BTS ANALYSES DE BIOLOGIE MED. MICROBIOLOGIE 7. Infections communautaires et nosocomiales AFBB Page 1 Chapitre n°7 : Infections communautaires et nosocomiales 1. Distinction infection nosocomiale / infection communautaire Une infection est dite nosocomiale si elle apparaît au cours ou à la suite d'une hospitalisation et si elle était absente à l'admission à l'hôpital. Lorsque la situation précise à l'admission n'est pas connue, un délai d'au moins 48 heures après l'admission (ou un délai supérieur à la période d'incubation lorsque celle-ci est connue) est communément accepté pour distinguer une infection nosocomiale d'une infection communautaire. Pour les infections du site opératoire, on considère comme nosocomiales les infections survenues dans les 30 jours suivant l'intervention ou s'il y a mise en place d'une prothèse ou d'un implant, dans l'année qui suit l'intervention. Le tableau 1 met en évidence les différents classements des infections en fonction du lieu d’acquisition : INFECTIONS ASSOCIEES AUX SOINS (IAS) INFECTIONS SANS RAPPORT AVEC UN SOIN INFECTIONS INFECTIONS LIEES AUX NOSOCOMIALES SOINS EXTRA- INFECTIONS SANS RAPPORT AVEC UN SOIN (contractées en établissement HOSPITALIERES (contractées DELIVRE PAR UN PROFESSIONNEL DE SANTE de santé) chez un professionnel de santé) IAE* INFECTIONS COMMUNAUTAIRES (acquises en dehors d’un établissement de santé) IAA* Tableau 1 * IAE : infection associée à l’environnement de soins * IAA : infection associée aux actes de soins 2. Notions d’épidémiologie 2.1. Définitions L’épidémiologie est la science qui étudie l’apparition, les déterminants, la distribution et le contrôle de la santé et de la maladie dans une population humaine définie. Une épidémie est l’apparition soudaine d’une maladie qui connaît une extension rapide chez un grand nombre d’individus (exemple : SIDA, grippe aviaire…). Une endémie est une maladie persistant dans une région donnée, à un niveau régulier de la population (exemple : paludisme). Une pandémie est l’apparition d’une maladie au sein d’une large population, se propageant d’un continent à l’autre et pouvant couvrir toute la planète (exemple : SIDA, grippe des années 60…) Lorsqu’une épidémie atteint une espèce animale, le terme « épizootie » est parfois employé (exemple : grippe aviaire…). Une zoonose est une maladie animale transmissible à l’homme (exemple : rage, brucellose…). BTS ANALYSES DE BIOLOGIE MED. MICROBIOLOGIE 7. Infections communautaires et nosocomiales AFBB Page 2 2.2. Mesure de fréquences 2.2.1. Mortalité et morbidité La mortalité d'une maladie est le nombre de décès dus à cette maladie rapporté au nombre de patients atteints dans une population donnée (nombre de décès / nombre de cas de la maladie). La morbidité est le nombre de personnes souffrant d'une maladie donnée dans une population. L'incidence et la prévalence sont deux façons d'exprimer la morbidité d'une maladie. 2.2.2. Prévalence (P) et incidence (I) A un moment donné, la prévalence d'une maladie est la proportion des individus atteints de la maladie étudiée par rapport au nombre total d'individus (malades et non malades) dans la population étudiée. Pendant un intervalle de temps donné, l'incidence d'une maladie est la proportion de nouveaux cas de la maladie étudiée par rapport au nombre total d'individus présents dans la population étudiée. 2.3. Epidémiologie des maladies infectieuses Une maladie infectieuse est due à des agents pathogènes tels que des prions, des virus, des bactéries, des mycètes, des protozoaires ou des helminthes, qui peuvent être transmis d’un hôte à un autre. Les conséquences de cette maladie peuvent être diverses (bénignes, sévères, mortelles). Le cycle d’une maladie infectieuse est décrit par les facteurs de l’hôte et de l’environnement qui favorisent le développement de la maladie au sein d’une population. Les épidémiologistes doivent établir une corrélation entre une maladie infectieuse reconnue et l’agent infectieux qui en est responsable. Cet agent infectieux doit être isolé puis identifié. Une épidémie de maladie infectieuse se manifeste habituellement par un accroissement rapide du nombre de cas de la maladie dans une population donnée. Deux types majeurs d’épidémie sont reconnus : épidémie liée à une source commune Elle est caractérisée par un accroissement brutal du nombre d’individus infectés suivi d’un déclin rapide (exemple : intoxication alimentaire ou liée à la consommation d’une eau contaminée). épidémie par propagation Elle se manifeste par une augmentation plus lente du nombre d’individus infectés, suivie d’un déclin progressif. Elle résulte de l’introduction d’un individu infecté dans une population sensible (exemple : épidémie de varicelle dans une école). BTS ANALYSES DE BIOLOGIE MED. MICROBIOLOGIE 7. Infections communautaires et nosocomiales AFBB Page 3 2.4. Paramètres de l’étude épidémiologique des maladies infectieuses 2.4.1. L’agent pathogène La cause exacte de la maladie doit être établie (étiologie). 2.4.2. Le réservoir Il s’agit du lieu où l’agent pathogène est normalement retrouvé et à partir duquel l’infection de l’hôte peut se produire. Ce réservoir peut être environnemental, animal ou humain. Lorsque le réservoir est humain, ce sont les porteurs qui sont à l’origine de l’infection des autres personnes. Il existe plusieurs types de porteurs (en incubation, actif, convalescent, asymptomatique). 2.4.3. La transmission (Cf. 3.) La transmission d'une maladie infectieuse est le moyen de passage de l’agent pathogène du réservoir vers l’hôte. 2.4.4. L’hôte La sensibilité de l’hôte dépend du pouvoir pathogène de l’agent infectieux, et des mécanismes de défense non spécifiques et spécifiques de l’hôte. Le cycle infectieux est bouclé par la sortie de l’agent pathogène hors de l’hôte, par les selles, la salive ou par un vecteur. 3. Voies de contamination de l’organisme humain par les agents pathogènes La contagion correspond à l'excrétion et à la dissémination des germes responsables de la maladie. Cette contagion se déroule avec un délai d'incubation spécifique à chaque maladie infectieuse. 3.1. Transmission directe 3.1.1. Par contact La transmission interhumaine ou contagion peut se faire directement quand il existe un contact cutané entre un porteur et une personne non infectée (herpès), ou par les sécrétions (SIDA, MNI). La contamination par contact avec un animal domestique ou sauvage malade est également possible (mais le terme « contagion » ne s'applique pas au cas où le germe est transmis par un animal). 3.1.2. Par voie aérienne Ce type de contagion se fait essentiellement par inhalation des gouttelettes d’aérosols (toux, éternuements) ou les poussières qui véhiculent les agents pathogènes, notamment les virus (grippe, rougeole, varicelle…). BTS ANALYSES DE BIOLOGIE MED. MICROBIOLOGIE 7. Infections communautaires et nosocomiales AFBB Page 4 3.2. Transmission indirecte 3.2.1. Par vecteur passif La contagion se fait indirectement quand celle-ci a lieu par un intermédiaire jouant le rôle du transporteur de germe responsable de la maladie. Ce contage peut être une boisson, un aliment, des urines ou des excréments contaminés, la literie, un instrument (brosse à dents, matériel chirurgical, outil de cuisine…). Le choléra, l'amibiase, l’hépatite A et la poliomyélite sont le résultat d'une contagion indirecte. 3.2.2. Par vecteur actif Il peut s’agir transmission externe ou interne par les animaux (puces, moustiques, poux, tiques…). 4. Exemples La coqueluche présente une durée moyenne d'incubation d'environ 8 jours, une durée de contagion de 6 jours allant d'avant les quintes de toux à 5 semaines après l'apparition des symptômes. La durée habituelle de la maladie est d'environ un mois. La fièvre typhoïde a une durée moyenne d'incubation de 9 à 21 jours. Sa période de contagion va de 2 jours avant l'apparition des symptômes jusqu'à ce que les prélèvements de bactéries soient négatifs. La durée habituelle de la maladie est de 1 mois. La grippe a une durée moyenne d'incubation de 1 à 3 jours. Le début des symptômes dure jusqu'au troisième jour de la maladie (contagion). La durée habituelle de la maladie varie de 7 à 10 jours. La méningite à méningocoque a une durée d'incubation de 4 à 5 jours. La période de contagion est de quelques jours et est raccourcie par la prise d'antibiotiques. La durée habituelle de la maladie est d'environ douze jours. La rougeole a une durée d'incubation de 10 à 14 jours. La période de contagion de la rougeole va de 6 jours avant l'éruption (apparition des boutons) jusqu'à 5 jours après la disparition de la fièvre. La durée habituelle de la maladie est d'environ 10 à 15 jours. La rubéole à une durée moyenne d'incubation de 8 jours à 15 jours. Sa période de contagion va de 5 jours avant à 5 jours après l'éruption. La durée habituelle de la maladie et de 1 à 3 jours. La tuberculose pulmonaire a une durée moyenne d'incubation de plusieurs années. La période de contagion dure tant que le malade est porteur du bacille de Koch. Cette période dure en général les trois premières semaines pendant lesquelles le patient reçoit un traitement. La durée habituelle de la maladie varie de 6 à 12 mois. La varicelle a une durée moyenne d'incubation de 14 jours. Sa période de contagion va de 1 à 7 jours après l'éruption. La durée habituelle de la maladie varie de 8 à 10 jours.