II. Utilisation de la diversité phénotypique et génotypique

L2-L3- Enseignements intégrés
UE de l’agent infectieux à l’hôte
Diversité génétique, variation antigénique,
polymorphisme, échappement, enkystement au sein du
monde bactérien
Dr Sylvain Godreuil
•Département de Bactériologie-Virologie, Hôpital Arnaud de Villeneuve,
CHU Montpellier 1
•INSERM U1058 : « Infection par le VIH et par agents à tropisme
cutanéo-muqueux: de la pathogenèse à la prévention»
•Faculté de Médecine de Montpellier

Objectifs :
1. Comprendre les différents aspect de la diversité phénotypique et génétique du
monde bactérien
2. Savoir expliquer comment les mécanismes qui génèrent cette diversité chez les
bactéries
3. Décrire comment cette diversité chez les bactéries a été exploitée pour lutter contre
les maladies infectieuses bactériennes

PLAN
PLAN:
I. Généralités sur la diversité et polymorphisme phénotypique et génétique bactérien
I.1 Diversité phénotypique bactérienne
I.2 Diversité génétiques des bactéries
I.3 Polymorphisme des génomes et gènes conservés/auxiliaires
I.4 Mécanisme à l’origine de la diversité génétique bactérienne
II. Utilisation de la diversité phénotypique et génotypique bactérienne dans la lutte contre les
maladie infectieuses
II. 1 Utilisation de la diversité phénotypique et génotypique pour l ’identification des
bactéries pathogènes dans les prélèvement clinique
II. 2 Utilisation de la diversité phénotypique et génotypique pour l ’identification des
mécanismes de résistances aux antibiotiques
II.3 Utilisation de la diversité génétique pour comparer des isolats du même espèce
bactérienne: l’épidémiologie moléculaire
III. Points importants à retenir

I.1 Diversité phénotypique bactérienne
Les progrès de l'analyse bactériologique et biochimique démontrèrent dans les années 1920-1950,
l'existence de variations chez les bactéries:
- aspect de la colonie
- pigmentation de la culture
- perte de la capsule (virulence) chez le pneumocoque
- caractère de fermentation (lactose)
-acquisition de la résistance à un antibiotique..........
I. Généralités sur la diversité et polymorphisme phénotypique et génétique bactérien

I.2 diversité génétiques des bactéries
-L’ensemble du polymorphisme phénotypique est liée à expression de l’information
contenue dans les gènes bactériens situé sur le chromosome et le/les plasmides.
I. Généralités sur la diversité et polymorphisme phénotypique et génétique bactérien