Présentation du logiciel EduAnatomist

Le logiciel EduAnatomist.
Les travaux de l’équipe
ACCES (Actualisation Continue des Connaissances des Enseignants en Sciences)
largement méconnus des enseignants de SVT. Pourtant, nombreux sont ceux qui connaissent
programme, lequel a par exemple contribué à diffuser le logiciel
Parmi les ressources et les outils proposés sur le nouveau site ACCES, on trouve notamment un logiciel permettant de visualis
images IRM anatomiques et fonctionnelles.
logiciel, dénommé EduAnatomist,
a reçu le soutien du Ministère de l’Éducation Nationale et du Ministère de l’Enseignement
Supérieur et de la Recherche.
Son intérêt pédagogique laisse présager de sa large diffusion au sein des établissements
d’enseignements secondaires.
Ce logiciel repose sur une banque d’images, baptisée
organism
es de recherche scientifique (CNRS, INSERM, etc.) et
de Neuropeda
sont gratuits à partir du site
télécharger EduAnatomist
puis d’interroger en lignes
Visualiser une IRM anatomique.
Le logiciel affiche
trois plans de coupes (transversale, sagittale et coro
droite de chaque plan, on change
la position de la coupe dans l’espace suivant un axe prédéfini. Un clic droit sur l’une des coupes,
entraîne immédiatement une visualisation du point de l’espac
ACCES (Actualisation Continue des Connaissances des Enseignants en Sciences)
largement méconnus des enseignants de SVT. Pourtant, nombreux sont ceux qui connaissent
Biotic
programme, lequel a par exemple contribué à diffuser le logiciel
Phylogène.
Parmi les ressources et les outils proposés sur le nouveau site ACCES, on trouve notamment un logiciel permettant de visualis
Fruit d’une collaboration entre le CEA, l’INRP et la société informatique
a reçu le soutien du Ministère de l’Éducation Nationale et du Ministère de l’Enseignement
Son intérêt pédagogique laisse présager de sa large diffusion au sein des établissements
Ce logiciel repose sur une banque d’images, baptisée
Neuropeda
, regroupant plus d’une centaine d’images issues de grands
es de recherche scientifique (CNRS, INSERM, etc.) et
qui continue de s’enrichir.
Les téléchargements d’
sont gratuits à partir du site
: http://acces.inrp.fr/acces/ressources/neurosciences
puis d’interroger en lignes
Neuropeda.
trois plans de coupes (transversale, sagittale et coro
nale) pour chaque IRM.
En faisant varier les curseurs situés à
la position de la coupe dans l’espace suivant un axe prédéfini. Un clic droit sur l’une des coupes,
entraîne immédiatement une visualisation du point de l’espac
e indiqué, dans les deux autres plans de coupes.
ACCES (Actualisation Continue des Connaissances des Enseignants en Sciences)
de l’INRP restent, hélas,
Biotic
, ancien site Internet de ce
Parmi les ressources et les outils proposés sur le nouveau site ACCES, on trouve notamment un logiciel permettant de visualis
er des
Fruit d’une collaboration entre le CEA, l’INRP et la société informatique
Pentila, ce
a reçu le soutien du Ministère de l’Éducation Nationale et du Ministère de l’Enseignement
Son intérêt pédagogique laisse présager de sa large diffusion au sein des établissements
, regroupant plus d’une centaine d’images issues de grands
Les téléchargements d’
EduAnatomist et
. On peut aussi se contenter de
En faisant varier les curseurs situés à
la position de la coupe dans l’espace suivant un axe prédéfini. Un clic droit sur l’une des coupes,
e indiqué, dans les deux autres plans de coupes.

Visualiser une IRM fonctionnelle.
EduAnatomist
permet également d’afficher une IRMf, par exemple dans le cadre de la vision de couleurs.
permet également d’afficher une IRMf, par exemple dans le cadre de la vision de couleurs.
permet également d’afficher une IRMf, par exemple dans le cadre de la vision de couleurs.

Les zones colorées signalent une différence statistique d’activité entre la condition OFF (repos) et la condition ON (vision
couleurs). L’étendue de ces zones illustre l’activité permanente et plus ou moins intense (bleu pour le minimum, rouge pour l
m
aximum) de notre encéphale. Localiser la région spécifiquement dévolue à la vision des couleurs implique de ne considérer que
voxels (unités de volume)
les plus activés dans
et le seuil inférieur fixé à la valeur correspondant à une différence statistique retenue pour une publication scientifique.
plus alors qu’à se déplacer dans les plans de coupes jusqu’à identifier la zone
stimulation qu'en condition témoin.
Un cas de neuroplasticité.
EduAnatomist offre une a
utre fonctionnalité remarquable, l’étude d’un cas de
présentant des crises d’épilepsie nombreuses et pharmacorésistantes depuis l’âge de cinq ans et six mois. Diverses analyses r
que ces crises sont provoquées par une activité anormale de neurones situés dans l’hémisphère cérébra
cheval sur les lobes frontal et temporal (on parlera de foyer épileptogène). L’enfant apprend à lire, à écrire et à parler, m
multiplication des crises perturbe son développement cognitif au point qu’un retard mental comme
décident alors, en accord avec la famille, d’opérer la fillette, désormais âgée de neuf ans, afin de retirer le foyer épilept
L’opération se traduit par une résorption des crises mais aussi par
Les zones colorées signalent une différence statistique d’activité entre la condition OFF (repos) et la condition ON (vision
couleurs). L’étendue de ces zones illustre l’activité permanente et plus ou moins intense (bleu pour le minimum, rouge pour l
aximum) de notre encéphale. Localiser la région spécifiquement dévolue à la vision des couleurs implique de ne considérer que
les plus activés dans
cette condition expérimentale. L
e seuil supérieur est donc maintenu à son maxi
et le seuil inférieur fixé à la valeur correspondant à une différence statistique retenue pour une publication scientifique.
plus alors qu’à se déplacer dans les plans de coupes jusqu’à identifier la zone
dont l'activité est statistiquement
utre fonctionnalité remarquable, l’étude d’un cas de
neuro
plasticité. Il s’agit
présentant des crises d’épilepsie nombreuses et pharmacorésistantes depuis l’âge de cinq ans et six mois. Diverses analyses r
que ces crises sont provoquées par une activité anormale de neurones situés dans l’hémisphère cérébra
cheval sur les lobes frontal et temporal (on parlera de foyer épileptogène). L’enfant apprend à lire, à écrire et à parler, m
multiplication des crises perturbe son développement cognitif au point qu’un retard mental comme
décident alors, en accord avec la famille, d’opérer la fillette, désormais âgée de neuf ans, afin de retirer le foyer épilept
L’opération se traduit par une résorption des crises mais aussi par
la perte du langage (aphasie) !
Les aires sensitives et associatives
Les zones colorées signalent une différence statistique d’activité entre la condition OFF (repos) et la condition ON (vision
de
couleurs). L’étendue de ces zones illustre l’activité permanente et plus ou moins intense (bleu pour le minimum, rouge pour l
e
aximum) de notre encéphale. Localiser la région spécifiquement dévolue à la vision des couleurs implique de ne considérer que
les
e seuil supérieur est donc maintenu à son maxi
mum
et le seuil inférieur fixé à la valeur correspondant à une différence statistique retenue pour une publication scientifique.
Il ne reste
dont l'activité est statistiquement
plus élevée lors de la
plasticité. Il s’agit
du cas d’une jeune fille
présentant des crises d’épilepsie nombreuses et pharmacorésistantes depuis l’âge de cinq ans et six mois. Diverses analyses r
évèlent
que ces crises sont provoquées par une activité anormale de neurones situés dans l’hémisphère cérébra
l gauche, plus exactement à
cheval sur les lobes frontal et temporal (on parlera de foyer épileptogène). L’enfant apprend à lire, à écrire et à parler, m
ais la
multiplication des crises perturbe son développement cognitif au point qu’un retard mental comme
nce à apparaître. Les médecins
décident alors, en accord avec la famille, d’opérer la fillette, désormais âgée de neuf ans, afin de retirer le foyer épilept
ogène.
Les aires sensitives et associatives

de l’audition, ainsi que les principales aires motrices ont pourtant été préservées. L’enfant entend et comprend toujours le langage
oral. Son raisonnement et son discernement ne sont pas altérés, aussi est-il pleinement conscient des mots qu’il souhaite énoncer.
Mais, bien qu’il soit encore capable de produire des sons, il s’avère impuissant à prononcer dans l’ordre les syllabes qui composent
les mots auxquels il pense. Cette perte de l’élocution est consécutive à l’ablation de l’aire de Broca, aussi appelée aire motrice du
langage et située dans le lobe frontal de l’hémisphère gauche. Le logiciel EduAnatomist offre l’opportunité d’afficher une IRM post-
opératoire de ce sujet, ce qui permet de déterminer précisément l’étendue de l’ablation chirurgicale.
Happy end, la petite fille retrouve progressivement l’usage de la parole, parvenant de nouveau à prononcer des phrases au bout d’un
an et demi. L’équipe médicale procède alors à une IRMf durant laquelle l’enfant alterne des phases de silence et d’élocution. Et le
résultat de l’expérience se trouve lui aussi dans la banque d’images du logiciel.
L’IRMf montre tout d’abord que la récupération fonctionnelle ne résulte pas d’une reconstruction cérébrale puisque la partie du
cerveau retirée au cours de l’opération ne s’est pas reformée. On constate ensuite que l’élocution repose désormais sur la mise en
activité d’une région corticale située dans l’hémisphère cérébral droit.
Les points forts du logiciel.
Ce logiciel permet d’aborder les notions de neurosciences au programme de première S et de première L. Sa prise en main s’avère
relativement aisée de sorte que les élèves peuvent rapidement être laissés en autonomie. En outre, les IRMf proposés permettent
d’élaborer sans difficultés un enseignement par problèmes scientifiques et ainsi d’articuler la majeure partie de la progression autour
d’une démarche hypothético-déductive. Par ailleurs, s’il est toujours possible de trouver des IRM et des IRMf dans des livres, des
revues ou sur Internet, peu d’entres elles possèdent la qualité de celles de la banque Neuropeda. Enfin, l’utilisation du logiciel

EduAnatomist répond fort opportunément aux instructions officielles qui nous enjoignent chaque jour un peu plus de recourir aux
TICE.
Pour l’heure, ce logiciel offre la possibilité :
- d’identifier les principales structures anatomiques cérébrales ;
- de cartographier certaines aires du cortex cérébral (somesthésie, motricité, vision, gustation, aires du langage) ainsi que leur
organisation anatomo-fonctionnelle (somatotopie, rétinotopie) ;
- de mettre en évidence la variabilité interindividuelle anatomique et fonctionnelle chez l’homme, par comparaison d'images
individuelles ;
- d’étudier un cas de neuroplasticité.
Le stage de formation continue.
Le Plan Académique de Formation 2010-2011 prévoit un stage de formation au logiciel EduAnatomist. S’il s’agira surtout de
découvrir et de s’exercer aux principales fonctionnalités du logiciel, ce stage donnera aussi l’occasion de (re)découvrir les principes
de l’IRM et de l’IRMf, de présenter des exemples de démarches pédagogiques éprouvées devant des élèves de 1
e
L et de 1
e
S, et de
réfléchir aux problèmes juridiques, éthiques, scientifiques, philosophiques et sociaux que posent l’utilisation des images des
neurosciences.
M. Cartier Julien
Professeur de SVT au lycée Carnot de Cannes
Membre de l’équipe ACCES-INRP Neurosciences de Marseille