Cytométrie en flux et microbiologie: intérêts, limites, domaines d

Cytométrie en flux et microbiologie:
intérêts, limites, domaines
d’applications
Marielle BOUIX
AgroParisTech-INRA
Journée thématique Microbiologie et Cytométrie - IPP 23 mars 2015

Les attentes en microbiologie
-- Combien ?Combien ?
-- Viable ?Viable ?
-- Qui ? Qui ?
--Quel Quel état cellulaire état cellulaire ??
-- Quelles fonctionnalités ?Quelles fonctionnalités ?
-- RapiditéRapidité
transcriptomique
(puces & qPCR)
protéomique
(2-DE)
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Caractéristiques de la CMF
-- Cellule par celluleCellule par cellule
-- QuantitativeQuantitative
--Multiparamétrique:Multiparamétrique:
-- taille, structure, taille, structure,
couleurs couleurs de fluorescencede fluorescence
-- RapiditéRapidité
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Microbiologie et CMF devaient se rencontrer !
-- Cellule par celluleCellule par cellule
-- QuantitativeQuantitative
--MultiparamétriqueMultiparamétrique
(fluorescences)(fluorescences)
Microbiologie
-- CombienCombien ??
-- Viable ?Viable ?
-- Qui ? Qui ?
-- Etat cellulaire Etat cellulaire
et et fonctionnalités?fonctionnalités?
-- RapiditéRapidité - Rapidité
Marqueurs de
fonctionnalités
Anticorps
Sondes
nucléiques
Cytométrie en flux
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Limitations du développement
- Taille des cellules microbiennes: 1 à 5-10 microns
- Les milieux de culture contiennent souvent des particules
=> bruit de fond proche des cellules
- Non adaptation des marqueurs pour Procaryotes
-> Disponibilité limitée d’Ac monoclonaux
- Diversité des formes microbiennes (cellules isolées,
chainettes, bourgeon, ….)
- Coût des appareils pour les laboratoires de microbiologie
(/Boite de pétri)
Journée thématique Microbiologie et Cytométrie - IPP 23 mars 2015