Séance 5, communication nerveuse séance de tp sur la

Séance 5, communication nerveuse séance de tp sur la morphine
Rendre l’exercice de la séance dernière et leur le donner à compléter pour la semaine suivante.
TP sur rastop
TP : La modulation du message douleur (nociceptif)
Le message douleur passe par des nerfs qui arrivent dans la moelle épinière.
Les neurones des fibres sensitives (conduisant les sens et la douleur) font des relais
synaptique dans la moelle épinière. Au niveau de ces synapses des molécules : des
neurotransmetteurs sont libérés.
A quoi ressemblent ces neurotransmetteurs ?
1. Les enképhalines
Lancer le logiciel RASTOP en double cliquant sur l’icône
Ouvrir le fichier metenk.pdb présent sur le bureau.
La molécule apparaissant est une enképhaline : neurotransmetteur libéré au niveau de la
moelle épinière par certain neurones.
Cliquer molécule puis sur séquence. Dans une fenêtre apparaît la séquence de cette molécule
c'est-à-dire le nom des acides aminés qui la compose. Il est aussi possible de déplacer la
souris sur la molécule et le nom des acides aminés apparaît en bas. A partir de la fiche sur les
acides aminés dites quels sont les acides aminés qui composent cette molécule et le nombre
d’acide aminé total.
Y tyrosine, G Glutamine, G, F Phénylalanine, M Méthionine. 5 acides aminés.
2. La morphine
La morphine (extraite d'une plante, le pavot Papaver somniferum) est le plus vieux remède
connu par l'homme pour lutter contre la douleur. Le principe actif de l'opium fut découvert par
F. Sertuner (1805) et baptisé morphine en référence à Morphée, le dieu grec des rêves. A
partir de 1952, on a su réaliser la synthèse chimique de la morphine, puis d'autres molécules
très voisines.
Ouvrir le fichier morphine.pdb.
Cette molécule est-elle une protéine? (Justifier votre réponse)
Cette molécule n’est pas un acide aminé car il n’y a pas de séquence reconnu, ce sont des
atomes assemblés quine forment pas des acides aminés.
3. Comparaison morphine enképhaline
Dans le menu Fenêtres cliquer sur un affichage par Mosaïque verticale. Les deux molécules
s'affichent côte à côte (enképhaline et morphine).
Ces deux molécules ont-elles des formes globalement semblables ?
Les deux molécules sont très différentes.
Regardons de plus près s'il n'y a pas une partie de chacune des deux molécules
qui soit semblable.
Afficher les deux molécules en boules et bâtonnets en cliquant sur l’icône
Faire tourner la molécule de morphine de façon à bien voir les atomes de carbone C1 à C6 qui
forment un cycle, le numéro des carbones apparaît en bas en se déplaçant avec la souris sur la
molécule.
Faire tourner la molécule d’enképhaline de façon à bien voir le cycle de carbones de la
tyrosine (TYR1) le nom de l’acide aminé apparaît en bas en déplaçant la aussi la souris sur la
molécule.
Conclusion sur les éventuelles ressemblances ?
C4, 3, 2 O24
La molécule de met enképhaline est représentée ci-dessous. Entourer la partie commune avec
la molécule de morphine. Imaginer la partie du récepteur sur laquelle s'adapte la partie
semblable des deux molécules :
Imaginer la forme du récepteur sur lequel cette molécule est reconnue.
Sachant que la morphine calme la douleur, déduisez des observations précédentes le rôle des
enképhalines libérées naturellement dans certaines synapses.
La morphine calme les douleurs et elle possède une partie semblable aux enképhalines. Donc
les enképhaline ont certainement le même rôle : d’apaiser la douleur. Le système nerveux est
donc lui-même capable de s’apaiser lui-même.
Correction TP : La modulation du message douleur (nociceptif)
1. Les enképhalines
Y tyrosine, G Glycine, F phénylalanine, M méthionine, 5 acides aminés au total.
2. La morphine
Cette molécule est-elle une protéine? (Justifier votre réponse)
Cette molécule n’est pas un acide aminé car il n’y a pas de séquence reconnu, ce sont des atomes assemblés
quine forment pas des acides aminés.
3. Comparaison morphine enképhaline
Ces deux molécules ont-elles des formes globalement semblables ?
Les deux molécules sont très différentes.
Conclusion sur les éventuelles ressemblances ?
C4, 3, 2 O24
La molécule de met enképhaline est représentée ci-dessous. Entourer la partie commune avec la molécule de
morphine. Imaginer la partie du récepteur sur laquelle s'adapte la partie semblable des deux molécules :
Sachant que la morphine calme la douleur, déduisez des
observations précédentes le rôle des enképhalines libérées
naturellement dans certaines synapses.
La morphine calme les douleurs et elle possède une partie semblable aux enképhalines. Donc les enképhaline ont
certainement le même rôle : d’apaiser la douleur. Le système nerveux est donc lui-même capable de s’apaiser
lui-même.
Enképhaline
Morphine
TP : La modulation du message douleur (nociceptif)
Le message douleur passe par des nerfs qui arrivent dans la moelle épinière.
Les neurones des fibres sensitives (conduisant les sens et la douleur) font des relais
synaptiques dans la moelle épinière. Au niveau de ces synapses des molécules : des
neurotransmetteurs sont libérés.
A quoi ressemblent ces neurotransmetteurs ?
1. Les enképhalines
Lancer le logiciel RASTOP en double cliquant sur l’icône
Ouvrir le fichier metenk.pdb présent sur le bureau.
La molécule apparaissant est une enképhaline : neurotransmetteur libéré au niveau de la
moelle épinière par certain neurones.
Cliquer molécule puis sur séquence. Dans une fenêtre apparaît la séquence de cette molécule
c'est-à-dire le nom des acides aminés qui la compose. Il est aussi possible de déplacer la
souris sur la molécule et le nom des acides aminés apparaît en bas (cf fiche avec les acides
aminé).
Dire à partir de la fiche sur les acides aminés dites quels sont les acides aminés qui
composent cette molécule et le nombre d’acide aminé total.
2. La morphine
Ouvrir le fichier morphine.pdb.
Cette molécule est-elle une protéine? (Justifier votre réponse)
3. Comparaison morphine enképhaline
Dans le menu Fenêtres cliquer sur un affichage par Mosaïque verticale. Les deux molécules
s'affichent côte à côte (enképhaline et morphine).
Ces deux molécules ont-elles des formes globalement semblables ?
Regardons de plus près s'il n'y a pas une partie de chacune des deux molécules qui soit
semblable.
Afficher les deux molécules en boules et bâtonnets en cliquant sur l’icône
Faire tourner la molécule de morphine de façon à bien voir les atomes de carbone C1 à C6 qui
forment un cycle, le numéro des carbones apparaît en bas en se déplaçant avec la souris sur la
molécule.
Faire tourner la molécule d’enképhaline de façon à bien voir le cycle de carbones de la
tyrosine (TYR1) le nom de l’acide aminé apparaît en bas en déplaçant la aussi la souris sur la
molécule.
Conclusion sur les éventuelles ressemblances ?
La morphine (extraite d'une plante, le pavot Papaver somniferum) est le plus vieux remède
connu par l'homme pour lutter contre la douleur. Le principe actif de l'opium fut découvert par
F. Sertuner (1805) et baptisé morphine en référence à Morphée, le dieu grec des rêves. A
partir de 1952, on a su réaliser la synthèse chimique de la morphine, puis d'autres molécules
très voisines.
La molécule de met enképhaline est représentée ci-dessous. Entourer la partie commune
avec la molécule de morphine
Imaginer la forme du récepteur sur lequel cette molécule est reconnue en le dessinant à
coté de la molécule d’enképhaline ci-dessus.
Sachant que la morphine calme la douleur, déduisez des observations précédentes le rôle
des enképhalines libérées naturellement dans certaines synapses.
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