TP 1ere S La diversité des phénotypes Le 17/11/2008 D’après Nussbaumer modifié par Patalano. Lorsque l’on regarde une même famille, on est étonné de voir que deux parents peuvent donner naissance à des enfants aussi différents. De même, la variabilité des caractères dans une même espèce, comme la notre, est presque infini. Nous savons que les caractères dépendent des gènes, un gène donne en général un caractère. Pour la couleur des yeux, la variation est incroyable : on parle de phénotypes alternatifs (de phénos : ce qui se voit).On s’intéresse aujourd’hui a ce qui fait la diversité des phénotypes et non aux gènes responsables de la formation de ces caractères. 1 Comment peut-on expliquer toutes les variantes d’un même caractère ? Avant de commencer le TP proprement dit, vous allez tester vos connaissances (de la classe de troisième !) en allant sur le site suivant : http://pagespersoorange.fr/jourdan.eric/log/genetiq.htm Ouvrez le logiciel « genetice3 » Suivez les consignes et testez vos connaissances en génétique. 2 1-Observation du phénotype à différentes échelles : 1.1-Différents phénotypes pour une même échelle chez la Drosophile -Observez les Drosophiles de la souche sauvage, notée [+] ; notez la couleur des yeux, la couleur du corps et la longueur des ailes. -Observez successivement les Drosophiles des souches [vg], [w], [eb] et [vg-eb] ; notez leur phénotype. -A quelle échelle observe-t-on ces phénotypes ? A l’échelle de l’organisme/de l’organe/de la cellule/ ou de la molécule…choisissez la bonne réponse en la justifiant. 3 1.2-La drépanocytose : un même phénotype à différentes échelles. -A partir du texte de l’annexe 1, donnez les caractéristiques de la maladie à l’échelle de l’organisme, de l’organe, de la cellule ou de la molécule. -Montrez qu’une de ces échelles conditionnent les autres. -Observez le sang d’un individu sain et d’un individu malade au microscope (x600 environ, attention à ne pas casser de lame, soyez perspicace !). -Réalisez un dessin d’observation. 4 Si vous ne voyez rien, allez sur le logiciel ANAGENE/ programme et documents ou ouvrez l’annexe 2. 2-Le support moléculaire du phénotype L’étude est réalisée à partir de l’exemple de la Drépanocytose. La maladie est liée à un défaut de la protéine hémoglobine : quel est ce défaut ? 5 2.1-Qu’est-ce qu’une protéine ? 1-Comparez le structure d’une protéine et d’un glucide à l’aide de l’annexe 3. 2-Montrez l’importance des chaînes latérales dans le repliement à partir de l’analyse des documents de l’annexe 4 L’hémoglobine est la protéine la plus abondante dans le cytoplasme des hématies. La molécule d’hémoglobine (notée Hb) est formée de 4 quatre chaînes polypeptidiques : deux chaînes alpha et deux chaînes bêta. Chaque chaîne est un polymère formé d’un enchaînement d’acides aminés. 6 2.2-Etude d’une électrophorèse des hémoglobines : -Lisez le principe de la technique dans l’annexe 5 -Voyez un exemple de résultats dans ANAGENE/programme et documents. -Interprétez ces résultats. 2.3-Comparaison des chaînes bêta HbA (chaîne normale) et HbS (chaîne anormale) -La comparaison des séquences d’acides aminés peut se faire à l’aide d’ANAGENE : HbA étant beta.pro et HbS étant drep.pro : ouvrez ces deux séquences. -Relevez les différences entre les deux molécules. 7 2.4-Structure dans l’espace (=tridimensionnelle) des hémoglobines : -Comparez la structure de ces deux molécules au niveau de leur tétramère grâce à ANAGENE. -Quelle relation est ainsi mise en évidence ? -A partir de ces données, comment peuton expliquer le phénotype cellulaire ainsi que le phénotype à l’échelle de l’individu ? 8 4-Un exemple de phénotype alternatif : les Thalassémies. Les Thalassémies sont des maladies génétiques que l’on trouve surtout sur le pourtour de la méditerranée (d’où leur nom, Thalassa=mer) et dont les manifestations cliniques sont une anémie mortelle à moyen terme. On a analysé la séquence en acides aminés de la chaîne bêta de l’hémoglobine de 8 personnes atteintes de Thalassémies. Dans ANAGENE, ces séquences sont notées tha1.Pro jusqu’à tha 8.Pro -Comparez chacune de ces séquences à celle de la chaîne présente chez un 9 individu sain et dressez un tableau comparatif des différentes séquences des chaînes bêta de l’hémoglobine responsables des thalassémies. Synthèse : De quoi dépend le phénotype d’un être vivant ? Comment peut-on expliquer la diversité des phénotypes au sein d’une même espèce ? 10