La grippe et Ebola

Définitions
Une épidémie est la propagation d'une maladie par contagion ou sans phénomène de
contagion qui touche un grand nombre de personnes dans une région bien définie.
Ou lors de l'augmentation d'une maladie à un endroit ou elle se trouvait déjà de façon
endémique (de façon constante ou périodique)
Une pandémie est la contagion d'une maladie qui s'étend à la quasi-totalité d'une population
au niveau d'un continent ou plusieurs continents, voire dans certains cas à l'échelle de la
planète.
Une endémie désigne la présence habituelle d'une maladie dans une région déterminée.
Une épizootie est un terme décrivant une épidémie frappant, dans une région plus ou moins
vaste, une espèce animale dans son ensemble.
Virologie
2 virus au cœur de l’actualité
Ebola et la Grippe
Filoviridae
2 membres dans la famille :
Marburg ==> 1 sous-type
Ebola
==>
4 sous-types :
EBOV-Zaire
EBOV-Soudan
EBOV-Reston- Philippine
EBOV-Côte d’Ivoire
Structure
• Aspect pléiomorphe
• Long filament allant jusqu’à 14µm de long et 80 nm de diamètre
Génome
- ARN négatif simple brin monocathénaire (≈19kb)
- Organisation génomique proche des Rhabdovirus et Paramyxovirus (ARN-)
Filoviridae
Clinique
•Fièvre hémorragique, céphalées, arthralgie, myalgie, diarrhée, toux sêche,
conjonctivite et prostration, atteinte nerveuse (prostration…)
• Mortalité de 2 à 10 jours
•Il existe quelques rares cas d'infection asymptomatique
•Les formes cliniques et les taux de mortalité ==> fonction des sous-types
• EBOV-Z et EBOV-S
==>
Formes fulminantes les plus fréquentes
un taux de mortalité de 50% à 90%
Filoviridae
Clinique
• Filovirus font peur:
- Pronostic le plus souvent défavorable
- Pas de vaccination
- Source initiale de contamination non connue
- Transmission par matériel médical
===> Les patients sont mis en quarantaine et attente des survivants
Filoviridae
Marburg
Filoviridae
MARBURG VIRUS
1967
•Virus isolé pour la première fois à Marburg (Allemagne), chez 1 technicien
de laboratoire travaillant sur des singes verts importés d’Ouganda.
• Même virus retrouvés chez les singes provenant du même envoi et
exportés à Francfort (Allemagne) et Belgrade (Yougoslavie).
• 25 cas de Marburg détectés dont 7 mortels
• 6 cas secondaires non mortels (Médecins et infirmières => piqûre accidentelle)
MARBURG VIRUS
Filoviridae
1975
• Johannesbourg (Afrique du Sud) 1 cas mortel de Marburg
===> sur 1 voyageur rentrant du Zimbabwe (ayant couché à la belle étoile).
• Sa compagne de voyage et l’infirmière atteints par le virus survivront.
1980 et 1987
• Localisé dans les deux cas à l’ouest du Kenya (grotte de Kitum)
pour les 2 cas 1 dénominateur commun:
-Visite de la grotte de Kitum
- Contact avec des chauve-souris
• Déjection de nombreux animaux dans la grotte :
==> de la chauve souris à l’éléphant
Filoviridae
Spéculations épidémiologiques sur l’écologie de MARV
Distribution:
-Afrique du Sud, de l’Ouest et Centrale
Epidémiologie :
- Quelques cas ==>
Les contacts entre les hôtes terminaux
(singes, hommes) et le réservoir naturel
de MAR sont rares
- Dénominateur commun aux 2 cas identifiés (1980&1987)
==> La visite de la grotte de Kitum
Filoviridae
Spéculations épidémiologiques sur l’écologie de MARV
1988… : Travaux dans la grotte de Kitum
•Présence déjections nombreuses espèces animaux sauvages
•Essais infection naturelle (babouins en cage dans la grotte)
==> Essais négatifs
•Recherche virus dans nombreux prélèvements ==> Négatif
•Sérologie: humains vivant à proximité de la grotte ==> MARV-séronégatifs
Filoviridae
Spéculations épidémiologiques sur l’écologie de MARV
Hypothèse1
•Espèce rare solitaire certainement peu chassée par l’homme
•Animal source doit être un habitant “transitoire” de la grotte (autres cas MARV
nonexposés à la grotte)
• Espèce peu en contact avec l’humain
• Similitudes avec certains Paramyxo- et Rhabdovirus (Génome, réplication,
épidémiologie, distribution...)
• MAR 1975, 1980 et 1987 séjours dans lieu infesté de chauve-souris
Recherche sur la chauve-souris
(Virémie et Sérologie)
==>
Nombreux prélèvements :
résultats négatifs à ce jour
Problèmes potentiels liés aux résultats négatifs:
•Réaction immunes chez la chauve-souris absentes ou transitoires
•Test d’immuno-détection trop peu sensible
•Virus pourrait être localisé spécifiquement dans certains tissus non explorés
(cf Mapuera virus -paramyxovirus- : présent uniquement dans les glandes salivaires
Filoviridae
Spéculations épidémiologiques sur l’écologie de MARV
Hypothèse 2
•cas de MARV 1975 : présence de piqûres d’insectes nonhématophage sur le patient
•rôle d’un arthropode non-hématophage dans la transmission de MARV?
==> recherche MARV sur araignée prélevée sur le site ==> négatif
Hypothèse 3
•rôle des rongeurs sauvages dans la transmission
du virus, car transmission
possible MARV sur des
animaux de laboratoire
Filoviridae
1998
Filoviridae
1998-2000
• Première flambée de grande ampleur naturelle
149 cas dont 123 mortels (83%)
• République du Congo => mine d’or de Durba
• Contamination directe => peu de transmission secondaire
• 7 souches virales différentes pendant les 2 ans
2004-2005
• Angola (province d’Uige)
=> 399 cas identifiés dont 335 fatals,
•75% des cas rapportés touchaient des enfants de < 5 ans.
Evolution lente à partir du cas initial
==> Transmission essentiellement par contact avec les fluides organiques,
==> Surtout transmission parentérale par réutilisation
d’aiguilles et de seringues pour plusieurs patients.
Filoviridae
Ebola
Filoviridae
EBOLA VIRUS
1976 -Epidémie de fièvre hémorragique au Soudan et au Zaïre =>
EBOV-S
-284 soudan, 318 au Zaire cas répertoriés
EBOV-Z
-430 morts (80% de mortalité au Zaïre et 53% de mortalité au Soudan)
1977 -1 cas diagnostiqué au Zaïre situé à 325km du foyer originel de 1976
1979 -Soudan même localisation qu’en 1976 EBOV-S
34 cas 22 morts 65% de mortalité
1989 - Episode de Reston (USA)=> EBOV-R
- Isolement d’une nouvelle souche Ebola sur des singes originaires des
Philippines et mis en quarantaine avant envois dans laboratoire de recherche.
- Souche qui décime les singes mais semble moins infectieuse pour l’humain
puisque plusieurs employés ont été infectés ==>pas de cas mortel.
Filoviridae
EBOLA VIRUS
1994 - Mise en évidence du 4ème sous-type Ebola chez une éthologiste suisse travaillant sur
des chimpanzés en Côte d’Ivoire => EBOV-CI
1995 - Epidémie d’Ebola au Zaïre à nouveau EBOV-Z
- 315 cas cliniques identifiés 80% de mortalité
1996 - Gabon 50 cas 50% de mortalité EBOV-Z (cuisine d’un chimpanzé mort)
1996 - 1997 - Gabon 60 cas 75% de mortalité EBOV-Z (contact avec des primates non
humains morts
2000 - 425 cas dont 224 morts en Ouganda, EBOV-S
2002 - 143 cas à l’ouest de la République du Congo dans les districts de Mbomo et de Kelle
health dont 129 morts. EBOV-Z
2003 - 35 cas 29 mortels, même région dans le district de Mbomo. EBOV-Z
2004 - Soudan 17 cas dont 7 mortels EBOV-S
Filoviridae
1976 Soudan Ebola-S
284
1976 Zaïre (DRC) Ebola-Z
318
1977 Zaïre (DRC) Ebola-Z
1
1979 Soudan Ebola-S
34
1994 Gabon Ebola-Z
52
1994 Côte d'Ivoire Ebola-Côte d'Ivoire 1
1995 Liberia Ebola-Côte d'Ivoire
1
1995 RDC (ancien Zaïre) Ebola-Z
315
1996 (jan.-avril) Gabon Ebola-Z
37
1996-1997 (juil.-jan.) Gabon Ebola-Z 60
1996 Afrique du Sud Ebola-Z
1*
2000-2001 Ouganda Ebola-S
425
2001-2002 Gabon Ebola-Z
65
2001-02 République du Congo Ebola-Z 59
2002-03 République du Congo Ebola-Z 143
2003 République du Congo Ebola-Z 35
2004 Soudan Ebola-S
17
Total
1 848
151
280
1
22
31
0
0
250
21
45
1
224
53
44
128
29
7
1 287
Filoviridae
Spéculations épidémiologiques sur l’écologie de EBOV
Distribution: Zaire, Soudan, Côte d’Ivoire, Philippines.
Pathogénicité:
• Virulence souches africaines > Virulence souches asiatiques
• Souches asiatiques réellement originaires d’Asie ou importation de singes?
Filoviridae
Spéculations épidémiologiques sur l’écologie de EBOV
Epidémiologie :
• Séroprévalence:
•En Centre Afrique dans certaines régions plus de 30% séropositifs EBOLA
•Chez homme et singes (Babouin, mandrills et chimpanzees- Leroy, JID- 2004)
• Etude épidémiologique:
•Augmentation de la prévalence chez les chasseurs
==>
Contacts directs avec réservoir ?
Grands singes ?
•Pour les cas récents ==>
Epidémie humaine toujours précédée par
épizootie chez les grands singes.
Grands Singes et Homme ===> hôtes terminaux
EBO-Z
Filoviridae
Spéculations épidémiologiques sur l’écologie de EBOV
Hypothèses
•Identiques aux hypothèses formulées pour MARV
•Contacts rares avec espèce réservoir rare: arthropodes, chauve-souris, rongeurs.
•Beaucoup de spéculations en cours d’évaluation
==> Aujourd’hui réservoir (source) du MARV et de EBOV
Toujours inconnu?
Filoviridae
Spéculations épidémiologiques sur l’écologie de EBOV
Hypothèses
•Identiques aux hypothèses formulées pour MARV
• Particularités pour EBOV :
• Il existe pour EBOV des séropositifs humains et singes.
Existence de souche apathogène?
==> mutation devient pathogène
EBOV retrouvé chez Babouins et Mandrills
==>
•sans pathologie (réservoir ?) (pas de cas
humains dans les territoire du nord lieu de
vie de ces singes)
•souche circulante depuis longtemps
•Epidémie précédée par une épizootie mais ≠ animaux (grands singes, gazelles…)
==> différentes souches d’EBOV possible?
Filoviridae
Spéculations épidémiologiques sur l’écologie de EBOV
Hypothèses
•Apport des études climatologiques et épidémiologiques récentes
-Climatologie et satellites ==> Nouvelles pistes pour le début de l’épidémie
==>
• Réservoir serait résidant des savanes : point de départ des épizooties
•A l’orée des forêts équatoriales
•Dans les savanes se transformant en forêt
•Dans les forêts déboisées se reconstituant
• Apparition des épizootie et des épidémies à la période des pluies.
• Importance des points d’eau
Nouvelles pistes pour identifier le réservoir
Lisière des forêts équatoriales
Proche des points d’eau
A la période des pluies
==>
contact entre hommes ou
grands singes et le réservoir?
Des rongeurs de savane sont positifs EBOV par RT-PCR
=> Controversé car pas de séroconversion de ces petits rongeurs
Filoviridae
Spéculations épidémiologiques sur l’écologie de EBOV
Hypothèses actuelles
• Retour à la chauve souris
- Chauves-souris frugivores et insectivores séropositives dans ces régions
d’épidémie.
- Réplication de EBOV-Z dans ces chauves-souris : forte virémie sans
pathologie
- Hypothèse pour EBOV-S et MARV, cas index à partir d’une grange à coton
Filoviridae
Spéculations épidémiologiques sur l’écologie de EBOV
Hypothèses actuelles
• Réservoir primates non humains
- EBOV circulant chez les singes sans pathologie
- Transmission pathologie chez les gorilles, chimpanzées et homme…
- MARV retrouvé aussi chez ces singes (séropositifs)
-Surveillance des primates non-humains: car pour 5 des épidémies d’Ebola
toujours forte mortalité chez les grands singes avant l’épidémie humaine
•Nouvelle hypothèse commune EBOV et MARV:
-Un filovirus de plante identifié récemment ==> Transmission ???
Influenzae
La grippe Humaine/ La grippe Aviaire ?
Influenzae
ORTHOMYXOVIRIDAE
Virus de la Grippe - Influenza Virus
Structure
- Particules sphériques de 100 à 200 nm de diamètre
- Glycoprotéine de surface H (Hemagglutimine) et N (Neuraminidase)
enchassées dans membrane lipidique ==>reconnaissance des récepteurs cellulaires (entrée dans la ¢)
- 2 autres protéines de membrane (protéine M1 et M2)
- la NP (Nucléoprotéine) entourant les fragments d’ARN
-Le génome : ARN de polarité négative fragmenté (8 ou7 fragments = Type A et B ou type C)
- Segment 4 => H; Segment 6 => N
- PA, pB1 et pB2 impliquée dans la réplication de l’ARNSegment
Protéine
1
PB2
Sous unité de la polymérase, Activités d’addition de la coiffe et d’endonucléase
2
PB1
Sous unité cataclytique de la polymérase
3
PA
Sous unité de la polymérase active pour la synthèse de l’ARN viral
4
HA
Hémagglutinine : attachement au récepteur cellulaire et fusion membranaire
5
NP
Nucléocapside : liaison à l’ARN viral pour constituer un complexe
ribonucléoprotéique (RNP)
6
NA
Neuraminidase : hydrolyse du récepteur lors du bourgeonnement de la particule
virale
7
M1
Protéine de matrice
M2
Canal à ions
NS1
Protéine non structurale 1, inhibitrice de la réponse en interféron
8
NS2 ou
NEP
Rôle(s) biologique(s)
Protéine non structurale 2, impliquée dans l’exportation extranucléaire des
complexes RNP
Influenzae
Diversité
• Génique :
- Homme confronté à H1, H2 et H3, et N1, N2 et N8.
- Chez les oiseaux aquatiques sauvages : H1 à H15 et N1 à N9.
• Espèces et tropisme :
- Oiseau hôte naturel
- Oiseaux marins, oiseaux sauvages (canard) et domestiques (poulet, canard)
-Les sous-types H5 et H7
=> Maladie aigue multi-tropisme
(respiratoire, digestif et nerveux)
-Autres sous-types
=> Infection pulmonaire asymptomatique.
- Mammifères marins, cheval, porc, chien, chat et homme
=> Tropisme pulmonaire
Influenzae
Types et sous-types
•Types A, B ou C
- Définis d’après la séquence de la NP (peu variable)
- 8 ou 7 fragments d’ARN génomiques ==> 8 : A et B; 7 : C
- Pouvoir pathogène ==> A > B > C
- Grippe sévère ==> Type A
• Sous-types
- Surtout pour A (le plus pathogène) où ils sont plus nombreux
- En fonction de H et de N : H1N1, H2N2, H3N1 ...
Influenzae
Bases moléculaires de la diversité
Influenzae
Variabilité des sous types
• Variabilité antigénique de H et de N
•Liée
==> à la structure du génome (fragmenté)
==> à la réplication du virus
•Les différents fragments sont libérés dans le cytoplasme,
• Répliqués dans le noyau,
• Assemblage final des particules par bourgeonnements
des membranes de la ¢ hôte
•3 types de variabilité :
•Recombinaison
•Glissement antigénique
•Réassortiment génétique
Variabilité
Influenzae
Glissement
•Mutations continuelles de l’ARNg dues à l’ARN polymérase ARN dépendante
(taux de mutations 1/106 ==>1000 X plus que RNA polymérase DNA dépendante).
•Génome de la grippe varie d’environ 1%/an
•mutations non létales sont conservées dans le temps ==> 5 ans ≈ 5%
Virion /Population
Mutations
Silencieuses
Pas d’effet sur le virion
Mutations
Létales
Perte du virion
Mutations
Bénéfiques
Avantage du virion
/ la population
Influenzae
Variabilité
Glissement
•Glissement antigénique
==> quand les mutations entraînent des changement dans la séquence
d’aa de H au niveau des régions antigéniques
==> échappement au système immunitaire (nécessité de surveiller
et de reformuler régulièrement le vaccin ).
Variabilité
Influenzae
Réassortiment génétique :
• Peut avoir lieu si une cellule est infectée par 2 virus
du même type et de sous-type différents
H1N1
H2N2
• Les fragments génomiques étant +/- indépendants
• 4 possibilités de génomes réassortis pour H et N
H1N2
H2N1
H1N1
H2N2
•Si le réassortiment concerne une des 2 protéines de surface antigéniques H ou N
==> altération du sous-type ==> Nouveaux sous-types potentiels
(important pour A plus de sous-type = plus de possibilités )
Influenzae
La grippe Humaine/ La grippe Aviaire ?
Influenzae
Influenza Humain
Influenza Aviaire
Spécificité d’Hôte des virus de grippe
Reconnaissance du Récepteur
• H reconnaît spécifiquement ==>
Oligosaccharides sialylés à leur extrémité
terminale avec des acides syaliques de type
H5 et H7 inféodés aviaire
=>Neu5Acα2.3 Gal (aviaire)
H1 et H3 inféodés à l’homme
=> Neu5Acα2.6 Gal (humain)
(acides N-acétylneuraminiques terminaux liés par des liaisons glycosidiques en α2,3 à du galactose)
Influenzae
Influenza Humain
Influenza Aviaire
Spécificité d’Hôte des virus de grippe
Réplication dans la cellule
Les protéines du complexe de réplication
• 6 autres gènes (1, 2, 3, 5, 7, 8) plus efficaces dans ¢ humaines ou aviaires
• Virus « humanisé »
: réplication plus efficace chez l’homme
• Virus « avianisé »
: réplication plus efficace chez l’oiseau
Influenzae
Les Pandémies de grippe
Influenzae
Epidémiologie humaine
• 4 grandes pandémies depuis 1918
==> apparition de nouveaux sous types
réassortants : H1N1, H2N2 & H3N2
• Grippe espagnole
==> plus de 50 millions de morts
• 2 sous-types circulent depuis 1977 ==> vaccin actuel H3N2 + H1N1 + Type B
1918
1910
1920
asiatique
H2N2 1968
Grippe espagnole
H1N1
1930
1940
1957
1950
1960
Hong-Kong
H3N2
russe
H1N1
1977
1970
1980
1990
2000
Influenzae
1173 - 1174
1200 - 1500
1510
1557
1580
1600 - 1699
1729 - 1733
1761 - 1762
1781 - 1782
1788 - 1790
1799 - 1802
1830 - 1833
1847 - 1848
1857 - 1858
1889 - 1891
1900
1918 - 1920
1946 - 1948
1957 - 1958
1968 - 1969
1977 - 1978
En Europe. Première description d'une épidémie de grippe.
7 épidémies documentées
Afrique, Europe. Originaire d'Afrique
Europe, Japon Origine inconnue. plus de 8000 décès à Rome.Nbreux villages d
Europe, Afrique, Amérique du Nord. Origine asiatique
5 à 8 épidémies
Europe, Amérique, Russie. Originaire de Russie.
Europe, Amérique du Nord. Origine inconnue.
Europe, Chine, Inde, Amérique du Nord, Russie. Origine Russie ou Chine.
Europe, Amérique du Nord. Origine inconnue. Reliée à 1781-1782
Europe, Chine, Brésil, Russie. Originaire de Russie ou de Chine.
Europe, Chine, Russie,Inde, Amérique du Nord.Originaire de Chine.
Europe, Russie, Originaire d'Asie ou de Russie.
Europe, Amérique. Originaire de Panama.
Monde entier. Originaire de Russie. H2N8
Europe, Amérique, Australie. Origine inconnue. H3N8
Monde entier. Originaire des USA. H1N1
Monde entier.Originaire d'Australie ou de Chine. H1N1
Monde entier. Originaire de Chine. H2N2
Monde entier.Originaire de Chine. H3N2
Monde entier. Originaire de Russie. H1N1
Influenzae
Grippe Espagnole
• A l’origine aux USA
==> Premiers décès dans les prisons américaines en 1918
==> Soldats américains importent la grippe en Europe
(Premiers cas Européens : les ports de débarquements des Américains sur l’Atlantique
==> 2 vagues Bordeaux et Brest
==> Dissémination en Europe en 2 à 3 mois ==> durant la guerre
==> Dissémination sur tous les continents en 5 à 6 mois
Influenzae
Vecteurs
• Dispersion sur la planète très rapide :
Influenza aviaire => Oiseaux migrateurs, vent, humains, etc.
Influenza humain => Vent, Déplacements des humains
(bateaux, avions, etc).
• Exemple : grippe Asiatique de 1957
==> Origine : province du Yutan en Chine Fév. 1957
==> Mars 1958 à Hong-Kong, Avril 58 Taiwan, Japon
==> Hiver 58 à 59 : Tous les continents atteints
=> 1 million de morts (patients jeunes et âgés)
C.W. Potter, Journal of Applied Microbiology, 2001
Influenzae/Pandémie
Comment ce sont
installées les pandémies
de grippe?
Influenzae/Pandémie
8 gènes type A
==>
==>
H et N : entrée dans la cellule hôte
6 autres gènes efficaces pour répliquer
le virus dans une espèce animale précise
Notion de Virus « humanisé »
• Pandémie ==>
1- Réplication efficace chez l’homme
2- Transmission d’homme à homme
4:H
6:N
Influenzae/Pandémie
Passage du poulet à l’homme
==> Epidémie immédiate possible
==> Sinon adaptation nécessaire avant épidémie
Adaptation
==> Par réassortant lors de coinfection avec
un sous-type humanisé dans une espèce animale ou l’homme
==> Par adaptation progressive par mutagenèse chez le poulet ou autr
Influenzae/Pandémies
A l’origine
==> Virus aviaire
Réservoir
==> Canards et Oiseaux aquatiques
Enquêtes épidémiologiques rétrospectives
•IXXème siécle
==>
•Depuis leXXème siécle
==>
Séro-archéologie
Sérologie et clonage de prélèvements humains et
animaux
(Pour 1918 : Patients morts de grippe au cours d’une
expédition dans le Grand Nord et prisonniers des glaces).
Influenzae/Pandémie
Virus Humanisé et pandémies de grippe
Réassortant
Glissement
Espagnole
1918
H1N1
H
Asiatique
1957
H2N2
Hong-Kong
1968
H3N2
6
5
N
8?
3
2
Russe
1972
H1N1
Influenzae
Pourquoi parle t’on du porc ?
Influenzae
Porc = Creuset
•A l’origine ===> virus aviaire
• Les sous-types “humains” sont retrouvés
chez toutes les autres espèces animales
•Théorie du porc en tant que Creuset pour le
réassortiment potentiel des fragments d’ARN
==> Le porc possède les récepteurs aux virus aviaires et humains
=>¢ trachéales
Influenza Aviaire
Influenza Humain
Influenza Humain
Influenzae
Porc = Creuset
•Exemple : grippe Hong-Kong (1968)
==> montré par phylogénie et
séquençage des 8 fragments
==> forte présence de H3N2
« humanisé » chez les porcs
•Pourquoi le Moyen Orient (Chine et Sud-Est Asiatique) ?
• Région à risque car élevage des canards et
des porcs en étroite promiscuité avec l’homme
• Densité de population humaine élevée, favorise
“l’adaptation” du nouveau sous-type à l’homme
• Surveillance permanente des régions à risque
==> éviter le départ d’une nouvelle pandémie
Influenzae
Pourquoi cette peur?
Influenzae
De l’absence de certitudes
De l’effondrement des dogmes
Influenzae
Porc creuset = possible
mais pas nécessaire
Influenzae
3 sous-types aviaires ont été transmis à l’homme directement :
H5N1 (virus 100% aviaire) isolé chez des hommes à Hong-Kong en 1997
•(18 malades dont 6 décès) : potentielle nouvelle pandémie humaine
==> enrayée immédiatement (patients en quarantaine et
abattage systématique de tous les poulets et canards de la région).
==>Permis d’éviter un potentiel réassortant entre H5N1( 8 gènes
aviaire) et un virus humain se répliquant très efficacement chez l’homme
(autres gènes que H et N).
H9N2 (virus 100% aviaire) isolé chez 2 fillettes à Hong-Kong en 1999 :
•Virus identique à virus de caille, retrouvé aussi chez le porc.
•Ce virus déjà décrit en Chine en 1998 n’avait pas entraînait
d’épidémie,
H7N7 (virus 100% aviaire) Printemps 2003 :
•Pays Bas (28 Millions) Belgique (3 Millions) poulets morts ou abattus
• 89 cas humains filière avicole (conjonctivites et grippe) : dont 1 mort
Influenzae
3 Sous-types
==>
•Transmission poulet ==> homme uniquement
•Pas ou peu de passage d’homme à homme.
Semblaient se répliquer difficilement chez l’homme
==> Possibilité d’adaptation limitée par glissement génique
En absence de réassortant avec des virus “humains”
==> pas d’épidémie,juste franchissement de barrière d’espèces
Influenzae
Infectieux pour l’homme par glissement possible
=> Pas que réassortant
H1N1 1918
H1N1
• Exhumation en 2000
=> des corps de 7 hommes Expédition grand Nord
congelés dans le permafrost
=> Séquençage du génome complet de H1N1 1918
• Séquence
=> fond génétique plutôt aviaire
=> présence des mutations facilitant la réplication chez l’homme
=> mutations dans H permettant de reconnaître le récepteur humain
=> potentiellement acquises par glissement
≠ des épisodes ultérieurs (Asiatique et Hong kong) => réassortants
Influenzae
H5N1
Epizootie ==> Epidémie ?
H5N1
H5N1 Suite… :
Février 2003 Hong-Kong
•2 cas de contamination humaine dont 1 mort
•300000 poulets abattus ou morts et décontamination des parcs animaliers
2003 ==> 2005
•10 pays d’Asie de l’Est et du Sud-Est touchés, Août 05 Russie, Mongolie, Kazakhstan
•Plus importante épizootie de grippe aviaire connue
(plus de 150 millions de poulets morts ou abattus)
• Cas humains depuis 2003
:
Vietnam (41/91),
Thaïlande (13/19),
Cambodge (4/4),
Indonésie (4/7)
Chine (?/?)
• Passage chez le chat, les oiseaux d’ornement, le porc, le tigre…
• Un cas de transmission humain/humain suspecté (Février 05 Vietnam)
H5N1
H5N1
=> oiseaux migrateurs
==> Roumanie, Croatie
=> Importation d’oiseaux
Clandestine : Aigles en Belgique…
Légale : Perroquet Angleterre
On pensait tout contrôler mais
==> Afrique beaucoup plus difficile
==> Crainte de réassortants avec virus grippal humain
Influenzae
Conclusion
Pandémie = Apparition d’un
nouveau sous-type humain
absent des vaccins
Richard J. Webby and Robert G. Webster, Science 2003
•Grandes pandémies : sous-types
=> H1N1, H2N2, H3N2.
•Depuis 1997 :
Franchissement de la barrière d’espèces : pas de pandémie
H5N1, H9N2, H7N7 => pas de transmission homme à homme
Influenzae
Conclusion
• Pandémies jusqu’alors évitée :
- Surveillance des zones à risque
- Abattage systématique des poulets
- Quarantaine des patients
- Vaccination du personnel des filières avicoles
touchées par l’influenza aviaire
Limiter le risque
De réassortants avec une souche humaine
=>Réassortiment génétique
D’évolution vers une « humanisation » progressive des gènes par glissement
=> Adaptation progressive par mutagenèses successives
Influenzae
Conclusion
Cas de Hong Kong (1997, 1999 et 2004) :
- Sous-types 100% aviaires (8 gènes aviaires) H5N1, H7N7, H9N2
==> passage directement à l’homme
Théorie porc = creuset :
• Le porc ne serait pas un passage obligé
• Le porc espèce “creuset” ou espèce comme
l’homme ou les oiseaux domestiques?
H1N1 (en 1918 et 1977) H3N2 en 1968 : Peut être seulement le reflet chez le porc
de l’existence du sous-type viral présent également chez l’homme.
==> Pas de preuve du passage obligé par le porc pour une pandémie
==> en 2003 H7N7 chez le porc et passage direct…
Influenzae
Conclusion
•Virus humain
Homme
==> Retour permanent chez les oiseaux domestiques
?
Hôtes
intermédiaires
•Réassortiment probable également chez les
oiseaux domestiques (poulets oies...) en contact
avec les hommes et les oiseaux sauvages.
•Réassortiment chez l’homme, également possible.
Creuset => poulet, porc et homme…
Réservoir