Stage proposé par Valérie GRANDJEAN Chargée de Recherche INSERM Nom et adresse du Laboratoire ou de l’Unité : Téléphone : 04 92 07 64 09 Mail : [email protected] Site internet : http://ibv.unice.fr Directeur du Laboratoire ou de l’Unité : Stéphane Noselli Intitulé de l ‘équipe d’accueil : Hérédité épigénétique transmise par le gamète mâle Prénom et NOM du Responsable de l’équipe : Minoo Rassoulzadegan Résumé du thème de recherche de l’équipe (une dizaine de lignes maximum) Un être vivant hérite de ses parents deux types d’informations, toutes les deux primordiales pour le développement normal de l’embryon et de l’individu. Ces deux informations sont l’information génétique basée sur l’ADN et l’information épigénétique, basée sur des modifications qui ne sont pas associées à des changements de la séquence nucléique de la molécule d’ADN mais résultent de modifications de celle-ci. Récemment, nous avons montré au laboratoire que le génome mâle portait une information épigénétique héréditaire essentielle pour le développement normal de l’embryon et que l’un des vecteurs de cette hérédité étaient les molécules d’ARN. Nous avons ainsi montré que l’ARN apporté par le spermatozoïde dans l’œuf pouvait modifier l’expression des gènes dans l’embryon précoce, que cette modification se maintenait chez l’adulte et point important était transmise aux futures générations. Titre du projet de stage : Prénom, NOM, téléphone et adresse e-mail du Responsable du stage: Valérie Grandjean, 04 92 07 64 09, [email protected] Projet de stage : Le projet de stage a pour objectif de développer des modèles murins pour des pathologies humaines dont les facteurs héréditaires sont encore imprécis, mais où des facteurs épigénétiques semblent impliqués. A ce titre, nous avons des résultats qui suggèrent fortement que le diabète ainsi que l’hypertrophie cardiaque seraient des pathologies dont l’hérédité pourrait être, en partie, associé à ce mécanisme. L’analyse de l’hérédité épigénétique induite par l’ARN présente un double intérêt : d’une part il permettra d’approfondir les connaissances mécanistiques sur un domaine en pleine expansion qui est la régulation de l’expression des gènes par les petits ARNs non codants et d’autre part de déterminer sa possible implication dans la transmission de pathologies rencontrés chez l’Homme. L’étudiant(e), en plus du développement conceptuel des projets de recherche, sera amené à maitriser différentes techniques essentielles dans le domaine de l’épigénétique et également dans le domaine de la génétique de la souris. Techniques mises en œuvre par le stagiaire : Biologie moléculaire : Extraction d’ARN, les PCR quantitatives, l’analyse des modifications d’histones par ChIP (Immunoprécipitation de la chromatine), et/ou analyse de la méthylation de l’ADN et de l’ARN (séquençage après traitement au bisulfite Génétique de la souris : manipulation d’embryons à des stades très précoces du développement, techniques de micro-injection dans des embryons au stade une cellule et microscopie à fluorescence. Autres informations: Publications du Responsable de stage au cours des 5 dernières années : 1. Ghanbarian H, Grandjean V, Cuzin F, Rassoulzadegan M. (2011) A network of Regulations by small Non-coding RNAs : the P-TEFb Kinase in Development and pathology. Front Genet. 2 : 95-98. Grandjean V, Gounon P, Wagner N, Martin L, Wagner KD, Bernex F, Cuzin F. & Rassoulzadegan M. (2009) RNA-mediated paramutation reveals a critical function of Sox9 in the early embryo Development 136(21): 3647-55. 2. Grandjean V, Rassoulzadegan M. (2009) Epigenetic inheritance of the sperm: An unexpected role of RNA. Gynecol Obstet Fertil. 37(6):558-61. 3. Wagner, K, Wagner, N., Ghanbarian, H., Grandjean, V., Gounon P, and Cuzin F and Rassoulzadegan M. (2008) RNA induction and inheritance of epigenetic hypertrophic cardiomyopathy in the mouse. Dev Cell. 14(6) : 962-9 4. Cuzin F, Grandjean, V. , and Rassoulzadegan M. (2008) Curr Opin Genet Dev. Apr;18(2):1936. 5. Grandjean, V. Yaman R, Cuzin F, Rassoulzadegan M. (2007) Inheritance of an Epigenetic Mark: The CpG DNA Methyltransferase 1 Is Required for De Novo Establishment of a Complex Pattern of Non-CpG Methylation. PLoS ONE. 2007 Nov 7;2(11):e1136. 6. Rassoulzadegan M., Grandjean, V. , Gounon P, and Cuzin F (2007) Inheritance of an epigenetic change in the mouse: a new role for RNA. Biochem Soc Trans. 35(Pt 3):623-5 7. Rassoulzadegan M., Grandjean, V. , Gounon P, and Cuzin F (2007) Sperm RNA, an "epigenetic rheostat" of gene expression" has been reviewed. Arch Androl. 53(5):235-8. 8. Rassoulzadegan M., Grandjean, V. , Gounon P, Vincent S, Gillot I and Cuzin F (2006) RNAmediated non- Mendelian inheritance of an inheritance of an epigenetic change in the mouse Nature 431, 469-474. 9. Yaman, R. and Grandjean, V. (2006) Timing of entry of meiosis depends on a mark generated by DNA methyltransferase 3a in testis. Mol Reprod Dev., 73, 390-397. Autres informations: Etudiants actuellement en thèse ou en M2 dans l’équipe d’accueil. Pour chaque étudiant indiquez le nom du responsable de thèse, l’année du début de la thèse et l’Ecole Doctorale de rattachement Hedia Benabdella, Responsable Minoo Rassoulzadegan, Ecole Doctorale de l’Université de Nice Jafar Kiani, Responsable Minoo Rassoulzadegan, Ecole Doctorale de l’Université de Nice Etudiants ayant préparé ou soutenu leur thèse ou leur M2 dans l’équipe d’accueil au cours des cinq dernières années. Pour chaque étudiant indiquez le nom du responsable de l’étudiant, l’année du début de la thèse et de fin de la thèse, l’Ecole Doctorale de rattachement et le devenir de l’étudiant. Marion Tillot (M2 2011) Responsable Valérie Grandjean. Actuellement en thèse Hossein Ghanbarian, (Thèse de 2005-2010) Co-responsables Minoo Rassoulzadegan Valérie Grandjean, Ecole Doctorale de l’Université de Nice. Actuellement Professeur à Téhéran Virginie Olive (Thèse de 2002-2007), Responsable François Cuzin Ecole Doctorale de l’Université de Nice, actuellement en stage Postdoctoral à Stanford. Actuellement en Post-doctoral (USA) Ruken Yaman (Thèse de 2001-2006), Co-Responsables Valérie Grandjean Minoo Rassoulzadegan, Ecole Doctorale de l’Université de Nice, actuellement en stage Post-doctoral (Japon). Aline Koechlin (M2 en 2008) Responsable Valérie Grandjean Christine Vannetti (M2 en 2007) Responsable Minoo Rassoulzadegan Actuellement Assistant Ingénieur au laboratoire. Frédérique Picot (M2 en 2007) Responsable Minoo Rassoulzadegan Cette proposition de stage s’adresse-t-elle spécifiquement à un étudiant scientifique, médecin ou vétérinaire ou bien est-il ouvert à tous les profils ? Ouvert à tous les profils Ce sujet peut-il donner lieu à une thèse ? Oui