Thèse Ahmed Amine Bekkar SNV 2016

REPUBLIQUE ALGERIENNE DEMOCRATIQUE ET POPULAIRE
MINISTERE DEL’ENSEIGNEMENT SUPERIEUR ET DELARECHERCHE SCIENTIFIQUE
Année Universitaire : 2015/2016
UNIVERSITE MUSTAPHA STAMBOULI
DE MASCARA
FACULTE DES SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE
DÉPARTEMENT DES SCIENCES AGRONOMIQUES
THESE DE DOCTORAT EN SCIENCES
FILIERE : SCIENCES AGRONOMIQUES
OPTION : Phytopathologie
Présentée par :
Mr BEKKAR Ahmed Amine
Pouvoir antagoniste et mode d’action de Trichoderma
vis-à-vis de quelques champignons phytopathogènes
Composition du jury de soutenance
Présidente
Pr. TIR TOUIL Aicha
Université de Mascara
Directeur de thèse
Pr. BELABID Lakhdar
Université de Mascara
Examinateur
Pr. MEDDAH Boumediène
Université de Mascara
Examinateur
Pr. BEKKI Abdelkader
Université d’Oran-1
Examinateur
Pr. ABBOUNI Bouziane
Université de Sidi Bel-Abbès
Examinateur
Pr. BOUKRAA Laïd
Université de Tiaret

Remerciements
Cette thèse a été réalisée au Laboratoire de Recherche sur les systèmes Biologiques et
Géomatiques (LRSBG) de l’Université de Mascara, je tiens à exprimer ma profonde
reconnaissance et toute ma gratitude au Dr HAMIMED A. de m'avoir accueilli dans son
laboratoire et d'avoir assuré mon encadrement. Qu'il trouve ici l'expression de mes remerciements
les plus sincères et celle de mon profond respect.
Je tiens à exprimer toute ma gratitude, ma reconnaissance et mes sincères remerciements à
mon directeur de thèse Mrs. le Professeur BELABID Lakhdar, pour avoir assuré la direction
scientifique de ce travail et de m'avoir fait profiter de ses connaissances scientifiques. J’ai été
extrêmement sensible à ses qualités humaines d'écoute et de compréhension tout au long de ce
travail doctoral. Il a toujours su me faire confiance et m'apporter l'aide nécessaire, tant sur le plan
scientifique que moral. Il m’est agréable de pouvoir lui adresser mes vifs remerciements et
immenses reconnaissances.
Je remercie très vivement Madame la Professeur TIR TOUIL Aicha de l’Université de
Mascara, pour l’honneur qu’elle m'a fait en présidant le jury de cette thèse ; qu’elle veuille bien
trouver ici l’assurance de ma profonde gratitude.
Je tiens à remercier sincèrement les membres du jury Mrs. les Professeurs MEDDAH
Boumediène, BEKKI Abdelkader, ABBOUNI Bouziane et BOUKRAA Laid qui me font le grand
honneur d’évaluer ce travail. Qu’ils trouvent, à travers ce travail, l’expression de ma profonde
reconnaissance.
Mes remerciements vont également à Mrs MONTE Enrique et DEBBI Ali d’avoir réalisé
l’identification moléculaire de Trichoderma au niveau du laboratoire de département de
microbiologie et de génétique de l’université de Salamanca, Espagne. Qu’ils veuillent bien agréer
l’expression de mon profond dévouement.
Un grand merci à Mme la Professeur ESSALMANI Hayet de l’Université de Tanger,
Maroc, pour ses fructueux conseils ainsi que les discussions scientifiques que j'ai eu la chance
d'avoir avec elle.
Merci à mon père pour avoir lu,relu et corrigé ce manuscrit.
Enfin, que tous ceux, de près ou de loin, dont l’assistance ou les conseils m’ont permis de
mener à bien ce travail, trouvent ici l’expression de ma profonde gratitude et de mes salutations
les plus respectueuses : Mr Belahcene M., Mr Boucif M., Mr Benarba B., Mr Eloussi M., Mr
Bendaha M., Mr Megharbi A., Mr Mokrani S., Mr Benhada D., Mr Saidi M., Mme Malik S.,
Mme Lazreg F., Mme Moumou M., …

Je dédie cette thèse, le fruit de plusieurs années d’études et de sacrifices,
A mes parents
A tous ceux que j’aime et spécialement :
- A ma femme et mes adorables enfants Mohamed Akram, Ahmed Baraa et
Sarah Ilhem. Que Allah vous garde et vous protège.
- A mon frère Mohamed, sa femme Abir et la petite adorable Iness et …
- A mes sœurs
- A mes amis : Yerou Med, Sellam Med et Moussaoui Gherissi.

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Résumé
Compte tenu des méthodes de gestion des maladies les plus respectueuses de
l'environnement et durables, un total de 23 isolats de Trichoderma spp., appartenant à trois
espèces : T. harzianum, T. koningii et T. longibrachiatum sont isolés à partir des sols
rhizosphériques, prélevés de quatre régions du nord-ouest Algérien : Mascara,
Mostaganem, Tlemcen et Oran. Les isolats obtenus sont évalués pour leurs activités et
leurs mécanismes employés contre quatre champignons phytopathogènes appartenant au
genre Fusarium : F. solani, F. oxysporum f. sp. albedinis, F. oxysporum f. sp. lycopersici
et F. oxysporum f. sp. ciceris. Les résultats montrent que tous les isolats de Trichoderma
ont une activité antagoniste importante par confrontation directe où ils ont inhibé
significativement la croissance mycélienne de tous les agents pathogènes testés avec un
pourcentage d'inhibition variable (45 à 90% par rapport aux témoins). T5, T10 et T14 sont
les isolats les plus performants vis-à-vis de tous les isolats de Fusarium. Des observations
microscopiques au niveau de la zone de contact ont montré un enroulement du mycélium
de Trichoderma autour de celui des agents pathogènes. Une vacuolisation et une
désintégration des hyphes du pathogène ont été aussi observées. Cette étude a révélé
l'aptitude des Trichoderma à agir par antibiose contre le Fusarium en libérant des
substances volatiles et non volatiles actives sur la croissance mycélienne et la germination
des conidies. L’identité de l’isolat le plus performant T. harzianum T5 a été confirmée par
une identification moléculaire basée sur les séquençages de la région ITS et du gène tef1
de l’ADNr et qui ont été déposées auprès de NCBI Genbank sous les deux numéros
d’accession KX523899 et KX674063. Tous les isolats ont démontré leur capacité à
synthétiser des enzymes chitinolytiques, cellulolytiques, protéolytiques, amylolytiques,
ligninolytiques et lipolytiques. Dans les essais en pot, le traitement des graines avec un des
trois isolats les plus performants de Trichoderma : T5, T10 et T14 a empêché l’expression
du flétrissement vasculaire de pois chiche causé par F. oxysporum f. sp. ciceris et
significativement réduit l'incidence de cette maladie. Un maximum de réduction de 92% a
été enregistré avec l’isolat T. harzianum (T5). Cette étude a permis de révéler que les
espèces appartenant au genre Trichoderma notamment T. harzianum, T. koningii et T.
longibrachiatum peuvent être utilisées comme des agents de lutte en phytoprotection.
Mots-clés : Trichoderma spp., activité antagoniste, Fusarium sp., mycoparasitisme,
enzymes hydrolytiques, contrôle biologique.

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