Les plateformes de génétique moléculaire
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Thérapies ciblées : d l’anatomopathologie de l’ t th l i à la l biothérapie bi thé i Les plateformes de génétique moléculaire PO Schischmanoff UF Génétique moléculaire et oncogénétique CHU Avicenne ACP – FHF 29 mars 2012 Tests moléculaires prédictifs de la réponse aux biothérapies Avant Administration de médicaments anti-cancéreux Quels patients bénéficient du traitement ? Dorénavant Analyse préalable du profil moléculaire tumoral Critères biologiques ou moléculaires Sélection des médicaments les plus appropriés Thérapie ciblé Yap TA et al. Nat Rev Cancer 2010;10,514-523 Tests moléculaires prédictifs de la réponse aux biothérapies Avant Administration de médicaments anti-cancéreux Quels patients bénéficient du traitement ? Dorénavant Analyse préalable du profil moléculaire tumoral Critères biologiques ou moléculaires Sélection des médicaments les plus appropriés Thérapie ciblé Yap TA et al. Nat Rev Cancer 2010;10,514-523 Plan cancer et plateformes Garantir G ti un égal é l accès è aux traitements t it t et aux innovations 28 plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers subventionnées des cancers subventionnées Appels à projets nationaux 2006 Crédits d'équipement (INCa/Cancéropole- Région ) 2007 Financement emplois de Techniciens (INCa) 2006 … Financements tests moléculaires innovants (KRAS EGFR BRAF, …) 28 plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers subventionnées des cancers subventionnées Appels à projets nationaux 2006 Crédits d'équipement (INCa/Cancéropole- Région ) 2007 Financement emplois de Techniciens (INCa) 2006 … Financements tests moléculaires innovants (KRAS EGFR BRAF, …) • Maillage permet l’accès aux tests moléculaires pour l’ensemble des patients d’une région p g • Peuvent regrouper différents laboratoires • CRLCC, CHU, CHG • Relation avec les laboratoires de recherche 28 plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers subventionnées des cancers subventionnées Appels à projets nationaux 2006 Crédits d'équipement (INCa/Cancéropole- Région ) 2007 Financement emplois de Techniciens (INCa) 2006 … Financements tests moléculaires innovants (KRAS EGFR BRAF, …) • Maillage permet l’accès aux tests moléculaires pour l’ensemble des patients d’une région p g • Peuvent regrouper différents laboratoires • CRLCC, CHU, CHG • Relation avec les laboratoires de recherche 2010 Activité en pleine expansion - 60 tests différents - 278 000 analyses - 144 000 patients (44 en 2009) (+ 75 %) (+ 44 %) Missions des plateformes hospitalières d génétique de é éti moléculaire lé l i Ré Réaliser li d dans d des conditions diti qualifiées lifié des d tests t t moléculaires lé l i sanitaires en cancérologie et hématologie qui : • déterminent l’accès l accès à une thérapie ciblée (EGFR, KRAS, BRAF) • orientent le processus diagnostique (phénotypage MSI) • permettent le suivi d’une maladie résiduelle (BCR-Abl) Assurer la qualification et l’évaluation médico-économique des tests e effectués ectués (S (STIC) C) Développer l’assurance qualité (CQ, guide de bonnes pratiques) Anticiper les futurs tests, assurer leur insertion dans les projets de recherche Favoriser l’accès à l’information de tous les utilisateurs potentiels p Assurance qualité Contrôle de qualité inter-laboratoires européen ‘mutations activatrices du g gène KRAS’ (UKLeuven) Session 2010 Organisation : Institut Curie (Dr E. Rouleau ) 12 Participants Rouen, H Mondor, A Paré, Brest, Marseille, Lille, Bordeaux, ClermontFerrand HEGP Ferrand, HEGP, Curie, Curie Nantes Nantes, Nice Nice. 100% de succès F Accès à l’information Organisation • Coordinateurs: Pr M. Marty; Pr T. Molina; Pr P. Laurent-Puig; Dr N. Rheims Regroupe des laboratoires répartis sur 12 hôpitaux de l’AP-HP l AP HP 2010 : intégration des laboratoires d’ACP : ONCOMOLPATH Rè l d Règles de fonctionnement f ti t Réalisation des tests moléculaires prédictifs : • avec des techniques validées • dans des délais permettant la prescription • ‘‘gratuitement’’ ‘‘ t it t’’ (l (les llaboratoires b t i d’ACP ett d’Hé d’Hématologie t l i sontt remboursés b é d de 30€ pour l’envoi de matériel tumoral) Remise à l’INCa de rapports d’activités (trimestriels, annuels) Accès à l’information Site internet de la plate forme ONCOMOLPATH Permet : • Mise à disposition d’outils validés d d’information information et de prescription R h h des Recherche d analyses l A l Analyses moléculaires validées lé l i lidé : Liste des Liste des sites Outils téléchargeables Outils téléchargeables pour chaque analyse : • Fiches médicales communes à l’AP‐HP • Fiches d’information • Fiches d information pratique (par site) pratique (par site) • Bon de demande d’analyse (par site) • • • • • • • • • KRAS, MSI, BRAF cancer du colon EGFR cancer du poumon HER2 cancer du sein Clonalité IgH/TCR lymphome HER2 cancer de estomac KIT PDGFRA GIST KIT et PDGFRA GIST IDH1/IDH2 gliomes BRAF et c‐KIT mélanome JAK2 et SMP JAK2 et SMP (http://oncomolpath.aphp.fr) Evolution de l’activité é des plateformes de génétique moléculaire ? Mutations somatiques fréquentes de l’oncogène KRAS (CRCm) Evolution qualitative des tests moléculaires dans le cancer bronchique Mutations de KRAS dans le cancer colorectal EGF EGF Récepteur à l’EGF Biothérapie CETUXIMAB PANITUMUMAB Shc Grb-2 STAT P13K SOS Raf Akt PTEN Ras MEK 1/2 mTOR FKHR GSK-3 BAD MAPK PROLIFERATION Mutations de KRAS dans le cancer colorectal EGF EGF Récepteur à l’EGF Biothérapie CETUXIMAB PANITUMUMAB Shc Grb-2 STAT P13K Mutation activatrice de KRAS chez ~40 % des patients SOS Raf Akt PTEN Ras MEK 1/2 mTOR FKHR GSK-3 BAD MAPK PROLIFERATION Évolution du nombre de tests KRAS dans les cancers colorectaux métastatiques (données nationales) 17 246 16 581 Nombre de patients 16 799 10 012 mutations de KRAS depuis 3 ans 1 100 2007 2008 2009 2010 2011 Incidence des cancers colorectaux en France (40 250 nouveaux cas en 2011) Proportion des formes métastatiques (40 à 60 %) La plus grande partie des patients susceptibles de bénéficier d’un traitement (cetuximab ou panitumumab) a bénéficié du test Origine des prescriptions pour la recherche des mutations KRAS (données nationales) Autres plateformes 3% 30% CH de la p plateforme Établissements privés 42 % 25 % CH h hors plateforme l t f Stabilité 2009 -> 2011 Etapes de la caractérisation moléculaire du cancer bronchique TOTAL ~80 80 000 ttests t en 2011 (~ 30 %) 17000 7700 34000 4500 5300 10000 Les altérations moléculaires constituent des biomarqueurs qui peuvent être - des cibles moléculaires pour des thérapies ciblées q prédictifs p de la réponse p ou de la résistance aux traitements - des marqueurs Avenir = multiplication des tests Tendance au développement de tests théranostiques « compagnons » J Natl Cancer Inst (2009) (19): 1308-1324 Conséquences pour les plateformes Multiplication des tests pourrait => accroître la charge de travail => allonger les délais de rendu des résultats (perte de chance) Quantité limitante d’ADN (cancer pulmonaire, entre 13 et 20 % des cas : bloc tumoral épuisé ) Accréditation ISO 15189 Comment faire face ? ¾ Mise en œuvre de nouvelles technologies : - basées sur le multiplexage (recherche simultanée de plusieurs mutations) - séquençage é à moyen débit (µconducteurs, fluorescence, spectrométrie de masse) é ec o rapide ap de de ce centaines a es de mutations u a o s à pa partir de Détection faibles quantités d’ADN) Conclusions La médecine personnalisée en oncologie/hématologie se développe Pour le bénéfice des patients INCa a joué un rôle structurant dans ce processus La multiplication prévue des tests nécessite une adaptation ⇒ nouvelles technologies plus rapides, moins consommatrices d’ADN ⇒ collaboration accrue : pathologistes – biologistes - cliniciens Plateforme de génétique moléculaire Service d’anatomopathologie S i Service clinique li i Evolution de l’activité « KRAS » 2010/2011 dans le cancer colorectal l t l par plateforme l t f Médiane du nombre de tests par plate forme : 2009 : 520 [143 – 3417] 2010 : 475 [108 – 3484] 2011 : 457 [143 – 2916] AVICENNE DELAIS MOYEN DE RENDU DES RESULTATS KRAS 2009 10 -15 jours 2010 15 - 20 jours 2011 15 - 30 jours MSI jusqu’en 2010 2011 1 – 3 mois 3 – 6 mois EGFR 2010 7- 15 jours 2011 7- 20 jours Des pistes pour faire face Nouvelles organisations : collaboration accrue avec les pathologistes blocs => lames blanches => copeaux ou punchs > ADN ? Stockage ADN par ACP serait plus logique Accueil de personnel des hôpitaux généraux sur la PF ? nouvelles méthodes : approches multiplex multiplex, séquençage massif, massif etc … + de tests avec autant d’ADN d ADN
