Isatis tinctoria - Consortium USTH

Doctorante: Kieu Oanh NGUYEN
Directeur de Thèse: Pr. Dr. Eric GONTIER
Co-directeur de Thèse: Dr. Rebecca DAUWE
Equipe de recherche
« Procédés pour la production de biomolécules »
BioPI EA3900- Biologie des Plantes et Innovation
UPJV, Faculté des Sciences, 33 rue Saint Leu, 80039 Amiens, France
Date de début de Thèse:
Mai 2010
Date de soutenance prévue:
Mai 2013

Isatis tinctoria L.,
Brassicaceae
Indirubine
Agrobacterium rhizogenes
Tuyau d’arrivée d’air
Solution nutritive
GC-MS et
LC-MS
La métabolomique: une vision globale des
métabolites présents dans la plante…
Analyse du métabolome: révéler des
changements métaboliques globaux après
l’application d’un traitement

Etude de la bibliographie (base en place, maintien à jour et
approfondissement)
Analyses GC-MS et LC-MS sur des extraits de graines et de fruits d’Isatis
tinctoria pour caractériser la valeur potentielle des huiles dans les
graines.
Même démarche suivie pour les feuilles et les racines de la plante:
caractériser « tous » les métabolites présents dans chaque partie de la
plante (.
Cultures hydroponiques mises en place pour étudier l’influence de
souches bactériennes (Agrobacterium rhizogenes ) sur:
la croissance de plantes// augmentation de la vitesse de croissance,
plus de biomasse produite par unité de temps.
la biosynthèse des métabolites secondaires et primaires //
approche métabolomique utilisant XC-MS sous la langue R.
Etat d’avancement

XC-MS profiling
Extraction des méabolites (et dérivatisation).
Chromatographie (GC, LC) couplée à la spectrométrie de masse (MS).
Intégration des pics (caractérisés par un temps de rétention RT et un m/z).
Analyses statistiques par XC-MS sous la langue R.
Identification des pics: AMDIS (Automated Mass spectral Deconvolution
and Identification System) + NIST (libraires: Golm, BioPI –56 métabolites)
Par GC-MS, 132 métabolites ont été étiquetés dans les feuilles et les
racines d’Isatis tinctoria L.:
Etiquetés par groupe : 81
Acide aminés : 23
Sucres : 16 (not identified)
Acides organiques : 16
Glucosinolates : 12 (not identified)
Autres : 14
Autres composés étiquetés non identifiés : 51

Pour la suite:
Continuer à compléter nos résultats de GC-MS et LC-MS.
Réaliser des cultures hydroponiques stériles pour l’étude de
l’interaction plante-microorganismes.
Tests d’activité anti-microbien de l’extrait de feuilles et de
racines d’Isatis tinctoria.
Difficultés rencontrées
Le manque de standards spécifiques engendre une difficulté
pour l’identification des molécules.
Résultats attendus
Evaluation du potentiel d’ Isatis tinctoria pour la
production de métabolistes d’intérêt pharmaceutique à
partir de cultures hors-sol.
Des publications sur les travaux de thèse.