Boidras Elodie 25/10/10 Mycologie Suite du Chapitre 6: Eumycètes Classe des Eu-Ascomycètes = Eu- Ascomycotina II. Classification 5. Les hémi-Ascomycètes a. Classe des Taphrinomycètes b. Classe des Saccharomycètes Ce sont des levures 80 genres, 600 espèces a) Caractéristiques p30: Ultrastructure d'une levure C'est un des organismes les plus étudiés au monde (simple) 1er eucaryote dont le génome a été entièrement séquencé. En 1992, il a fallu 35 laboratoires pour séquencer un chromosome. Il y a une division cellulaire toutes les 90 minutes. • Les divisions cellulaires sont bourgeonnantes: p30 ◦ bière: Saccharomyces cerevisiae ◦ vin: S. pastorianus, S. ellipsoïdeus → bourgeonnement apical des 2 côtés ◦ vinaigre: Mycoderma → bourgeonne sur le côté ◦ cidre: S. apiculatus → bourgeon apicaux en citron • Les divisions cellulaires peuvent être cloisonnantes: p30 ◦ fabrication des rhums: Schyzosaccharomyces sp. Les levures passent l'hiver dans le sol et en été, la multiplication végétative passe par des conidies qui sont emportées par le vent ou la poussière du sol. De cette manière, les levures se répandent partout et poussent dans des milieux différents. b) Les levures, modèle expérimental pour l'étude du cycle cellulaire Cycle: alternance de mitose – interphase → étude de la cycline B et du MPF (Mitose Performing Factor) Le MPF n'apparait que lors de la mitose, et la cycline B est présente durant l'interphase et disparaît au moment de la mitose. Le cycle cellulaire est contrôlé par une succession de gènes CDC (Cell Division Cycle) = protéine kinase cycline dépendante (protéine CDC28) 1 CYC: protéine kinase sous C → mécanisme en « oscillateur biologique » c) Les levures, modèle expérimental pour le contrôle des gènes eucaryotes • Contrôle du changement de type sexuel: 2 • Changement de signe chez la levure de la bière (S. Cerevisiae): Seule les levures de grande taille peuvent changer de signe. Les cellules filles sont plus petites que les cellules mère. Au niveau du chromosome 3 → modèle en cassette: locus HML α locus HMR α Changement de signe avec une fréquence de 60 à 80% d) Utilisation des levures Domaine de l'alimentation: ◦ boissons fermentées: vin, bière, cidre ex: levures « haute » (15-20°C) → S. ellipsoïdeus et S. pastorianus (vin) levures « basse » → S. uvarum var carlsbergensis (bière) ◦ laits fermentés ex: képhir du Caucase à base de Saccharomyces + bactéries lactiques. ◦ Pains, pâtisseries → S. cerevisiae levain → S. minor + bactéries • 3 ◦ Protéines d'origine unicellulaire (POU) Levures très riche en protéine et peuvent pousser sur beaucoup de substrats différents. Elles sont utilisées par les pays industrialisés. ◦ Sources d'enzymes ex: lactase pour hydrolyser le lactose du lait invertase pour la production de sucre pour les confitures, confiseries • Domaine pharmaceutique: ◦ Saccharomyces cerevisiae: riche en protéines, vitamines B et D ◦ S. boulardii: ultra-levure • Bioconversion • Génie génétique: ◦ protéines recombinantes: hormone de croissance humaine, insuline, vaccin contre l'hépatite B ◦ souche dites « K » (killeuse) ◦ Yeast Artificial Chromosome (YAC): permet le clonage ou expression de gènes eucaryotes 6. Fungi imperfecti = Deuteromycota = Champignons imparfait C'est un ensemble artificiel. Les champignons ne présentent pas de forme de reproduction sexuée connue. ͂O~ 20000 espèces Il n'y a pas de forme de reproduction sexuée connue parce que: • reproduction sexuée seulement sous certaines conditions. Penicillium (multiplication végétative), Eurotium (reproduction sexuée) • expèces considérées comme la forme haploïde d'un champignon hétérothallique (il manque le signe opposé) • tendance naturelle à perdre la reproduction sexuée: découverte fortuite, biologie moléculaire (étude les séquences nucléotidiques) → Ascomycètes, Basidiomycètes. a. Les pathogènes a) Exemple de phytopathogènes Monilia fructigena (Discomycètes) b) Exemple de pathogènes • • Histoplasma capsulatum: soigné par amphotéricine B. → décès des égyptoloques après ouverture des tombeaux. Candida albicans: localisé dans la bouche, langue. 4 c) Responsable de toxines (Penicillium produit des aflatoxines) Autres mycotoxines: les Trichothecenes produit par Trichothecium roseum, Fusarium sp, Cephalosporium sp, Mycothecium sp La plus redoutable: Trichothécène T2 qui inhibe la synthèse de protéine et d'ADN. b. Les imparfaits utiles Productions en bioréacteurs. • • • Antibiotiques: Céphalosporine (Cephalosporum acremonium) Médicaments: Cyclosporine (Tolypocladium inflatum) Agents de bioconversion: Fusarium sp, Tricothecium sp Classe des Eu-Basidiomycètes = Eu-Basidiomycotina Embranchement: Fungi C'est un groupe très diversifié, ~ 14000 espèces: • champignons microscopiques • champignons macroscopiques Champignons à filaments cloisonnés: dolipores, les gamètes ne sont pas flagellés. Présence d'un sporocyste spécialisé: la baside donnant des basidiospores. Basides et basidiospores: p33 • Archéobaside: la baside est cloisonnée. Chaque cellule va donner une basidiospore. 5 Ex: les auriculaires • Hétérobaside: baside cloisonné longitudinalement donnant le basidiospore. Ex: les tremelles • Homobasides: les basides ne sont pas cloisonnées. La majorité a 4 stérigmates. I. Reproduction 3 phases chez les Homobasidiomycètes. 1. Formation du mycélium primaire (phase fugace) 6 2. Formation du mycélium secondaire (phase pérenne) 3 possibilités de formation: • fusion d'un mycélium primaire et d'un conidiospore • fusion de 2 mycélium secondaire (notion de Perittogamie) • fusion du mycélium primaire et du mycélium secondaire (= phénomène Buller) → les mycéliums vont croitre à l'aide des amas. Durée de vie dans le sol: • à l'état saprophyte → quelques mois • en symbiose → plusieurs années Coupe de mycorhize: Le champignon ne peut pas se développer sans la plante (même en laboratoire), il prélève des sucres. La plante a une protection (contre les pathogènes et les nématode) et un apport d'éléments difficilement solubles: phosphore, zinc, manganèse, cuivre. Afin de faciliter les échanges entre le champignon et la plante, le champignon produit une chitinase qui réduit la paroi. Le champignon peut prélever jusqu'à 40% des produits de la photosynthèse. Environnement capte: • des métaux lourds • des poussières radioactives « rond de sorcière » = cercles où l'herbe est plus haute, dû au mycélium secondaire qui pousse radicalement. 7