Enzymologie (dernier cours :D) La classification des enzymes ;

Enzymologie (dernier cours :D)
La classification des enzymes ;
La spécificité d’action des enzymes permet de les dénommer et de les classer selon les
réactions qu’ils catalysent. Quelque enzymes ont reçu un nom commun tel que la trypsine,
la chymotrypsine, ou la papaïne (qui est encore utilisé).
Cependant la plupart des enzymes sont désignés en ajoutant le suffixe -ase au nom de
leur substrat.(Exemple : L’uréase catalyse l’hydrolyse de l’urée (substrat), l’arginase
l’hydrolyse de l’arginine, et la DNase la dégradation de l’ADN) ou à un terme décrivant la
réaction catalysée (Exemple : Glucose-6-Phosphate (G6P) déshydrogénase).
Les enzymes sont répartis selon le type de réaction qu’ils catalysent en 6 classes (elles
mêmes subdivisées en sous-classe permettant de mieux définir la fonction de chaque
enzyme :
1) Les oxydo-réductases catalysent les réactions de transfert d’électrons.
2) Les transférases catalysent les réactions de transfert d’atomes ou de groupement
d’atomes.
3) Les hydrolases catalysent les réactions de coupures de liaisons par l’eau.
4) Les lyases catalysent les réactions de coupure de liaisons d’une autre façon.
5) Les isomérases catalysent les réactions d’isomérisations.
6) Les ligases catalysent les réactions de créations de liaisons avec consommation
d’ATP.
Chaque enzyme a un numéro de code qui permet d’identifier la classe et les sous-classes
auquel il appartient.
Exemple : Nomenclature de l’enzyme catalysant la réaction :
cos e− phospho−transférase(=hexokinase)
D − glu cos e + ATP ⎯ATP−glu
⎯⎯⎯⎯⎯⎯⎯⎯⎯⎯⎯⎯
→ D − glu cos e6 − phosphate + ADP
Le nom systématique formé de cette enzyme est ATP-glucose-phosphotransférase.
On comprendra que cet enzyme catalyse le transfert d’un groupement phosphate de
l’ATP sur la molécule de glucose.
Il est classé dans la catégorie 2, et son numéro dans la classification est EC,2.7.1.1 - pas
à apprendre).
2 → Le premier chiffre correspond au nom de la catégorie (donc ici la transférase).
7 → Le second correspond à la sous-catégorie du phospho-transférase.
1 → Le troisième correspond à la sous-sous-catégorie du phospho-transférase avec un
hydroxyle comme accepteur).
1 → Le quatrième chiffre correspond au D-Glucose comme accepteur du phosphate.
Quand le nom systématique d’un enzyme est peu commode (trop long..etc) on peut parler
comme dans l’exemple d’hexokinase = en présence d’un sucre (hexo) et kinase (enzyme
de phosphorylation). Un nom trivial peut donc être utilisé.
Rajout : Les meilleurs médicaments sont ceux qui se rapprochent de l’état de transition