Obtention d`un assemblage de référence par séquençage de

TEXTE DE LA PUBLICITE
Titre :
Séquençage et assemblage d un génome de référence chez la processionnaire du pin pour CBGP
Objet détaillé :
Obtention d'un assemblage de référence par séquençage de novo, notamment via le développement
et séquençage de banques génomiques de type mate pair ou équivalent (tailles d'inserts 3 kb)
utilisant des techniques haut-débit chez la processionnaire du pin Thaumetopoea pityocampa
(Lepidoptera).
Unité administrative :
UMR 1062 CBGP
Code référentiel inter EPST :
52 GAZ POUR LA CHIMIE, LA BIOCHIMIE, LA BIOLOGIE ET SERVICES CONNEXES
Caractéristiques du besoin (description, lieu d’exécution, durée, volume, etc.) :
Département de publication : 34
Services
- Nom et adresse officiels de l'organisme acheteur : EPST INRA.
Correspondant : M. le président de Centre, 2 place Pierre Viala, 34060 Montpellier Cedex 2.
Caractéristiques principales :
Obtention d'un assemblage de référence par séquençage de novo, notamment via le développement et
séquençage de banques génomiques de type mate pair ou équivalent (tailles d'inserts ≥ 3 kb) utilisant des
techniques haut-débit chez la processionnaire du pin Thaumetopœa pityocampa (Lepidoptera)
Quantités (fournitures et services), nature et étendue (travaux) : montant :
Minimum 30 000 euros HT
Maximum 45 000 euros HT
Tous les renseignements d’ordre technique sont indiqués dans le cahier des charges joint.
Date souhaitée pour la livraison : décembre 2012 pour les prestations de séquençage, été 2013 pour
l'obtention de l'assemblage de référence
Refus des variantes.
Durée du marché ou délai d'exécution : 12 mois à compter de la notification du marché.
Date prévisionnelle de début des prestations (fournitures/services) : 24 septembre 2012.
Les candidatures et les offres seront entièrement rédigées en langue française ainsi que les documents de
présentation associés.
Unité monétaire utilisée, l'euro.
Autres renseignements demandés :
le candidat devra produire à l'appui de son offre :
- la présentation de l'organisation spécifique qui sera mise en place pour assurer la gestion administrative
et la réalisation technique des prestations (moyens humains et techniques) ;
- les prix unitaires (ces prix tiendront compte de la prise en charge des échantillons par le prestataire) ;
- les délais de prise en charge des échantillons après réception et les délais d'exécution.
Adresse auprès de laquelle les documents peuvent être obtenus : inra.
Correspondant : valérie paya, tél. : 04-99-61-28-35, télécopieur : 04-99-61-30-48, courriel : marches-inra
at supagro.inra.fr.
Négociation : NON
Adresse où l’on peut retirer un dossier (le cas échéant) :
Le cahier des charges, le texte de la publicité, la lettre de candidature (DC1) et la déclaration du candidat (DC2) - à
remplir et à joindre à l’offre - sont joints à la présente.
Remise des candidatures/offres (à préciser) et date limite de remise :
L'adresse où doivent parvenir les offres est la suivante :
INRA CBGP Carole Kerdelhué - Campus International de Baillarguet, CS30016, F-34988 Montferrier-sur-Lez
cedex, France
Date limite de remise des offres : 03 septembre 2012 avant 16 H 00.
Critères de sélection :
Offre économiquement la plus avantageuse appréciée en fonction des critères énoncés ci-dessous avec
leur pondération.
- valeur technique : appréciée en fonction des garanties de qualité sur les séquences fournies et de la
stratégie d'analyse bio-informatique et la stratégie de production des données : 70 %;
- prix : 15 %;
- délais de livraison : 15 %.
Contacts principaux :
D’ordre technique : KERDELHUE Carole - Tél : +33(0)4 30 63 04 35 Fax : +33(0)4 99 62 33 45 Courriel :
carole.kerdelhu[email protected]r
Autre contact (nom, prénom, adresse, tel, fax, courriel) :
GAUTIER Mathieu - Tél : +33(0)4 99 62 33 31 Fax : +33(0)4 99 62 33 45 Courriel :
mathieu.gautier@supagro.inra.fr
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