Mémoire Présenté

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UNIVERSITE DE OUAGADOUGOU
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UNITE DE FORMATION ET DE
RECHERCHE EN SCIENCE DE LA VIE ET
DE LA TERRE (UFR/SVT)
Mémoire Présenté
Par : Prosper BADO
Pour l’obtention du Master II
de Biologie Moléculaire et de Génétique Moléculaire Appliquées
de l’Université de Ouagadougou
SUR LE THEME:
Caractérisation moléculaire par PCR en temps réel de 14
génotypes de Papillomavirus Humains à haut risque dans des
cas cancers du col de l’utérus à Ouagadougou (Burkina Faso).
Soutenu le 28/07/2015 devant le jury composé de :
Présidente : Prof Olga M. LOMPO, Professeur Titulaire, Université de Ouagadougou
Membres : Prof Jacques SIMPORE, Professeur Titulaire, Université de Ouagadougou
Dr Florencia W.DJIGMA, Assistant, Université de Ouagadougou
LABORATOIRE DE BIOLOGIE
MOLECULAIRE ET DE GÉNÉTIQUE
MOLÉCULAIRE (LABIOGENE)

Master II BioGéMA / 2014-2015 /Prosper BADO i
Préface du Coordonnateur du Master BIOGEMA
De nos jours, les connaissances avancées en génétique et biologie moléculaires sont
incontournables pour conduire des études de hautes valeurs ajoutées en sciences
biologiques. Les outils de la Biologie moléculaire ont permis d’accomplir de grands
progrès dans le domaine du diagnostic, de la pharmacie, de la thérapeutique, de
l’agriculture et même dans l’aide à la justice par l’identification humaine. Les
Universités et les laboratoires de recherche des Pays membres de l’UEMOA dans leur
grande majorité, restent arrimés aux pays et laboratoires de recherche du Nord pour
leurs besoins en recherches et activités en génétique et biologie moléculaires. Cet état de
fait est lié au déficit en personnel qualifié et le manque de ressources financières et
matériel pour conduire les recherches en local in situ. Cela a pour conséquence, une non
maîtrise de la finalité ainsi que de l’utilisation des résultats et produits des recherches
que nous conduisons, une surenchère du coût des examens et des études en biologie et
génétique moléculaires. Un autre corollaire et non des moindres de cet état de fait est la
fuite de capitaux mais également la fuite des cerveaux car les étudiants les plus
compétents envoyés dans les pays du Nord ont tendance à y rester.
Le master en Biologie Moléculaire et en génétique moléculairs appliquées (BioGeMA) a
pour but de combler le vide constaté dans l’expertise en génétique et biologie
moléculaires par la mise à disposition des pays de l’espace UEMOA, de personnels
qualifiés, de haut niveau de compétences pour conduire des études et recherches en
génétique et biologie moléculaires.
Le master BioGeMA est :
 Un Master à dimension sous-régionale
 Géré par un réseau de chercheurs et praticiens en génétique et biologie
moléculaires
 Soutenu par une plateforme technologique sous-régionale à LABIOGENE
Ce Master a pour objectif de former des biologistes, des pharmaciens, des
vétérinaires et des médecins biologistes capables d’effectuer des diagnostics
biomoléculaires dans des centres hospitaliers et d’élaborer des études
d’investigations dans des structures de recherches. En outre, il ouvrira la porte
d’études doctorales aux meilleurs étudiants pour permettre la formation de
chercheurs et d’enseignants-chercheurs afin d’assurer la relève du corps
enseignants, la constitution d’une masse critique d’experts africains et la mise en
place d’un véritable réseau africain de recherche dans le domaine ci-dessus cité.
Professeur Jacques SIMPORE
Professeur Titulaire de Biologie Moléculaire et de Génétique Moléculaire
UFR/SVT - École Doctorale Sciences et Technologies
Université de Ouagadougou – Burkina Faso

Master II BioGéMA / 2014-2015 /Prosper BADO ii
Dédicaces
Je dédie ce mémoire à mon grand-père Baka Ambroise (in memoriam) et à ma
grand-mère Clémentine KANDIEL, pour m’avoir forgé à la persévérance!

Master II BioGéMA / 2014-2015 /Prosper BADO iii
Remerciements
Ce travail a été réalisé au Centre Médical Saint Camille, au service d’Anatomie pathologie-
Unité de Médecine Légale (CHU/YO) et au Centre de Recherche Biomoléculaire Pietro
Annigoni (CERBA/LABIOGENE) de l’Université de Ouagadougou (Burkina Faso) sous la
direction du Pr Jacques SIMPORE. Je tiens à remercier vivement :
Le Professeur Jacques SIMPORE, notre directeur de mémoire, pour m’avoir accepté dans
son laboratoire et d’accepter guider mes premiers pas dans la recherche. C’est ici l’occasion
pour nous de vous témoigner notre reconnaissance de la rigueur scientifique de votre
encadrement, votre disponibilité constante et de votre soutien moral et matériel;
Pr Olga M. LOMPO, Professeur titulaire en Anatomie et cytologie Pathologie, Université de
Ouagadougou pour avoir facilité la collecte de nos données dans votre service et d’avoir
accepté juger ce travail malgré vos multiples occupations. Soyez-en remercié;
Dr DJIGMA Wendkuuni Florencia, Assistante en Biologie Moléculaire pour la
disponibilité et la contribution à la réalisation de ce travail et pour avoir accepté le juger ;
Le corps professoral de l’UFR/SVT et celui du Master II de BioGeMA en particulier, pour la
qualité des enseignements ;
Aux Docteurs, Djénéba OUERMI, Issouf TAO pour leur disponibilité, leurs conseils et
leur contribution à la réalisation de ce travail ;
Dr Théodora ZOHONCON qui nous a fasciné par sa rigueur scientifique, son amour pour le
travail bien fait. Nous avons bénéficié de vous, de façon constante, des conseils,
enseignements et un encadrement pertinent. Veuillez trouver en si peu de mots, le
témoignage de ma profonde gratitude.
Les ainés, Père Albert YONLI, SOUBEIGA R. S. Théophile, COMPAORE T. Rébéca,
OUATTARA Abdoul Karim, Valérie BAZIE… pour leur assistance constante ;
Les responsables et le personnel du laboratoire d’Anatomie et cytologie pathologie (CHU-
YO) : Dr OUATTARA, Mr Noufou OUEDRAOGO, Mr Issa TAPSOBA ;
A la Commission de l’UEMOA pour leur soutien financier du master BioGeMa ;
Ma famille pour toute l’affection, tout le soutien, toutes les prières, toute la patience et tous
les sacrifices que vous m’avez généreusement consentis.
Mes camarades du master pour leur bonne collaboration et l’ensemble de mes camarades de
l’UGEB pour leur soutien tout au long de ce mémoire

Master II BioGéMA / 2014-2015 /Prosper BADO iv
Résumé
Introduction : Le cancer du col de l’utérus est dans 99% des cas dû à un HPV à haut risque.
Avec une incidence de 493000 cas dont 80% en Afrique, le cancer du col de l’utérus constitue
respectivement la deuxième et la première cause de mortalité par cancer chez la femme dans
le monde et en Afrique. Et pourtant, de la quinzaine de HR-HPV, seuls les HPV16 et 18 sont
couverts par les deux vaccins existant. C’est pourquoi nous visons à travers cette étude
évaluer la fréquence des HR-HPV dans des cas de cancer chez des femmes à Ouagadougou.
Méthodes : Par PCR multiplex en temps réel, nous avons recherché 14 génotypes HR-HPV
dans 106 pièces cancéreuses du col de l’utérus. Ces pièces conservées dans des blocs solides
de paraffine ont été coupés en des sections de 20µm. L’ADN extrait de ces sections
déparaffinés a été utilisé pour la PCR.
Résultats : Des 106 échantillons testés, seulement 55,64% (59/106) avaient un résultat
adéquat. Le génotypage a révélé la présence de 11 génotypes HR-HPV ; les 3 génotypes
absents étaient les HPV33, 66, 68. Parmi ces génotypes retrouvés, les plus fréquents étaient
HPV18 (41,4%), HPV39 (21,95%), HPV31 (26,83%), HPV16 (17,1%), et HPV45 (17,1%),
HPV58 (9,8%) et HPV35 (9,8%). Dans 41,5% (17/41) des cas, les échantillons étaient
infectés uniquement par l’un des HPV31, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58,59 ou en infection
multiple. Le nombre de génotypes HPV à haut risque variait de 1 à 4 par individu avec 39%
(16/41) d’infections multiples.
Conclusion : Le HPV18 était le plus fréquent dans les échantillons de cancers. Nous avons
noté une prévalence élevée des cancers dus uniquement au HPV31, 35, 39, 45, 51, 52, 56,
58,59.
Mots clés : HPV à haut risque, cancer du col de l’utérus, PCR multiplexe en temps réel,
Burkina Faso.