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CoEXISTENCE D'LIN CoMPLEXE I'gSPÈCES CRYPTIQUES À pps
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COMME EXIGENCE PARTIELLE
DU DOCTORAT EN BIOLOGIE
PAR
KAVEN DIONNE
AOUT 2015

A mes parents Chantal et André
<< We need not mqrvel at extinction; if we must marve| let it be at our own
presumption in imaginingfor a moment that we understand the many complex
contingencies on which the existence of each species depends. >
- C. Darwin, The origin of species

REMERCIEMENTS
La présente thèse est le fruit d'un nombre incalculable d'heures passées au
laboratoire, de plusieurs nuits blanches d'analyse et de quelques moments
d'inspiration pour coucher le tout sur papier. La plupart des efforts physiques et
mentaux qu'a requis la production de ce document sont de moi, mais je n'aurais
jamais réussi à terminer cette tâche colossale sans les apports de plusieurs personnes
que je tiens à remercier de tout cæur.
Merci à Christian Nozais, mon directeur de recherche, de m'avoir à nouveau
fait confiance pour mener à terme un projet d'une telle envergure. Merci pour ton aide
sur le terrain et au lab et merci pour tes conseils. Merci également aux étudiants de
ton laboratoire, en particulier Geneviève Brouillet-Gauthier et Patricia Glaz, pour les
conversations et le partage de trucs qui m'ont permis d'avancer. Bonne chance à tous
dans vos projets futurs! Merci également à France Dufresne, ma co-directrice, et à
tous ses étudiants, pour m'avoir encore permis de squatter votre laboratoire pendant
toutes ces années.
Encore une fois, un merci spécial à Roland Vergilino, mon mentor et ami,
pour tes conseils, ta patience et tous ces moments passés au lab ou devant une bonne
bière méritée. Un gros merci aux étudiants qui m'ont aidé sur le terrain etlou en
laboratoire : Laurence Paquette, Michèle Pelletier-Rousseau, Hubert Philippon,
Mirana Miharisoa Rakotomanga, Félix St-Pierre et Astrid Tempestini. Merci pour vos

iii
efforts et votre dévouement. Merci à Aurore Levivier, Marion Trudel et David Xie,
pour I'intérêt que vous avez manifesté pour mon projet de doctorat et pour les
Hyalella lorsque j'ai eu la chance de vous mentorer dans vos projets respectifs.
J'espère que ces expériences ont été aussi enrichissantes pour vous qu'elles I'ont été
pour moi!
Merci aux techniciens et au personnel de soutien de I'UQAR et de I'ISMER:
Geneviève Allard, Louise Amyot, Mathieu Babin, James Caveen, Jonathan Coudé,
Pauline Dubé, Steeven Ouellet, Danie Massé, Louiselle Lévesque, Cécile Renault,
Pascal Rioux, Marie-Andrée Roy et Mélanie Simard. Merci également à Jonathan
Gagnon de I'Université Laval. Merci pour tous ces coups de pouce que vous m'avez
donnés chacun à votre tour. Merci à Dominique Arseneault, Alain Caton, Gwénaëlle
Chaillou, Robert Chabot, Richard Cloutier, Mathilde Couturier, Éric Harvey, Yves
Lemay et Hacène Tamdrari. Pour vos informations, vos conseils, votre aide. Merci
également aux gens qui ont accepté d'évaluer les différentes épreuves de mon
doctorat : Dominique Gravel, Richard Cloutier, Magella Guillemette, Jean-Éric
Tremblay et Gesche Winkler. Un merci particulier à Beatrix Beisner, Mathew
Leibold et Gesche Winkler pour votre temps passé à évaluer la présente thèse. Je
pense que vos conseils et vos critiques constructives m'ont permis de beaucoup
m'améliorer en tant que scientifique.
Merci au personnel de la Réserve faunique Duchénier, de la Réserve faunique
Rimouski, de la Réserve faunique Matane, du Parc national du lac Témiscouata, de la
Zec Bas-Saint-Laurent, de la Zec Owen, de I'Organisme de Bassin Versant du Nord-
Est du Bas-Saint-Laurent et aux différents villégiateurs du Bas-Saint-Laurent, pow
nous avoir fourni gentiment de I'information et nous avoir permis d'échantillonner sur