Pierre Boudinot

Génomique des interactions
hôtes-pathogènes
P Boudinot
VIM INRA

Plan
•Qu’est ce qu’un système de défense ? Implications
génomiques et évolutives
•Gènes de l’immunité à travers les espèces et les génomes:
variations, convergence, homologie, diversité; immunité innée
et adaptative
•Un exemple d’étude de transcriptome : type I IFN, ISGs et
infection virale

Qu’est ce qu un système de défense ?
1. Barrières : peau et muqueuses
2. Récepteurs pour l’identification des infections, et des
agents infectieux
3. Système de signalisation a différentes échelles
4. Mécanismes effecteurs et destruction des agents
infectieux
5. Régulation et contrôle de ces mécanismes effecteurs
6. Retour à la normale et réparation des dégats
(cicatrisation..), résilience partielle du système et
mémoire immunitaire

Pressions de sélection et contraintes s’exerçant
sur les systèmes immunitaires
•Un système de défense doit éliminer rapidement et
efficacement les pathogènes
composants innés, constitutifs ou inductibles
•Il doit donner aux individus au sein de l espèce les
meilleures chances de survie dans des conditions
d’environnement souvent rapidement changeantes
Adaptations somatiques individuelles.
•Il doit être divers et flexible, et souvent régulé (up and
down) :
nombreuses solutions Innées et “adaptatives”: familles
multigeniques, nombreuses catégories moléculaires,
Tregulateurs …

Pressions de sélection et contraintes s’exerçant
sur les systèmes immunitaires
•Il doit être economique (relativement) i.e. doit être compatible avec
le nb de cellules et les ressources disponibles : adaptations
somatiques, usage combinatoire d’ elements. Transmission des
systemes adaptatifs comme des kits « do-it-yourself «
•Une mémoire peut servir: selection clonale et mémoire associée
(lymphocyte)
•Il ne doit pas réagir avec le soi: selection clonale (lymphocyte);
tolerance périphérique
•(Moduler tout cela selon l histoire naturelle de l’ organisme:
temperature, taille,durée de vie, taille de ponte , type de
developpement précoce etc )