Identification bactérienne: Paramètres de croissance Milieu de

Identification bactérienne:
Paramètres de croissance
Milieu de croissance complexe
• Fait à partir de d’ingrédients riches et
complexes
–
–
–
–
Ex. Extraits de protéines de soya
Extraits de protéines de lait
Produits sanguins
Just de tomate, etc.
• Composition chimique spécifique non connue
• Peut être sélective et/ou différentielle
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Milieu de croissance défini
• Composition chimique connue
Peut contenir jusqu’à 80 ingrédients
Peut être très simple
– Permet la croissance d’un nombre restreint
d'organismes
– Composition hautement variable en fonction du
microorganisme
–
–
• Peut être sélective et/ou différentielle
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Milieu de croissance sélectif
• Contient des constituants qui inhibent ou
tuent les organismes non-voulus
– Ex. Un milieu contenant de la pénicilline permet
seulement la croissance d’organismes résistants à
la pénicilline.
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Milieu de croissance différentiel
• Permet la discrimination de différentes espèces
• Contient souvent des indicateurs de pH
– Permet la discrimination de différents métablismes
Production de produits
alcalins qui donne une
couleur rouge au
milieu
La production de
produits acides rendent
donne une couleur
jaune au milieu
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Nutrition
• Macronutrients
– C,H,N,O,P,S
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Carbone
• Le carbone est necessaire afin de faire la
synthèse de tout produit organique, tel que :
–
–
–
–
Glucides
Lipides
Protéines
Acides nucléiques
Sources de carbone
• Inorganique
• Organique
–
–
–
–
–
–
–
Monosaccharides
Disaccharides
Polysaccharides
Protéines
Lipides
Acides nucléiques
Phénols, Etc.
– CO2
– CO
Phosphore
• Nécéssaire afin de faire la synthèse des :
–
–
–
–
Acides nucléiques
Phospholipides
ATP
Utilisé comme tampon (pH)
• Sources:
– Organique and inorganique
• La forme inorganique est plus souvent utilisée (PO4)
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Azote
• Nécéssaire afin de faire la synthèse des :
– Acides aminés
– Acides nucléiques
– Peptidoglycanes
• Sources:
– Organique: Acides aminés
– Inorganique: NH3, NO3, & N2
Sulfure
• Nécéssaire afin de faire la synthèse des :
– Acides aminés (Cystéine/Méthionine)
– Vitamines (thiamine and biotine)
• Sources:
– Organique: Acides aminés
• Cystéine and méthionine
– Inorganique:
• S, SO4
Hydrogène et oxygène
• Nécéssaire afin de faire la synthèse de
produits organiques!!
–
–
–
–
Glucides
Lipides
Protéines
Acides nucléiques
• Sources:
– Organique:
• Carbone organique
– Inorganique:
• H2 (Methanogènes seulement)
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Classification nutritionelle
• Sources de carbone
– Hétérotrophes:
• Produits organiques préformés
– Autotrophes:
• Molécules inorganiques
– CO2 et CO
Classification nutritionnelle (suite)
• Sources d’énergie
– Phototrophes:
• Lumière
– Chimiotrophes:
• Oxidation de produits organiques et inorganiques
• Source d’e– Organotrophes:
• Molécules organiques réduites
– Lithotrophes:
• Molécules inorganiques réduites
Types nutritionnels
•
•
•
•
Autotrophes photolithotrophes
Hétérotrophes photoorganotrophes
Autotrophes chimio-lithotrophes
Hétérotrophes chimio-organotrophes
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Paramètres environnementaux
• Disponibilité d’oxygène
• pH
• Température
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Exigences d’oxygène
• Aérobie:
– Besoin absolu d’oxygène afin de survivre
– Utilisé comme accepteur d’électrons final
– Utilisé par des bactéries qui ont un métabolisme
respiratoire oxidatif ou aérobique
• Microaérophilique:
– Besoin absolu d’oxygène à basses concentrations
– Hautes concentrations sont néfastes
Exigences d’oxygène (suite)
• Anaérobie/Aérotolérant:
– Oxygène n’est pas necessaire à la croissance ou survie
mais est toléré
• Anaérobes facultatives :
– Exigence facultative d’oxygène
– Peut utiliser l’oxygène ou non
– Possède un métabolisme dépendant et indépendant à
l’oxygène
• Anaérobie strict ou obligatoire:
– Oxygène n’est ni utilisé ou toléré; ne peut pas survivre
en présente d’oxygène.
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Métabolisme bactérien
• La pluspart des microorganismes utilisent le
carbone dans la voie métabolique glycolitique
→ pyruvate
• Différentes voies métaboliques sont utilisées
afin de métaboliser le pyruvate
– Respiration/Oxidation
– Fermentation
Métabolisme bactérien (suite)
• Respiration
– Peut se produire aérobiquement ou
anaérobiquement
– Utilisent tous deux un accepteur final d’électron
inorganique
• Respiration aérobique utilise l’O2
• Respiration anaérobique utilise des molécules
inorganiques différentes de l’O2 (Ex. NO3-)
– Produit final : H2O
Métabolisme bactérien (suite)
• Fermentation
– Pyruvate est métabolisé anaérobiquement
– Utilise un accepteur d’électrons organiques
– Plusieurs différents accepteurs d’électrons utilisés
par différents microorganismes
• Différents produits finaux sont générés en function de
l’ accepteur final d’electron
– Très utile afin de faire l’identification microbiale
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Fermentations
• Sous-produits :
– La pluspart génèrent des sous-produits acides + gaz (CO2)
– Quelques-uns génèrent seulement de l’acide ou du gaz
Paramètres utilisés lors de
l’identification bactérienne
-Présence d’enzymes exocellulaires
-α-amylase, etc…
-Utilisation d’oxygène (anaérobique vs. aérobique)
-pentes, etc…
-Produits de respiration anaérobique
-Nitrate réductase, etc…
-Produits de fermentation
-Éthanol, etc…
-Survie sur un milieu sélectif
-Survie en presence d’antibiotiques, etc…
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