi). .................................................................................... 123
Taenia hydatigena (Cysticercus tenuicollis) ......................................................................... 123
Echinococcus granulosus (kyste hydatique) ......................................................................... 123
Wehrdikmansia cervipedis..................................................................................................... 124
Dictyocaulus viviparus ........................................................................................................... 124
Dermacentor albipictus .......................................................................................................... 124
Caribou ....................................................................................................................................... 124
Cerf de Virginie........................................................................................................................... 124
Wapiti ......................................................................................................................................... 125
Lièvre d'Amérique....................................................................................................................... 125
Omnivores ....................................................................................................................................... 125
Moufette, raton-laveur ................................................................................................................ 125
Baylisascaris procyonis. ........................................................................................................ 125
Capilaria plica ........................................................................................................................ 126
Pathologie de la faune 2001
Martineau
Daniel
Ours noir .....................................................................................................................................126
Trichinella spiralis ..................................................................................................................126
Dirofilaria ursi .........................................................................................................................126
Diphyllobothrium ursi .............................................................................................................126
Carnivores .......................................................................................................................................126
Loups, coyotes,renards ..............................................................................................................126
Dirofilaria immitis (ver du cœur) .............................................................................................126
Ankylostomiase......................................................................................................................126
Crenosoma vulpis ..................................................................................................................126
Capillaria aerophila ................................................................................................................127
Mites ......................................................................................................................................127
Sarcoptes scabie...............................................................................................................127
Conditions variées................................................................................................................. 127
Malnutrition. .....................................................................................................................................127
Attrition dentaire ..............................................................................................................................128
Surcharge gastrique (acidose) ........................................................................................................128
Polioencéphalomalacie des ruminants............................................................................................128
Complexe abcès intracrânial-méningoencéphalite suppurée chez le chevreuil ..............................129
Ostéoarthropathie dégénérative ......................................................................................................129
Myopathie de capture ......................................................................................................................129
Traumas ..........................................................................................................................................130
Chevreuils...................................................................................................................................130
Loups et coyotes.........................................................................................................................130
ANNEXES ...................................................................................................................................... 131
ZOONOSES .................................................................................................................................. 131
LES MALADIES A CONNAITRE ......................................................................................................... 131
TAXONOMIE......... .......................................................................................................................... 132
RÉFÉRENCES.............................................................................................................................. 132
Générales ........................................................................................................................................132
Spécifiques ......................................................................................................................................132
ADRESSES UTILES....................................................................................................................... 133
ORGANISMES IMPLIQUES DANS LA PROTECTION DE LA NATURE ........................................................ 133
Africat: protection du guépard ............................................................................................... 133
Cheetah conservation Fund: protection du guépard. ............................................................ 133
Greenpeace........................................................................................................................... 133
Fonds mondial pour la nature (World Wildlife Fund) ............................................................. 133
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