Dysfonctionnement amylase. Corrigé. (en rouge, la production du candidat) On cherche à vérifier chez un patient si l’incapacité de la salive à hydrolyser l’amidon est la conséquence d’un dysfonctionnement de l’amylase salivaire du malheureux. Document 1 : une enzyme est une protéine fabriquée par un être vivant agissant comme catalyseur biologique. On appelle substrat toute molécule sur laquelle peut agir une enzyme pour accélérer sa transformation en produit : Enzyme Substrat produit La liaison entre l’enzyme et son substrat s’établit au niveau du site actif (zone particulière de l’enzyme, de forme complémentaire au substrat). Seuls certains acides aminés du site actif de l’enzyme assurent une liaison avec le substrat spécifique pour faciliter le déroulement de la réaction. Document 2 : l’amylase hydrolyse l’amidon en maltose, glucide constitué de deux glucoses. Etape 1 : Concevoir une stratégie pour résoudre une situation problème (durée maximale : 10 minutes) On se propose de comparer avec un logiciel de modélisation moléculaire (Rastop) le site actif d’une amylase saine avec son substrat (amidon) et le site actif d’une amylase non fonctionnelle avec ce même substrat. Pour déterminer si l’anomalie de l’amylase est due à une mutation, on se propose de comparer les gènes codant la synthèse d’amylase d’un sujet sain et d’un sujet atteint. (On utilisera pour cela le logiciel Anagène). Etape 2 : Mettre en œuvre un protocole de résolution pour obtenir des résultats exploitables RASTOP : traiter les modèles moléculaires de l’amylase salivaire liée à son substrat afin de mettre en valeur : l’enzyme ;le substrat ;les acides aminés du site actif ; la ou les différences. Amylase normale Amylase déficiente : On voit qu’un acide aminé du lien enzyme-substrat a été substitué par un autre sur l’amylase du patient : aa n° 58, Ala au lieu de Trp. ANAGENE : Ouverture du fichier fichier «diabète.edi» : séquences d’acides aminés de l’amylase salivaire fonctionnelle et celle du patient. Puis comparaison simple. Etape 3 : Présenter les résultats pour les communiquer : Eh ben voilà ! Y’avait bien un problème ! Mutation ! Etape 4 : Exploiter les résultats obtenus pour répondre au problème : Le patient dont l’amylase est déficiente présente une anomalie génétique responsable de la présence d’alanine au lieu de tryptophane à l’acide aminé n° 58. Cette anomalie rend le site actif de l’amylase inopérant au niveau des acides aminés impliqués dans la liaison à l’amidon, empêchant son hydrolyse.