Microbiologie en Santé et l`Agriculture

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Un cours de microbiologie générale
Guy R. Knudsen, Ph.D., J.D.
Université d’Idaho
Moscow, Idaho, États-Unis
[e-mail]
Louise-Marie Dandurand, Ph.D.
Université d’Idaho
Moscow, Idaho, Etats Unis
[email protected]u
Microbiologie en Santé et l’Agriculture

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Table des matières
1. La science et la pratique de la microbiologie ........................................................................ 5
1a. La microbiologie c’est l’étude de quoi ? ........................................................................................... 5
1b. Le système métrique ............................................................................................................................... 5
1c. Questions pour vous aider étudier .................................................................................................... 6
1d. Réponses aux questions .......................................................................................................................... 7
2. La classification des organismes vivants et des virus......................................................... 8
2a. La classification des organismes vivants .......................................................................................... 8
2b. La diversité métabolique des procaryotes ................................................................................... 10
2c. La taille des microbes ............................................................................................................................ 11
2d. Questions pour vous aider étudier .................................................................................................. 12
2e. Réponses aux questions ....................................................................................................................... 15
3. Procaryotes: les Bactéries et les Archées .............................................................................. 16
3a. Les Archées .............................................................................................................................................. 16
3b. Les Bactéries ............................................................................................................................................ 17
3c. Questions pour vous aider étudier ................................................................................................. 19
3d. Réponses aux questions...................................................................................................................... 21
4. Eucaryotes: les Protistes, Plantes, Champignons, et Animaux ...................................... 22
4a. Les Protistes ............................................................................................................................................ 22
4b. Les Plantes ............................................................................................................................................... 24
4c. Les Champignons ................................................................................................................................... 25
4d. Les Animaux ........................................................................................................................................... 26
4e. Questions pour vous aider étudier. ................................................................................................ 28
4f. Réponses aux questions ....................................................................................................................... 33
5. Les Virus ............................................................................................................................................ 35
5a. La structure et la fonction des virus ................................................................................................ 35
5b. Questions pour vous aider étudier. ................................................................................................ 36
5c. Réponses aux questions ...................................................................................................................... 37

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6. La Génétique Microbienne......................................................................................................... 38
6a. Matériel génétique, et comment il est transféré ........................................................................ 38
6b. Questions pour vous aider étudier. ................................................................................................ 39
6c. Réponses aux questions ...................................................................................................................... 40
7. Les Habitats Microbiens ............................................................................................................. 41
7a. Habitats ...................................................................................................................................................... 41
7b. Questions pour vous aider étudier. ................................................................................................. 43
7c. Réponses aux questions ...................................................................................................................... 44
8. Microbes Non-Pathogènes Associés aux Animaux ............................................................. 45
8a. Le microbiote des animaux ................................................................................................................ 45
8b. Questions pour vous aider étudier. ................................................................................................ 48
8c. Réponses aux questions ...................................................................................................................... 49
9. Maladies infectieuses des animaux causées par les microbes ...................................... 50
9a. Plusieurs maladies causées par des bactéries ............................................................................ 51
Le charbon ................................................................................................................................................... 51
Le cholera ..................................................................................................................................................... 52
La fièvre typhoide ..................................................................................................................................... 52
9b. Les maladies causées par les protistes ......................................................................................... 52
Le paludisme ............................................................................................................................................... 52
9c. Les maladies causées par des champignons ............................................................................... 54
9d. Les maladies provoquées par les helminthes ............................................................................ 54
9e. Les maladies causées par les virus ................................................................................................. 55
9f. Questions pour vous aider étudier. ................................................................................................. 56
9g. Réponses aux questions ...................................................................................................................... 62
10. Contrôle de microbes ................................................................................................................. 64
10a. Cinq catégories du contrôle de microbes .................................................................................. 64
10b. Questions pour vous aider étudier. ............................................................................................. 65
10c. Réponses aux questions ................................................................................................................... 66
11. La Phytopathologie ..................................................................................................................... 67
11a. La pathologie végétale ...................................................................................................................... 67

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11b. Quelques maladies des plantes importantes ........................................................................... 69
Maladie des raies noires (Cercosporiose noire, ou Sigatoka noir) des bananiers et
plantains ....................................................................................................................................................... 71
Fusariose du bananier, Fusariose des cucurbitacées .................................................................. 73
La Rouille du Café ...................................................................................................................................... 73
La pourriture molle bactérienne. ........................................................................................................ 74
Nématodes à galles ................................................................................................................................... 75
Nématodes à kystes .................................................................................................................................. 76
Virus des taches annulaires papaye ................................................................................................... 76
Virus de la mosaïque du tabac (TMV) ............................................................................................... 77
11c. Cinq catégories du contrôle des phytopathogènes : .............................................................. 78
11d. Questions pour vous aider étudier. ............................................................................................. 80
11e. Réponses aux questions ................................................................................................................... 84
12. Microbes dans l'environnement ............................................................................................ 86
12a. Introduction ........................................................................................................................................... 86
12b. Cycle de carbone ................................................................................................................................. 86
12c. Cycle de l’azote ..................................................................................................................................... 87
12d. Questions pour vous aider étudier. ............................................................................................. 88
12e. Réponses aux questions ................................................................................................................... 90
13. Le compostage .............................................................................................................................. 91
13a. Qu’est-que c’est le compostage ? .................................................................................................... 91
14. Références supplémentaires .................................................................................................. 92

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1. La science et la pratique de la microbiologie
1a. La microbiologie c’est l’étude de quoi ?
Qu’est-ce que c’est la microbiologie? C’est une sous-discipline de la biologie, consacrée à
l'étude des micro-organismes
Microbiologie est l'étude des organismes microscopiques, soit unicellulaires (une seule
cellule), multicellulaire (colonie cellulaire), ou acellulaire (manque cellules).
Microbiologie englobe de nombreux sous-disciplines tels que la virologie, mycologie,
parasitologie, et bactériologie.
La terme «microbiologie» vient de la langue grecque: mikros = «petit», bios = «vie», et logia
= «l'étude».
Quelle est la différence entre les termes « micro-organisme » et « microbe »? Les deux
termes sont à peu près synonymes.
1b. Le système métrique
1 km
= 1000 mètre (m)
1 m
= 1000 millimètre (mm)
1 cm
= 10 mm
1 mm
= 1000 micromètre (µm)
1 µm
= 1000 nanomètres (nm)
Général Toussaint Louverture, héros
de la révolution haïtienne, était
environ deux mètres de hauteur
(photo licence Wikimedia Commons)