3V523 - Licence SdV

SDV
Sciences de la Vie
Fiche d’U.E. – 3V523
GENETIQUE MICROBIENNE ET REGULATIONS CELLULAIRES
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Responsables de l’U.E :
Laure TEYSSET, [email protected]
Guennadi SEZONOV, [email protected]
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Nature de l’U.E:
Complémentaire
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Nombre d’ECTS :
6ECTS
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Semestre où l’enseignement est proposé :
S5
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Nombre d’heures de cours :
18h de cours
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Nombre d’heures de TD :
12h de TD
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Nombre d’heures de TP :
30h (TP obligatoirement groupé sur une semaine pour des raisons expérimentales)
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Evaluation:
Compte-rendu de TP (25%), Contrôle Continu (25%) et Examen final (50%)
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Capacité d’accueil
120 étudiants
Cette UE de génétique et de microbiologie composée d'une partie théorique et d'une partie
pratique a pour but d’introduire les principes fondamentaux de la génétique des
procaryotes et de leurs virus, et de présenter les divers mécanismes de régulation
indispensables pour leur fonctionnement.
a) Objectifs de l'Unité d'Enseignement
L’objectif de cette UE, qui s’appuie sur les acquis des UE de tronc commun de L2 de génétique et de
microbiologie, est d’introduire les principes fondamentaux de la génétique des procaryotes et de
leurs virus, et de présenter les divers mécanismes de régulation indispensables pour leur
fonctionnement. L’enseignement théorique, sous forme de cours et travaux dirigés, sera illustré
par un atelier pratique d’une semaine sur le modèle de la bactérie Escherichia coli. Au cours de
celui-ci, l’organisation physique et fonctionnelle d’un régulon sera étudiée grâce à la production de
mutants suivie de leur caractérisation phénotypique et moléculaire par conjugaison bactérienne et
par PCR. Ces travaux pratiques seront également l'occasion d'introduire par un exemple concret
une analyse in silico simple de ce régulon en utilisant différents outils bioinformatiques
d'analyse de séquences.
b) Thèmes abordés
-Variabilité génétique
-Mécanismes d’échanges génétiques chez les bactéries
-Interactions bactéries/ bactériophages
-Génétique directe et génétique inverse
-Régulation de l’expression des gènes sur différents exemples (catabolisme du maltose ; modèles
phagiques ; régulation des écosystèmes bactériens…)
c) Connaissances et compétences attendues
Les connaissances et compétences requises pour pouvoir suivre cet enseignement
correspondent aux acquis des UE de tronc commun de L2 de génétique et microbiologie.
A l'issu de cet enseignement, les étudiants auront acquis les bases fondamentales de la génétique
des procaryotes et de leurs virus. Grâce à la partie pratique, ils auront appris à suivre une
démarche expérimentale : de la mise en oeuvre du protocole jusqu'à l'analyse et l'interprétation
des résultats.
d) Evaluation
Compte- rendu de TP (25%), Contrôle Continu (25%), Examen Final (50%)
e) Particularités pédagogiques
Cette unité d'enseignement est constituée d'une partie théorique présentant les concepts et les
outils utilisés en génétique bactérienne dont un certain nombre seront illustrés directement dans
la partie expérimentale.
Ces outils incluent des expériences de génétique classique (mutagenèse aléatoire) et de génétique
inverse (mutagenèse dirigée), des expériences de biologie moléculaire (PCR) pour générer les
outils nécessaires à la mutagenèse dirigée et localiser les mutations, des expériences de
caractérisation phénotypique des mutants et de conjugaison bactérienne. Ces diverses approches
expérimentales seront couplées à une analyse bioinformatique de la séquence des gènes
impliquées dans la voie métabolique étudiée. Au cours de ce TP, les étudiants seront amenés à
analyser leurs propres résultats, et à proposer des expériences pour améliorer la caractérisation
des mutants. Certains de ces expériences pourront être mises en oeuvre durant le TP.