v TABLES DES MATIÈRES - Faculté de médecine vétérinaire

Pathologie de la faune 2003
Daniel Martineau
TABLES DES MATIÈRES
1. RÔLES DES VÉTÉRINAIRES DANS LA FAUNE...................................................................................8
1.1 GÉNÉRALITÉS .......................................................................................................................................8
1.2 DIAGNOSTIC DE MALADIES .....................................................................................................................8
1.3 ÉPIDÉMIOLOGIE ....................................................................................................................................8
1.4 METTRE AU POINT DES MÉTHODES POUR PRÉVENIR, CONTRÔLER OU ÉLIMINER DES MALADIES IMPORTANTES
CHEZ LA FAUNE ...........................................................................................................................................8
1.5 AMÉLIORER LES TECHNIQUES DE CAPTURE, LA MÉDECINE ET L'ANESTHÉSIE .............................................9
1.6 RÉHABILITATION DE LA FAUNE ...............................................................................................................9
1.7 PRÉSERVER LES ESPÈCES MENACÉES ...................................................................................................9
1.8 TOXICOLOGIE ET TOXICOLOGIE ENVIRONNEMENTALE ............................................................................10
2. BIODIVERSITÉ1,30 ..................................................................................................................................10
2.1 INTRODUCTION ...................................................................................................................................10
2.2 PRINCIPES DE BASE ............................................................................................................................10
2.2.1 Variété.......................................................................................................................................10
2.2.2 Abondance relative : Nombre d'individus appartenant à chaque type. .....................................10
2.2.3 Des nombres.............................................................................................................................10
2.3 ORIGINE DE LA BIODIVERSITÉ ..............................................................................................................12
2.3.1 La première cellule....................................................................................................................12
2.3.2 Origine de la vie ........................................................................................................................12
Conditions primitives, l'anaérobie ................................................................................................................. 12
2.3.3 La libération d'oxygène dans l'atmosphère ...............................................................................13
2.3.4 L'avantage d'utiliser de l'oxygène .............................................................................................13
2.3.5 Évolution des unicellulaires en multicellulaires .........................................................................14
2.4 ÉVOLUTION, SÉLECTION NATURELLE, GÉNÉTIQUE, ENVIRONNEMENT ET BIODIVERSITÉ ............................15
2.4.1 Paléontologie ............................................................................................................................15
2.4.2 Génome humain et vie sur terre................................................................................................15
2.4.3 Évolution et sélection ................................................................................................................16
2.4.4 Génétique et environnement.....................................................................................................17
2.5 IMPORTANCE DE LA BIODIVERSITÉ ........................................................................................................18
2.6 POURQUOI LA BIODIVERSITÉ S'AMENUISE-T-ELLE ? ...............................................................................19
2.6.1 Perte d'habitat ...........................................................................................................................19
2.6.2 Introduction d'espèces exotiques, transgéniques ou d'élevage ................................................21
2.6.3 Destruction des espèces indigènes ..........................................................................................22
Commerce d'animaux exotiques .................................................................................................................. 22
Poissons .................................................................................................................................................. 22
Oiseaux ................................................................................................................................................... 23
Reptiles ................................................................................................................................................... 23
Politique et Préservation ....................................................................................................................24
2.7 PRÉSERVATION DE LA BIODIVERSITÉ ....................................................................................................24
2.7.1 Canada......................................................................................................................................24
2.7.2 Traité de Rio..............................................................................................................................29
2.7.3 Globe.........................................................................................................................................29
3. NOTIONS D'ÉCOLOGIE ........................................................................................................................29
3.1 ÉCOLOGIE ..........................................................................................................................................29
3.2 ÉCOLOGIE DES ÉCOSYSTÈMES ............................................................................................................30
3.3 ÉCOLOGIE DE POPULATIONS ................................................................................................................30
3.4 ÉCOSYSTÈME .....................................................................................................................................30
3.4.1 Stabilité .....................................................................................................................................31
3.4.2 Résilience .................................................................................................................................31
3.4.3 Productivité ...............................................................................................................................34
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3.4.4 Producteurs...............................................................................................................................34
3.4.5 Consommateurs........................................................................................................................34
3.4.6 Production nette ........................................................................................................................34
3.4.7 Chaîne alimentaire ....................................................................................................................34
3.4.8 Niveau trophique .......................................................................................................................35
3.4.9 Interdépendance entre écosystèmes ........................................................................................35
3.5 IMPLICATIONS DIRECTES DES PRINCIPES D'ÉCOLOGIE............................................................................36
3.6 RÉGULATION DES POPULATIONS ..........................................................................................................36
3.6.1 Modèle "bottom-up"...................................................................................................................36
3.6.2 Modèle "top-down" ....................................................................................................................37
4. ALTÉRATION DE L'ENVIRONNEMENT PAR L'HOMME ....................................................................38
4.1 SURFACE TERRESTRE .........................................................................................................................38
4.2 OCÉANS .............................................................................................................................................38
4.3 AZOTE ...............................................................................................................................................39
4.4 CARBONE ...........................................................................................................................................40
Surproduction de carbone..................................................................................................................40
Effet de serre................................................................................................................................................ 41
Réchauffement global et vie marine ........................................................................................................ 41
Niveau des mers et réchauffement global ............................................................................................... 41
Réchauffement global et Canada ............................................................................................................ 42
Stopper le réchauffement global.............................................................................................................. 42
4.5 EAU ...................................................................................................................................................43
Grands Lacs ................................................................................................................................................. 44
4.6 POLLUTION .........................................................................................................................................45
4.6.1 Composés à base de chlore .....................................................................................................46
Bélugas et composés organochlorés ........................................................................................................... 46
Effets oestrogéniques des produits à base de chlore................................................................................... 47
Autres effets des composés à base de chlore.............................................................................................. 48
4.6.2 Effets immunodépresseurs des polluants .................................................................................48
4.6.3 Effets cancérigènes des polluants ............................................................................................49
Mutations...................................................................................................................................................... 49
Hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP) ........................................................................................ 49
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Composés mutagènes, Belugas, cancer et HAPs.......................................................................... 49
Bélugas du Saint-Laurent ................................................................................................................... 50
Examens post-mortem ................................................................................................................... 51
Cancer ........................................................................................................................................... 51
Les tumeurs de poissons, indicatrices de la contamination des sédiments par les HAP ......................... 52
Autres mécanismes de carcinogenèse......................................................................................................... 53
4.6.4 Pluies acides .............................................................................................................................53
4.6.5 Trou dans la couche d’ozone ....................................................................................................54
4.6.6 Métaux lourds............................................................................................................................54
Mercure ........................................................................................................................................................ 54
4.6.7 Déversements d'huile................................................................................................................55
Déversements "opérationnels" ..................................................................................................................... 55
Déversements majeurs accidentels.............................................................................................................. 55
Prévention .................................................................................................................................................... 56
Inspection ................................................................................................................................................ 56
Effets des déversements d'huile................................................................................................................... 56
Nettoyage ..................................................................................................................................................... 56
Un cas typique de déversement: l'Exxon Valdez, Prince William Sound, Alaska ......................................... 56
Impact sur les animaux............................................................................................................................ 56
Loutres:............................................................................................................................................... 56
Phoques8 ............................................................................................................................................ 58
Orques épaulards ............................................................................................................................... 58
Oiseaux............................................................................................................................................... 58
Poissons ............................................................................................................................................. 58
Moules ................................................................................................................................................ 58
Humains.............................................................................................................................................. 59
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Conclusions générales à tirer de l'Exxon ................................................................................................. 59
5. PROTECTION DES ESPÈCES MENACÉES AUTREMENT QUE PAR LA PROTECTION D'HABITAT
....................................................................................................................................................................59
5.1 TECHNIQUES DE REPRODUCTION ASSISTÉE ..........................................................................................60
5.1.1 Insémination artificielle..............................................................................................................60
5.1.2 Fertilisation in vitro ....................................................................................................................60
5.1.3 Clonage.....................................................................................................................................60
5.1.4 Méthodes anticonceptionnelles.................................................................................................61
5.2 CONTRÔLE DES PESTES PAR DES VIRUS ...............................................................................................61
5.2.1 Lapin et renard australiens........................................................................................................61
5.2.3 Maladie hémorragique virale : calicivirus. .................................................................................61
5.3 POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR).................................................................................................62
5.3.1 Baleines ....................................................................................................................................62
5.3.2 Études génétiques des animaux sauvages ..............................................................................62
6. MALADIES DE LA FAUNE....................................................................................................................63
6.1 POURQUOI DIAGNOSTIQUER LES MALADIES DE LA FAUNE?.....................................................................63
6.2 MICROPARASITES ...............................................................................................................................64
6.2.1 Transmission.............................................................................................................................64
6.2.2 Virulence ...................................................................................................................................64
6.3 MACROPARASITES ..............................................................................................................................64
6.3.1 Transmission.............................................................................................................................64
6.3.2 Virulence ...................................................................................................................................64
6.3.3 Sévérité de l'infection ................................................................................................................64
6.4 ÉPIDÉMIOLOGIE ..................................................................................................................................65
6.4.1 Prévalence ................................................................................................................................65
6.4.2 Incidence...................................................................................................................................65
6.4.3 Taux reproducteur (Ro).............................................................................................................65
6.5 IMPACT DES MALADIES SUR LA FAUNE ..................................................................................................66
6.5.1 Le passé....................................................................................................................................66
6.5.2 Le présent .................................................................................................................................67
6.5.3 Impact de la maladie et biologie de l'hôte .................................................................................67
6.5.4 Impact sur la reproduction.........................................................................................................68
6.5.5 Récupération des carcasses.....................................................................................................68
6.6 MALADIES ÉMERGENTES .....................................................................................................................68
6.6.1 Définition ...................................................................................................................................68
6.6.2 Causes ......................................................................................................................................69
1. Changements environnementaux............................................................................................................. 69
Oscillations naturelles dans le climat ....................................................................................................... 69
Réchauffement global.............................................................................................................................. 69
Bioterrorisme ........................................................................................................................................... 70
Changements environnementaux spécifiques ......................................................................................... 70
Irrigation.............................................................................................................................................. 70
Plastique, pneus ................................................................................................................................. 70
Transfusions sanguines ...................................................................................................................... 70
Production animale industrielle................................................................................................................ 70
Maladie de la vache folle .................................................................................................................... 70
Xénotransplantations ............................................................................................................................... 71
2. Agents infectieux ...................................................................................................................................... 71
Apparition de nouveaux agents infectieux ............................................................................................... 71
Génétique ........................................................................................................................................... 71
Interaction entre les agents infectieux et changements environnementaux............................................. 72
"Débordement" d'agents pathogènes d'animaux domestiques dans la faune..................................... 72
"Débordement" d'agents pathogènes de la faune chez l'humain ........................................................ 72
Arbovirus........................................................................................................................................ 72
Arénavirus...................................................................................................................................... 72
3. Hôtes........................................................................................................................................................ 72
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6.6.3 Problèmes causés par les maladies émergentes .....................................................................73
6.6.4 Problèmes pratiques posés en recherche sur les maladies émergentes chez les animaux
domestiques.......................................................................................................................................73
6.6.5 Maladies émergentes spécifiques.............................................................................................73
Prion. La maladie de la vache folle (Mad cow disease) et autres encéphalopathies spongiformes.............. 73
Lésions. ................................................................................................................................................... 76
Signes cliniques....................................................................................................................................... 76
Espèces susceptibles. ............................................................................................................................. 76
Méthodes de diagnostic........................................................................................................................... 76
Traitement. .............................................................................................................................................. 76
Prévention, contrôle................................................................................................................................. 77
Historique de la maladie de la vache folle ............................................................................................... 77
Virus ............................................................................................................................................................. 77
Hantavirus ............................................................................................................................................... 77
"Morbillivirus" équin ................................................................................................................................. 80
« Distemper » des lions ........................................................................................................................... 81
« Distemper » des mammifères marins. Morbillivirus des mammifères marins ....................................... 81
Phoques.............................................................................................................................................. 81
Cétacés .............................................................................................................................................. 82
Influenza chez le phoque......................................................................................................................... 83
Maladie vésiculaire des otaries de Californie: {123} ................................................................................ 86
Autres virus récents de mammifères marins............................................................................................ 86
Contamination, virus, et phoque .............................................................................................................. 86
Maladie hémorragique du chevreuil due à un adénovirus. ...................................................................... 87
Fièvre hémorragique du virus Ebola ........................................................................................................ 87
Virus du syndrome de l'immunodéficience acquise (VIH) ........................................................................ 87
West Nile Virus (virus du Nil Occidental) ................................................................................................. 88
Bactéries ...................................................................................................................................................... 90
Maladie de Lyme (Borreliose).................................................................................................................. 90
Amphibiens et maladies émergentes ........................................................................................................... 95
Chytridiomycose ...................................................................................................................................... 95
Iridovirus .................................................................................................................................................. 95
6.7 GÉNÉTIQUE, ENVIRONNEMENT, MALADIES ET CONSERVATION ...............................................................96
6.7.1 Molécules du complexe majeur d'histocompatibilité .................................................................96
6.7.2 Guépard 3, 16, 37, 38, 48...................................................................................................................96
6.7.3 Pumas (panthères) (couguars) de Floride. (Felis concolor coryi). ............................................98
6.7.4 Loups de l’Isle Royale ...............................................................................................................99
6.7.5 Baleine à bosse ........................................................................................................................99
6.8 AGENTS INFECTIEUX ...........................................................................................................................99
6.8.1 VIRUS .......................................................................................................................................99
Rage............................................................................................................................................................. 99
Bluetongue ................................................................................................................................................. 104
Maladie hémorragique épizootique du cerf (Hemorrhagic disease)............................................................ 105
Distemper................................................................................................................................................... 106
Encéphalite équine de l'Ouest ............................................................................................................... 106
Encéphalite équine de l'Est ................................................................................................................... 107
Encéphalite de Saint Louis .................................................................................................................... 107
Virus de Powassan ................................................................................................................................ 107
Snowshoe Hare Virus ............................................................................................................................ 107
Jamestown Canyon virus....................................................................................................................... 107
Colorado Tick fever virus ....................................................................................................................... 107
Parvovirus .................................................................................................................................................. 108
Pseudorage ................................................................................................................................................ 108
Fièvre catarrhale maligne ........................................................................................................................... 108
Agents ................................................................................................................................................... 108
Forme Africaine ..................................................................................................................................... 108
Forme des moutons............................................................................................................................... 109
Herpèsvirus bovin 1 (IBR) .......................................................................................................................... 109
BVD-MD ..................................................................................................................................................... 110
Parainfluenza-3 .......................................................................................................................................... 110
Maladie hémorragique du lapin .................................................................................................................. 110
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Lésions prolifératives à Pox........................................................................................................................ 110
Ecthyma contagieux. ............................................................................................................................. 110
Fibromatose du lapin ............................................................................................................................. 110
Fibromatose de l'écureuil....................................................................................................................... 111
Tumeurs induites par les papovavirus........................................................................................................ 111
Fibromes et fibropapillomes des ongulés. ............................................................................................. 111
Papillomatose orale des carnivores ....................................................................................................... 111
Lentivirus.................................................................................................................................................... 111
6.8.2 BACTÉRIES............................................................................................................................111
Anthrax (Maladie à déclaration obligatoire) ................................................................................................ 111
Helicobacter ............................................................................................................................................... 113
Maladie de Lyme (Borreliose)..................................................................................................................... 113
Brucellose .................................................................................................................................................. 113
Tuberculose ............................................................................................................................................... 115
Paratuberculose ......................................................................................................................................... 119
Leptospirose............................................................................................................................................... 119
Septicémies des rongeurs et des lagomorphes.......................................................................................... 121
Tularémie .............................................................................................................................................. 121
Maladie de Tyzzer ................................................................................................................................. 123
Pseudotuberculose................................................................................................................................ 123
Peste ..................................................................................................................................................... 124
Nécrobacillose ....................................................................................................................................... 124
Kérato-conjonctivite à Chlamydia .......................................................................................................... 124
Complexe de la pneumonie chez le mouflon ......................................................................................... 125
Pasteurella multocida ............................................................................................................................ 125
6.8.3 PROTOZOAIRES ...................................................................................................................125
Toxoplasmose ............................................................................................................................................ 125
Giardiase.................................................................................................................................................... 125
Cryptosposridium. ...................................................................................................................................... 126
Sarcocystis sp: ........................................................................................................................................... 126
Anaplasmose.............................................................................................................................................. 126
6.8.4 FONGI.....................................................................................................................................126
Trichophyton verrucosum ........................................................................................................................... 126
Adiaspiromycose ........................................................................................................................................ 127
6.8.5 PARASITES............................................................................................................................127
Rappels ...................................................................................................................................................... 127
Trématodes. .......................................................................................................................................... 127
Définitions.............................................................................................................................................. 127
Herbivores .................................................................................................................................................. 128
Généralités ............................................................................................................................................ 128
Fascioloides magna .......................................................................................................................... 128
Gale sarcoptique, Cuterebra, Psoroptes, Oestres ............................................................................ 128
Orignal................................................................................................................................................... 129
Parelaphostrongylus tenuis............................................................................................................... 129
Parelaphostrongylus andersoni......................................................................................................... 130
Elaphostrongylus rangiferi ................................................................................................................ 130
Fascioloides magna .......................................................................................................................... 131
Taenia krabbei (Cysticercus tarandi). ............................................................................................... 131
Taenia hydatigena (Cysticercus tenuicollis) ...................................................................................... 131
Echinococcus granulosus (kyste hydatique) ..................................................................................... 131
Wehrdikmansia cervipedis ................................................................................................................ 131
Dictyocaulus viviparus ...................................................................................................................... 131
Dermacentor albipictus ..................................................................................................................... 131
Caribou.................................................................................................................................................. 132
Cerf de Virginie...................................................................................................................................... 132
Wapiti .................................................................................................................................................... 132
Lièvre d'Amérique.................................................................................................................................. 132
Omnivores.................................................................................................................................................. 132
Moufette, raton-laveur ........................................................................................................................... 132
Baylisascaris procyonis..................................................................................................................... 132
Crenosoma sp .................................................................................................................................. 133
Capillaria plica .................................................................................................................................. 133
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Ours noir................................................................................................................................................ 133
Trichinella spiralis ............................................................................................................................. 133
Dirofilaria ursi.................................................................................................................................... 133
Diphyllobothrium ursi ........................................................................................................................ 134
Carnivores .................................................................................................................................................. 134
Loups, coyotes,renards ......................................................................................................................... 134
Dirofilaria immitis (ver du cœur)........................................................................................................ 134
Ankylostomiase................................................................................................................................. 134
Crenosoma vulpis ............................................................................................................................. 134
Capillaria aerophila ........................................................................................................................... 134
Mites ................................................................................................................................................. 134
Sarcoptes scabiei......................................................................................................................... 134
6.8.6 Conditions variées ..................................................................................................................135
Malnutrition................................................................................................................................................. 135
Attrition dentaire ......................................................................................................................................... 135
Surcharge gastrique (acidose) ................................................................................................................... 136
Polioencéphalomalacie des ruminants ....................................................................................................... 136
Complexe abcès intracrânial-méningoencéphalite suppurée chez le chevreuil.......................................... 136
Ostéoarthropathie dégénérative ................................................................................................................. 136
Myopathie de capture................................................................................................................................. 136
Traumas ..................................................................................................................................................... 137
Chevreuils.............................................................................................................................................. 137
Loups et coyotes ................................................................................................................................... 137
7. ANNEXES ............................................................................................................................................139
8. ZOONOSES .........................................................................................................................................139
9. MALADIES À CONNAÎTRE .................................................................................................................139
10. TAXONOMIE ......................................................................................................................................140
11. RÉFÉRENCES ...................................................................................................................................140
GÉNÉRALES ...........................................................................................................................................140
SPÉCIFIQUES..........................................................................................................................................140
12. ADRESSES UTILES ..........................................................................................................................141
ORGANISMES IMPLIQUÉS DANS LA PROTECTION DE LA NATURE ..................................................................143
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