Construcción y Evaluación de Modelos Bioinformáticos de Diagnóstico y Pronóstico

Construcción y Evaluación de
Modelos Bioinformáticos de
Diagnóstico y Pronóstico
Intelligent Systems Group
Departamento de Ciencias de la Computación e Inteligencia Artificial
Departamento de Arquitectura y Tecnología de Computadores
Osasunari Aplikatutako Teknologia eta Adimena
Tecnología y Conocimiento Aplicado a la Sanidad
Unibertsitate-Enpresa Sektore Topaketa
Encuentro Sectorial Universidad-Empresa
Bilbao, 14 de Diciembre, 2010

Tecnología y Conocimiento Aplicado a la Sanidad Bilbao, 14 de Diciembre de 2010
Recursos humanos
2 Catedráticos 4 Profesores 1 Investigador
Ikerbasque
4 Investigadores post-doctorales
14 Estudiantes de doctorado

Tecnología y Conocimiento Aplicado a la Sanidad Bilbao, 14 de Diciembre de 2010
Recursos computacionales
Cluster de cómputo DELL
389 procesadores
1.032 Gigas de memoria
8 Teras de disco

Tecnología y Conocimiento Aplicado a la Sanidad Bilbao, 14 de Diciembre de 2010
Areas metodológicas
MINERIA DE DATOS:
Modelos probabilísticos
Modelos clasificatorios
Selección de atributos
Clustering
...
OPTIMIZACION:
Métodos heurísticos
Algrítmos genéticos
Algorítmos de estimación de
distribuciones
...
COMPUTACION EFICIENTE:
Paralelización de código
Scheduling
Plataformas alternativas (Cloud computing, GPGPU, ...)
...

Tecnología y Conocimiento Aplicado a la Sanidad Bilbao, 14 de Diciembre de 2010
Aplicaciones en biomedicina
●Expresión de miRNAs en esclerosis múltiple (Biodonostia)
●Expresión génica en distrofia muscular (Biodonostia)
●Expresión génica en demencia fronto-temporal (Biodonostia)
●Expresión génica en cancer de colon (Gaiker)
●Diagnóstico en base a SNPs (UCLA)
Modelos para diagnóstico