TEXTE DE LA PUBLICITE Titre : Analyse fonctionnelle du transcriptome de 2 espèces d insectes lépidoptères pour BIVI-Montpellier Objet détaillé : Analyse fonctionnelle du transcriptome de 2 espèces d’insectes lépidoptères pour BIVI du centre de Montpellier est un Projet en 4 parties : I. Transcriptome de référence pour le lépidoptère Ostrinia sp. II. Analyse du transcriptome du lépidoptère Ostrinia sp. dans 8 conditions différentes (RNA seq) III. Analyse du transcriptome du lépidoptère Spodoptera sp. dans 10 conditions différentes (RNA seq) IV. Analyse des petits ARNs du lépidoptère Spodoptera sp. dans 2 conditions différentes Unité administrative : UMR1231BIVI Code référentiel inter EPST : 52.54 Caractéristiques du besoin (description, lieu d’exécution, durée, volume, etc.) : Projet en 4 parties, comme indiqué ci-dessous I. Transcriptome de référence pour le lépidoptère Ostrinia sp. I.1. Banque normalisée à partir d’ARN totaux I.2. Séquençage 454 II. Analyse du transcriptome du lépidoptère Ostrinia sp. dans 8 conditions différentes (RNA seq) II.1. Banque ADNc (8 échantillons) à partir d’ARN totaux II.2. Séquençage Illumina 36 bases : 4 séquençages (2 échantillons/séquençage) II.3. Analyse bio-informatique (mapping sur le transcriptome 454 ci-dessus ; analyse des SNPs) III. Analyse du transcriptome du lépidoptère Spodoptera sp. dans 10 conditions différentes (RNA seq) III.1. Banque ADNc (10 échantillons) à partir d’ARN totaux III.2 option A. Séquençage Illumina 36 bases : 1 séquençage (2 échantillons/séquençage) + 8 séquençages (1 échantillon/séquençage) III.2 option B. Séquençage Illumina 36 bases : 3 séquençages (2 échantillons/séquençage) + 4 séquençages (1 échantillon/séquençage) III.3. Analyse bio-informatique (mapping sur 2 transcriptomes 454 déjà disponibles et sur 1 génome) IV. Analyse des petits ARNs du lépidoptère Spodoptera sp. dans 2 conditions différentes IV.1. Banque miRNA (15-50 bases) à partir d’ARN totaux IV.2. Séquençage Illumina 36 bases : 1 séquençage (2 échantillons/séquençage) IV.3. Analyse bio-informatique (mapping sur 2 transcriptomes déjà 454 disponibles et sur 1 génome) L’attendu est un nombre suffisant de lectures permettant une quantification relative des transcrits présents dans les échantillons. Proposer un devis en respectant les 4 parties de façon distincte. Pour la partie 2, le candidat indiquera le montant de base et montant pour chaque option. Lieu de livraison : UMR1231 (BIVI) Université Montpellier 2 - Case Courrier 101 -Place Eugène Bataillon -34 095 Montpellier Cedex 5 Date souhaitée pour la livraison des résultats : novembre 2010 Adresse où l’on peut retirer un dossier (le cas échéant) : Sans objet. Le texte de la publicité et la déclaration du candidat (DC5 à remplir et à joindre à l’offre) sont joints à la présente. Remise des candidatures/offres (à préciser) et date limite de remise : L'adresse où doivent parvenir les offres est la suivante : UMR1231 (BIVI) Université Montpellier 2 - Case Courrier 101 -Place Eugène Bataillon -34 095 Montpellier Cedex 5 Date limite de remise des offres : 13 août 2010 avant 16 H 00. Critères de sélection : Valeur technique (40%) note sur 20 Prix (30%) note sur 20 Délai de livraison des résultats (30%) note sur 20 Contact principal : Pour les questions d’ordre technique : Nathalie VOLKOFF – Tél. : +33 (0)4 67 14 41 18 – Fax : +33 (0)4 67 14 42 99 – Courriel : [email protected] Autre contact (nom, prénom, adresse, tel, fax, courriel) : D’ordre administratif : Tél : 04.99.61.27.67 – Fax :04.99.61.30.48 – Courriel : [email protected]