Informations générales sur l`équipe de Patrick CORMIER
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Stage proposé par Odile MULNER-LORILLON DR CNRS, HDR Nom et adresse du Laboratoire ou de l’Unité : UMR Mer&Santé CNRS/UPMC 7150, Station Biologique - BP 74, 29682 Roscoff cedex Téléphone : 0298292366 Mail : [email protected] Site internet : http://www.sb-roscoff.fr/CCD/ Directeur du Laboratoire ou de l’Unité : Patrick CORMIER Intitulé de l ‘équipe d’accueil : Traduction, Cycle Cellulaire et Développement Prénom et NOM du Responsable de l’équipe : Patrick CORMIER Résumé du thème de recherche de l’équipe La thématique de recherche de l'équipe TCCD est la caractérisation des interrelations moléculaires entre le contrôle de l'expression des gènes au niveau post-transcriptionnel (traduction) et la régulation du développement embryonnaire précoce (fécondation, cycle cellulaire et embryogénèse). L'embryon d'oursin est historiquement un modèle de choix pour l'étude du développement embryonnaire. La fécondation de l'ovule d'oursin provoque la reprise du cycle cellulaire dans le zygote et s'accompagne de modifications globales et spécifiques de la synthèse des protéines indépendantes de la transcription et impliquant une régulation de la lecture (recrutement et traduction) des messagers maternels stockés dans l'ovule. Ainsi, l’embryon d’oursin est aussi un modèle essentiel pour l’étude des mécanismes moléculaires de la régulation de l'expression des gènes au niveau de la traduction. Un challenge de l’équipe est la construction du premier réseau de la régulation traductionnelle du développement embryonnaire précoce dans une recherche de biologie systémique. Titre du projet de stage : Etude spatio-temporelle de la régulation de la traduction après fécondation et au cours du développement embryonnaire précoce Prénom, NOM, téléphone et adresse e-mail LORILLON, 0298292337, [email protected] du Responsable du stage: Odile MULNER- Projet de stage : Deux familles de facteurs de traduction, des facteurs d’initiation de la famille eIF4 et des facteurs d’élongation, EF1 et EF2, ont préalablement été corrélées à la régulation de la synthèse des protéines requises lors du développement précoce (Salaun et al, 2003; Le Sourd et al, 2006; Ouhlen et al, 2007; Bellé et al, en preparation). Le sujet proposé pour ce stage est de participer à l’analyse de l’expression spatio-temporelle de ces facteurs dans l’embryon après la fécondation et de sa corrélation avec les modifications de la synthèse des protéines. L’étude de l’expression spatio-temporelle des transcrits codant pour les facteurs de traduction sera réalisée par une approche d’hybridation in situ. L’expression des protéines correspondantes sera parallèlement analysée par immunofluorescence grâce à des anticorps spécifiques dirigés contre la protéine ou certaines de ses modifications posttranscriptionnelles (phosphorylation, ….). La mesure de l’activité de synthèse protéique sera réalisée in situ grâce à la technique de SunSET que nous avons récemment adaptée à l’embryon d’oursin. Cette technique permet de mesurer et localiser l’activité de synthèse protéique dans des cellules ou des tissus in toto par révélation immunofluorescente de la puromycine préalablement incorporée dans les chaines peptidiques en élongation (Schmidt et al., 2009). Les analyses seront conduites dans des conditions physiologiques normales du développemnt après fécondation puis dans des conditions perturbées par des agents pharmacologiques ciblant la synthèse des protéines et/ou les voies de signalisation régulant l’activité des facteurs de traduction (voie mTOR, MAPK, CDK,…..). Techniques mises en œuvre par le stagiaire : Les techniques de biologie cellulaire (culture de gamètes et d’embryons, cinétique de développement embryonnaire, analyse d’embryons par immunofluorescence,……) et des études biochimique par Western Blot, techniques maitrisées dans le laboratoire seront utilisées. La nouvelle technique d’analyse de la synthèse protéique par marquage à la puromycine (sunset) est maintenant opérationnelle dans le laboratoite et sera largement utilisée dans ces études . La microinjection de protéines ou de mRNA dans les embryons sera également mise en œuvre, les protéines ou les messagers étant produits dans le laboratoire après clonage des gènes d’intérêt Publications du Responsable de stage au cours des 5 dernières années : -Oulhen, N., Mulner-Lorillon, O., and Cormier, P. (2010). eIF4E-Binding proteins are differentially modified after ammonia versus intracellular calcium activation of sea urchin unfertilized eggs. Mol Reprod Dev. 77, 83-91 -Le Bouffant, R. L., Boulben, S., Cormier, P., Mulner-Lorillon, O., Belle, R., and Morales, J. (2008). Inhibition of translation and modification of translation factors during apoptosis induced by the DNA-damaging agent MMS in sea urchin embryos. Exp Cell Res 314, 961-968 -Le Bouffant, R., Mulner-Lorillon, O., Morales, J., Cormier, P., and Belle, R. (2008). Chromium(III) Triggers the DNA-Damaged Checkpoint of the Cell Cycle and Induces a Functional Increase of 4E-BP. Chem Res Toxicol, 21, 542-549 -Bellé, R., Le Bouffant, R., Morales, J., Cosson, B., Cormier, P. and Mulner-Lorillon, O. (2007). Sea urchin, DNAdamaged cell cycle checkpoint and the mechanism at the origin of cancer development. J. Soc Biol., 201, 317327. -Oulhen, N., Morales, J. Cosson, B., Mulner-Lorillon, O. Bellé and Cormier, P. Gene expression regulation at the translational level: contribution of marine organisms. J. Soc. Biol, 201, 297-306. -Saad, H. Bellé, R., Morales, J., Cosson, B. Mulner-Lorillon, O., Berthou, C. and Cormier, P. Initiation factors 4 : from sea urchin embryonic development to chronic lymphocytic leukemia. J. Soc. Biol, 201, 307-315. -Le Bouffant, R., Cormier, P., Cueff, A., Belle, R., and Mulner-Lorillon, O. (2007). Sea urchin embryo as a model for analysis of the signaling pathways linking DNA damage checkpoint, DNA repair and apoptosis. Cell Mol Life Sci 64, 1723-34. -Le Bouffant, R., Cormier, P., Mulner-Lorillon, O., and Bellé, R. (2006). Hypoxia and DNA-damaging agent bleomycin both increase the cellular level of the protein 4E-BP. J Cell Biochem. 9, 126-132. -Morales, J., Mulner-Lorillon, O., Cosson, B., Morin, E., Belle, R., Bradham, C. A., Beane, W. S., and Cormier, P. (2006). Translational control genes in the sea urchin genome. Dev Biol 300, 293-307. -Fernandez-Guerra A, Aze A, Morales J, Mulner-lorillon, O., Cosson B, Cormier P, Bradham C, Adams N, Robertson AJ, Marzluff WF, Coffman JA, and Geneviere AM. (2006). The genomic repertoire for cell cycle control and DNA metabolism in S. purpuratus. Develop. Biol. 300, 238-251. -Sodergren, E, Weinstock GM, Davidson, EH, Cameron RA, ..... Belle R, Cormier P, Cosson B, Morales J, Mulner-Lorillon, O. , ..... and The Sea Urchin Genome Sequencing Consortium (2006). The Genome of the Sea Urchin Strongylocentrotus purpuratus. Science. 314, 941-952. -Le Sourd, F., Cormier, P., Bach, S., Boulben, S., Bellé, R., and Mulner-Lorillon, O. (2006). Cellular coexistence of two high molecular subsets of eEF1B complex. FEBS Lett 580, 2755-60. -Le Sourd, F., Boulben, S., Le Bouffant, R., Cormier, P., Morales, J., Bellé, R., and Mulner-Lorillon O. (2006). eEF1B: At the dawn of the 21st century. Biochim Biophys Acta 1759, 13-31. Autres informations Etudiants actuellement en thèse ou en M2 dans l’équipe d’accueil. Pour chaque étudiant indiquez le nom du responsable de thèse, l’année du début de la thèse et l’Ecole Doctorale de rattachement Nom et Prénom du doctorant Nom du directeur de Année de Ecole Doctorale thèse 1ere inscription ABASSI Azza Patrick CORMIER& 2008 ED CdV Paris VI Fathia ZGHAL COSTACHE Vlad Julia MORALES 2008 ED VAS Rennes I GOSSELIN Pauline Bertrand COSSON & 2009 ED CdV Paris VI Patrick CORMIER SAAD Hussam Patrick CORMIER 2006 ED VAS Rennes I Etudiants ayant préparé ou soutenu leur thèse ou leur M2 dans l’équipe d’accueil au cours des cinq dernières années. Pour chaque étudiant indiquez le nom du responsable de l’étudiant, l’année du début de la thèse et de fin de la thèse, l’Ecole Doctorale de rattachement et le devenir de l’étudiant. Nom et Prénom Nom du responsable Année Université Devenir de l’étudiant d’inscription M2 OUHLEN Patrick CORMIER 2004-2005 Genomique et Santé Thèse UMR7150 Nathalie Rennes1 M2 SAAD Hussam Patrick CORMIER 2005-2006 VersaillesThèse UMR7150 StQuentin M2 GIRARD Julia Morales 2006-2007 BMC Paris VI Thèse M2 Anne Claire COSTACHE Vlad GOSSELIN Pauline M2 PLUCHON Pierre-François Odile MULNER_LORILLON 2008-2009 Sciences Mer et Lirttoral UBO Magister Genomique Paris VII BMC Paris VI Thès e Thès e Thès e Le SOURD Frédéric Le BOUFFANT Ronan OUHLEN Nathalie Odile MULNER_LORILLON Odile MULNER_LORILLON Patrick CORMIER 2003-2006 ED VAS Rennes I 2004-2007 ED VAS Rennes I Ingénieur FR2424 MC Paris VI 2005-2008 ED VAS Rennes I Post Doc USA M2 Patrick CORMIER 2007-2008 Bertrand COSSON 2008-2009 Thèse UMR7150 Thèse UMR7150 Thèse IFREMER Cette proposition de stage s’adresse-t-elle spécifiquement à un étudiant scientifique, médecin ou vétérinaire ou bien est-il ouvert à tous les profils ? Spécifiquement un scientifique, médecin ou vétérinaire Ce sujet peut-il donner lieu à une thèse ? oui
