PATHOLOGIE DE LA FAUNE PTM 4240 et de l'Environnement Daniel Martineau, DMV, M.Sc. Ph.D. Dipl., ACVP Professeur, Département de pathologie Faculté de Médecine Vétérinaire, Université de Montréal [email protected] Janvier 2001 Département de Microbiologie et Pathologie Faculté de Médecine Vétérinaire Université de Montréal Pathologie de la faune 2001 Martineau Daniel TABLES DES MATIÈRES RÔLES DES VÉTÉRINAIRES DANS LA FAUNE............................................................................. 2 GÉNÉRALITÉS .................................................................................................................................. 2 DIAGNOSTIC DE MALADIES ................................................................................................................ 2 ÉPIDÉMIOLOGIE................................................................................................................................ 2 DÉTERMINER DES MÉTHODES POUR PRÉVENIR, CONTRÔLER OU ÉLIMINER DES MALADIES IMPORTANTES CHEZ LA FAUNE ................................................................................................................................ 2 AMÉLIORER LES TECHNIQUES DE CAPTURE, LA MÉDECINE ET L'ANESTHÉSIE ......................................... 3 RÉHABILITATION ............................................................................................................................... 3 PRÉSERVER LES ESPÈCES MENACÉES ............................................................................................... 3 TOXICOLOGIE ET TOXICOLOGIE ENVIRONNEMENTALE .......................................................................... 4 1,30 BIODIVERSITÉ ............................................................................................................................. 4 INTRODUCTION................................................................................................................................. 4 Principes de base...................................................................................................................... 4 Variété: ................................................................................................................................................4 Abondance relative :............................................................................................................................4 DES NOMBRES... .............................................................................................................................. 4 ORIGINE DE LA BIODIVERSITÉ ............................................................................................................ 5 ÉVOLUTION, SÉLECTION NATURELLE, GÉNÉTIQUE, ENVIRONNEMENT ET BIODIVERSITÉ .......................... 8 Paléontologie............................................................................................................................. 8 Évolution et sélection ................................................................................................................ 9 Génétique et environnement ................................................................................................... 10 Importance de la biodiversité .................................................................................................. 12 Préservation de la biodiversité ................................................................................................ 15 NOTIONS D'ÉCOLOGIE ..................................................................................................................... 21 Écologie :................................................................................................................................. 21 Écologie des écosystèmes...................................................................................................... 21 Écologie de populations .......................................................................................................... 21 Écosystème............................................................................................................................. 21 Stabilité..............................................................................................................................................22 Résilience..........................................................................................................................................22 Producteurs .......................................................................................................................................24 Consommateurs ................................................................................................................................24 Production nette ................................................................................................................................25 Chaîne alimentaire ............................................................................................................................25 Niveau trophique ...............................................................................................................................25 Implications directes des principes d'écologie dans les maladies animales .....................................26 RÉGULATION DES POPULATIONS ...................................................................................................... 26 Modèle "bottom-up" ................................................................................................................. 26 Modèle "top-down" .................................................................................................................. 27 ALTERATION DE L'ENVIRONNEMENT PAR L'HOMME ............................................................................ 29 Surface terrestre...................................................................................................................... 29 Pathologie de la faune 2001 Martineau Daniel Océans.................................................................................................................................... 29 Azote ....................................................................................................................................... 30 Carbone .................................................................................................................................. 30 Effet de serre..................................................................................................................................... 31 Niveau des mers et réchauffement global. ................................................................................... 32 Réchauffement global et Canada. ................................................................................................ 33 Eau.......................................................................................................................................... 33 Pollution .................................................................................................................................. 35 Composés à base de chlore ............................................................................................................. 35 Effets oestrogéniques des produits à base de chlore .................................................................. 36 Autres effets des composés à base de chlore ............................................................................. 37 Effets immunodépresseurs des polluants .........................................................................................37 Effets cancérigènes des polluants .................................................................................................... 37 Mutations ...................................................................................................................................... 37 Autres mécanismes de carcinogenèse ........................................................................................ 40 Pluies acides ..................................................................................................................................... 40 Trou dans la couche d’ozone ............................................................................................................ 40 Mercure ............................................................................................................................................. 40 Déversements d'huile........................................................................................................................ 41 Déversements "opérationnels" ..................................................................................................... 41 Déversements majeurs accidentels ............................................................................................. 42 Prévention .................................................................................................................................... 42 Inspection ................................................................................................................................ 42 Effets des déversements d'huile................................................................................................... 42 Nettoyage ..................................................................................................................................... 43 Un cas typique de déversement: l'Exxon Valdez, Prince William Sound, Alaska......................... 43 Impact sur les animaux............................................................................................................ 43 Loutres ................................................................................................................................ 43 Phoques.............................................................................................................................. 44 Orques épaulards ...............................................................................................................44 Oiseaux............................................................................................................................... 45 Poissons ............................................................................................................................. 45 Moules ................................................................................................................................ 45 Humains.............................................................................................................................. 45 Conclusions générales à tirer de l'Exxon................................................................................. 45 PROTECTION DES ESPECES MENACEES ........................................................................................... 46 Techniques de reproduction assistée ..................................................................................... 46 Insémination artificielle...................................................................................................................... 46 Fertilisation in vitro ............................................................................................................................ 46 Clonage................................................................................................................................... 46 Méthodes anticonceptionnelles............................................................................................... 47 Contrôle des pestes par des virus .......................................................................................... 47 Lapin et renard australiens................................................................................................................ 47 PCR......................................................................................................................................... 48 MALADIES DE LA FAUNE ............................................................................................................. 49 POURQUOI DIAGNOSTIQUER LES MALADIES DE LA FAUNE?................................................................. 49 MICROPARASITES .................................................................................................................... 50 MACROPARASITES ................................................................................................................... 50 ÉPIDEMIOLOGIE ............................................................................................................................. 50 Prévalence .............................................................................................................................. 51 Incidence................................................................................................................................. 51 Taux reproducteur (Ro)........................................................................................................... 51 IMPACT DES MALADIES SUR LA FAUNE .............................................................................................. 52 Le passé.................................................................................................................................. 52 Pathologie de la faune 2001 Martineau Daniel Le présent ............................................................................................................................... 53 Impact de la maladie et biologie de l'hôte ............................................................................... 53 Impact sur la reproduction....................................................................................................... 54 Récupération des carcasses ................................................................................................... 54 MALADIES EMERGENTES ................................................................................................................. 54 Définition.................................................................................................................................. 54 Pourquoi des maladies émergentes ?..................................................................................... 55 Changements environnementaux......................................................................................................55 Hôtes .................................................................................................................................................57 Translocation ................................................................................................................................57 Agent .................................................................................................................................................57 Production animale industrielle ....................................................................................................57 Xénotransplantations ....................................................................................................................57 Apparition de nouveaux agents infectieux ....................................................................................58 Problèmes causés par les maladies émergentes.................................................................... 59 Problèmes pratiques posés par la recherche sur les effets des maladies émergentes sur les animaux domestiques. ............................................................................................................ 59 Maladies émergentes spécifiques ........................................................................................... 60 Prion ..................................................................................................................................................60 La maladie de la vache folle (Mad cow disease) et autres encéphalopathies spongiformes .......60 Virus ..................................................................................................................................................64 Hantavirus.....................................................................................................................................64 "Morbillivirus" équin ......................................................................................................................67 « Distemper » des lions ................................................................................................................68 Morbillivirus des mammifères marins ...........................................................................................68 Influenza chez le phoque..............................................................................................................70 Autres virus récents de mammifères marins ................................................................................72 Maladie hémorragique du chevreuil due à un adénovirus. ...........................................................72 Fièvre hémorragique du virus Ebola.............................................................................................72 Virus de l'immunodéficience humain ...........................................................................................73 Western Nile Virus........................................................................................................................73 Maladie de Lyme (Borreliose)............................................................................................................77 Amphibiens: un cas particulier Chytridiomycose ...........................................................................................................................81 Iridovirus .......................................................................................................................................82 Bactéries ......................................................................................................................................77 GENETIQUE, ENVIRONNEMENT, MALADIES ET CONSERVATION ........................................................... 82 Molécules du complexe majeur d'histocompatibilité................................................................ 82 Guépard .................................................................................................................................. 83 Pumas (panthères) (couguars) de Floride. (Felis concolor coryi). .......................................... 84 Les loups de l’Île Royale.......................................................................................................... 85 Baleine à bosse....................................................................................................................... 86 AGENTS INFECTIEUX ....................................................................................................................... 86 Virus ........................................................................................................................................ 86 Rage ..................................................................................................................................................86 Bluetongue ........................................................................................................................................91 Maladie hémorragique épizootique du cerf (Hemorrhagic disease) ..................................................92 Distemper ..........................................................................................................................................93 Parvovirus..........................................................................................................................................93 Pseudorage .......................................................................................................................................95 Fièvre catarrhale maligne ..................................................................................................................95 Herpèsvirus bovin 1 (IBR) .................................................................................................................96 BVD ...................................................................................................................................................97 Parainfluenza-3 .................................................................................................................................97 Pathologie de la faune 2001 Martineau Daniel Maladie hémorragique du lapin ......................................................................................................... 97 Lésions prolifératives à Pox .............................................................................................................. 98 Ecthyma contagieux. .................................................................................................................... 98 Fibromatose du lapin.................................................................................................................... 98 Fibromatose de l'écureuil. ............................................................................................................ 98 Tumeurs induites par les papovavirus............................................................................................... 98 Fibromes et fibropapillomes des ongulés..................................................................................... 98 Papillomatose orale des carnivores ............................................................................................. 99 Rétrovirus: Lentivirus......................................................................................................................... 99 Bactéries .......................................................................................................................................... 99 Anthrax .............................................................................................................................................. 99 Maladie de Lyme (Borreliose) ......................................................................................................... 101 Brucellose ....................................................................................................................................... 105 Tuberculose .................................................................................................................................... 107 Paratuberculose .............................................................................................................................. 110 Leptospirose.................................................................................................................................... 110 Septicémies des rongeurs et des lagomorphes. ............................................................................. 113 Tularémie.................................................................................................................................... 113 Maladie de Tyzzer ...................................................................................................................... 115 Pseudotuberculose..................................................................................................................... 115 Peste .......................................................................................................................................... 116 Nécrobacillose................................................................................................................................. 116 Kérato-conjonctivite à Chlamydia.................................................................................................... 117 Complexe de la pneumonie chez le mouflon .................................................................................. 117 Pasteurella multocida...................................................................................................................... 117 Protozoaires................................................................................................................................... 118 Toxoplasmose ................................................................................................................................. 118 Giardiose......................................................................................................................................... 118 Sarcocystis sp ................................................................................................................................. 119 Fongi .............................................................................................................................................. 119 Trichophyton verrucosum................................................................................................................ 119 Adiaspiromycose............................................................................................................................. 119 Parasites ........................................................................................................................................ 119 Rappels ........................................................................................................................................... 119 Herbivores ....................................................................................................................................... 120 Généralités ................................................................................................................................. 120 Elaphostrongylus cervi rangiferi ............................................................................................ 123 Fascioloides magna............................................................................................................... 120 Gale sarcoptique, Cuterebra, Psoroptes, Oestres................................................................. 121 Orignal ........................................................................................................................................ 121 Parelaphostrongylus tenuis ................................................................................................... 122 Parelaphostrongylus andersoni ............................................................................................. 122 Fascioloides magna............................................................................................................... 123 Taenia krabbei (Cysticercus tarandi). .................................................................................... 123 Taenia hydatigena (Cysticercus tenuicollis) ......................................................................... 123 Echinococcus granulosus (kyste hydatique) ......................................................................... 123 Wehrdikmansia cervipedis..................................................................................................... 124 Dictyocaulus viviparus ........................................................................................................... 124 Dermacentor albipictus .......................................................................................................... 124 Caribou ....................................................................................................................................... 124 Cerf de Virginie........................................................................................................................... 124 Wapiti ......................................................................................................................................... 125 Lièvre d'Amérique....................................................................................................................... 125 Omnivores ....................................................................................................................................... 125 Moufette, raton-laveur ................................................................................................................ 125 Baylisascaris procyonis. ........................................................................................................ 125 Capilaria plica ........................................................................................................................ 126 Pathologie de la faune 2001 Martineau Daniel Ours noir .....................................................................................................................................126 Trichinella spiralis ..................................................................................................................126 Dirofilaria ursi .........................................................................................................................126 Diphyllobothrium ursi .............................................................................................................126 Carnivores .......................................................................................................................................126 Loups, coyotes,renards ..............................................................................................................126 Dirofilaria immitis (ver du cœur) .............................................................................................126 Ankylostomiase......................................................................................................................126 Crenosoma vulpis ..................................................................................................................126 Capillaria aerophila ................................................................................................................127 Mites ......................................................................................................................................127 Sarcoptes scabie...............................................................................................................127 Conditions variées................................................................................................................. 127 Malnutrition. .....................................................................................................................................127 Attrition dentaire ..............................................................................................................................128 Surcharge gastrique (acidose) ........................................................................................................128 Polioencéphalomalacie des ruminants............................................................................................128 Complexe abcès intracrânial-méningoencéphalite suppurée chez le chevreuil ..............................129 Ostéoarthropathie dégénérative ......................................................................................................129 Myopathie de capture ......................................................................................................................129 Traumas ..........................................................................................................................................130 Chevreuils...................................................................................................................................130 Loups et coyotes.........................................................................................................................130 ANNEXES ...................................................................................................................................... 131 ZOONOSES .................................................................................................................................. 131 LES MALADIES A CONNAITRE ......................................................................................................... 131 TAXONOMIE......... .......................................................................................................................... 132 RÉFÉRENCES.............................................................................................................................. 132 Générales ........................................................................................................................................132 Spécifiques ......................................................................................................................................132 ADRESSES UTILES....................................................................................................................... 133 ORGANISMES IMPLIQUES DANS LA PROTECTION DE LA NATURE ........................................................ 133 Africat: protection du guépard ............................................................................................... 133 Cheetah conservation Fund: protection du guépard. ............................................................ 133 Greenpeace........................................................................................................................... 133 Fonds mondial pour la nature (World Wildlife Fund) ............................................................. 133