Microscopie photonique - Site d`Olivier Sigwarth

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Microscopie photonique
Plan
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Lumière et interactions avec la matière
Formation de l’image
Microscopies en fond clair / fond noir
Microscopies de phase et interférentielle
Microscopie de fluorescence
Microscopie confocale
Capteurs d’images
Nature de la lumière
• L’élément constituant de la lumière est le photon
• Le photon est de nature duale : onde / corpuscule
– onde électromagnétique lors de son trajet
– corpuscule lors d’une interaction avec la matière
• Un rayon lumineux est un flux parallèle de photons
Le photon : onde électromagnétique
longueur d’onde (λ)
E
H
Sens de propagation
Le photon : longueur d’onde = couleur
bleu λ ≅ 450 nm
vert λ ≅ 520 nm
rouge λ ≅ 680 nm
Monochromatisme - Lumière blanche
Faisceau monochromatique
bleu ( λ ≅ 450±10 nm)
Faisceau monochromatique
rouge ( λ ≅ 650±10 nm)
Faisceau polychromatique
blanc ( λ [400..700] nm)
Lumière : spectre visible
500nm
500nm
600nm
600nm
700nm
700nm
Infrarouges
Ultraviolets
400nm
400nm
Lumière - polarisation
E
E
H
H
axe de vibration
Faisceau polarisé
Faisceau non-polarisé
Interactions lumière-matières
• Absorption
– atténuation, réduction du nombre de photons
– filtrage, sélection de longueurs d’onde
• Réfraction
– retard, déphasage
– déviation, séparation de longueurs d’onde
– biréfringence
• Réflexion
• Diffraction
– interférences, filtrage
• Fluorescence - Transfert d’énergie
Absorption de la lumière - Atténuation
I
I0
I < I0
Absorbance : I0 / I
Matériau absorbant
Absorption sélective (filtrage)
Lumière filtrée
Lumière blanche
grandes longueurs d’onde
Matériau absorbant sélectif
Réfraction - vitesse de propagation
n1
Indice de réfraction :
n2
n1
ni = c / νi
n1 ≅ 2,25 n2
ni varie en légèrement fonction de λ
Réfraction - Déphasage
n2
n1
Réfraction - Déviation (monochromatique)
n1 sin α1 = n2 sin α2
α1
α1
n1
n1
n2
n2
α2
n1 > n2
α2
n1 < n2
Réfraction - Déviation (monochromatique)
α1
n1
αc
n1
n2
α2
n1 > n2
n2
angle critique ⇒ réflection
Réfraction - Déviation (polychromatique)
α1
n1 > n2
α1
n1
n1
n2
n2
Dispersion des couleurs
Séparateur de longueurs d’onde
Biréfringence
Rayons parallèles
polarisés orthogonalement
Lumière monochromatique
non-polarisée
Milieu anisotrope
(Calcite CaCO3)
Diffraction - Dispersion de la lumière
Rayons diffractés
Rayon incident
Diffraction et interférences
x
I
franges
d’interférence
Ecran
Fluorescence - principe
e1 = hν1
Absorption
e1 > e2
λ1 < λ2
noyau
orbitale haute
(état excité)
Emission
e2 = hν2
noyau
orbitale basse
(état de repos)
Formation de l’image
• Définition d’une lentille convergente
– Chemins optiques
• Optique limitée par la diffraction
– Disque de Airy
– Pouvoir séparateur
• Ouverture numérique
• Abérrations
Lentille objectif
Foyer objet
Foyer image
Fronts d’onde
Optique limitée par la diffraction
Source ponctuelle
rayons diffractés
Plan image
Formation de l’image - Diffraction
Image obtenue (disque de Airy)
intensité
intensité
Image idéale d’un point
distribution idéale
fonction d’étalement (PSF)
intensité
intensité
Pouvoir séparateur
points résolus
points non-résolus
Effet de l’ouverture numérique
α
iris
D
α
iris
α
Ouverture numérique NA = n sin α, D: distance de travail
Résolution - Pouvoir séparateur d’un objectif
Résolution latérale
1,22 λ
1,22 λ
Rx =
=
2 n sin α
2 NA
intensité
R
points résolus
Résolution axiale
4λ
4λ
Rz =
=
2
(n sin α) 2
NA
Profondeur de champ
λ
∆Z =
NA 2
4n 1- 1- n
[
( )]
Objectifs “à air” ou “à immersion”
liquide d’immersion
B
C
A
B
A
C
n
n
n
n
3
2
1
1
n2 ≠ n1
n3 ≅ n1
Objectif à sec
Objectif à immersion
Abérration chromatique
Sans correction
Avec correction
angles de réfraction :
rouge < vert < magenta
Lentille divergente
Fond clair : illumination critique
objet
source
lentille collectrice
plan objet
image de la source
objectif
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