THESE DE DOCTORAT Diversité Phénotypique et Moléculaire du

UNIVERSITE MOHAMMED V-AGDAL
FACULTE DES SCIENCES
RABAT
THESE DE DOCTORAT
Présentée par
Ibrahim KONATE
Discipline : Biologie
Spécialité : Biotechnologie et Biologie Moléculaire
Diversité Phénotypique et Moléculaire du Caroubier
(Ceratonia siliqua L.)
et des Bactéries Endophytes qui lui sont Associées
Soutenue le 14 Juillet 2007
Devant le jury :
Pr. Abdelkaim FILALI-MALTOUF
Professeur à la Faculté des Sciences de Rabat
Pr. El Bekkay BERRAHO
Professeur à la Faculté des Sciences de Rabat
Pr. Ahmed LAMARTI
Professeur à la Faculté des Sciences de Tétouan
Dr Mohamed ABOUROUH
Chef du Centre de Recherches Forestières (CRF)
Pr. Mustapha ARAHOU
Professeur à la Faculté des Sciences de Rabat
Examinateurs
Président
N° d’ordre: 2353

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A l’Etat marocain et particulièrement à Sa Majesté le Roi
Mohammed VI, que Dieu le protège, pour sa noble
politique du développement humain et de coopération Sud-
Sud dont bénéficie la jeunesse africaine sub-saharienne
pour y acquérir de bonnes formations universitaires et
professionnelles.
A l’Etat ivoirien et principalement au Ministère de
l’Enseignement Supérieur pour l’octroi d’une bourse
d’étude durant mes cinq années de Thèse.

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DEDICACES
Cette thèse est un Hommage à mon regretté père
El Haj KONATE Lassina
Il était un pilier solide et incontournable pour ma personne et mon parcours
estudiantin, qu’il se repose en paix du Dieu, amen !!!
Ma profonde reconnaissance à ma chère épouse pour son soutien sans faille, sa
grande indulgence, sa compréhension et surtout sa contribution dans le partage de
stress de la recherche et de la vie quotidienne de l’étranger.
Enfin, mes vifs remerciements à ma chère mère, à mon oncle KONATE Mamadou et
son ami COULIBALY Abdourahaman, à mes frères et sœurs, KONATE Broulaye, K.
Salia, K. Arna, K. Djamal dine, K. Aboubakar, K. Abasse, K. Mamadou, K. Brahim, K.
Sarata, K. Zakaria, pour leur soutien moral et financier.

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AVANT PROPOS
Les travaux présentés dans cette thèse ont été effectués au Laboratoire de Microbiologie et
Biologie Moléculaire (L.M.B.M.) de la Faculté des Sciences, Université Mohammed V- Agdal,
Rabat.
L’encadrement scientifique de ce travail a été assuré par Mr. El Bekkay BERRAHO,
Professeur de Microbiologie à la Faculté des sciences de Rabat. Je tiens vivement à lui
exprimer ma profonde reconnaissance et gratitude pour sa disponibilité, sa patience, sa
compréhension, ses qualités humaines et ses intérêts portés pour mon sujet de recherche.
Mes remerciements les plus chaleureux et fraternels au président du jury, le Professeur
Adbelkarim FILALI-MALTOUF, directeur de recherche et responsable du Laboratoire de
Microbiologie et Biologie Moléculaire (L.M.B.M.). Ses apports scientifiques et logistiques
ainsi que ses rapports humains dans le suivi et la réalisation de mes travaux de recherche
ont été d’une qualité supérieure et fructueuse.
Mes remerciements vont aussi à Mr Mustapha ARAHOU, Professeur à la faculté des
Sciences de Rabat, d’avoir eu l’amabilité d’accepter volontairement et aimablement de
critiquer et de juger ce travail. Je suis particulièrement reconnaissant et honoré par sa
participation au jury de cette thèse.
Je tiens à remercier également Mr Ahmed LAMARTI, Professeur à la Faculté des Sciences
de Tétouan, d’avoir accepté, malgré ses préoccupations et ses tâches d’enseignement et
d’encadrement, de lire et de juger ce travail. Qu’il trouve ici mes sincères sentiments de
gratitude et de respect.
Que Mr Mohamed ABOUROUH, Docteur d’Etat et Chef du Centre de Recherches
Forestières (CRF), trouve ici l’expression de ma profonde reconnaissance et mes sincères
remerciements, d’avoir ménagé son temps pour juger et critiquer ce travail.
Au Personnel de l’Ambassade de la Côte d’Ivoire à Rabat (Maroc), notamment S. Ex.
Daouda DIABATE, S. Ex. Sia Bi SEI, S. Ex. Atchimon AKE C.D., Mr. Kouadio Bi Gole
MICHEL, Mr. Check Ibrahim BAKAYOKO, Mahi ROLALD, …., pour leur politique de
proximité et leur compétence.
Au Pr. Jamal AURAG que j’apprécie et admire beaucoup et à tous les enseignants
chercheurs du L. M. B. M., Fatiha BRHADA, Jamila MAÂTALLAH, Bouchra BELKADI et
Ilham BOUHMOUCH, pour leur soutien et les conseils scientifiques prodigués.

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Mes sentiments les plus profonds et remerciements infinis à mes collègues et amis du L. M.
B. M., pour les relations amicales, conviviales, fraternelles et professionnelles qu’ils ont su
tisser en dehors et au sein du laboratoire. Je tiens à exprimer ma profonde gratitude à
Ibtissam EL-HILALI qui est exceptionnelle, Jamal Eddine EL JAMALI, Amal BERKIA, Leila
MEDRAOUI, Laila SBABOU, Amina SOROURI, Bouchra MOUHCINE, Loubna
TEMSAMANI, Nargisse BENNANI, Najla ELAAFI, Farah AITOUNMANE, Siham BRHADA et
Salwa MOUSSAD.
Enfin à tous mes compatriotes et amis qui ont rendu mon séjour au Maroc si agréable, plein
d’encouragement, d’espoir et de compréhensions.