FIRE - Sols - Valentin 201008

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Écologie des sols et
perspectives en ingénierie
écologique
S. Barot
IRD
Contribution des laboratoires
Biosol, Bioemco, Solutions et
du groupe GAIE
L’écologie, une science des interactions,
entre organismes mais pas seulement …
Espèces ingénieurs des
écosystèmes
Espèce 2
Environnement
physico-chimique
Espèce 1
Propriétés du système: production primaire, stabilité, résilience
Le sol constitue le ‘‘paradigme’’ des
interactions organismes-physico chimie
Résultat de l’interaction entre la roche mère et la biosphère
Mélange de matière minérale et de MO
Un réseau trophique en grande partie détritivore
Un organisme ne peut vivre dans le sol sans le modifier
Les relations belowground-aboveground
Réseau
trophique aérien
Compétition entre
plantes
Organismes
du sol
MO
Réseau
trophique
du sol
Minéralisation
Propriétés
physico-chimiques
De nombreuses interactions et rétroactions
Liens entre réseaux trophiques souterrain et aérien par
l’intermédiaire des plantes
Pilotage de la production primaire
L’écologie a besoin d’étudier les sols, et comprendre
les sols nécessite l’écologie
Utilisation de l’ingénierie écologique
Réseau
trophique
Compétition entre
plantes
MO
Réseau
trophique
Propriétés
physico-chimiques
Connaissance du système d’interactions
Modifications de certains éléments du réseaux pour produire
des services écosystémiques ou rendre la production
durable
Agronomie en tirant partie de toutes les interactions
écologiques?
Utilisation de l’ingénierie écologique
Définition
L’application des principes de l’écologie à la gestion et
l’exploitation de l’environnement
Minimiser le recours au travail humain, y compris
aux énergies non renouvelables et aux intrants divers
Augmenter la part de travail effectué par les organismes et
les processus écologiques
On cherche explicitement à augmenter la durabilité des
services écosystémiques (production agricole ou non, autres
services…)
Utilisation de l’ingénierie écologique
Réseau
trophique
Compétition entre
plantes
MO
Réseau
trophique
Propriétés
physico-chimiques
Modifier les propriétés
PC pour favoriser un ‘‘bon organisme’’
Utilisation de l’ingénierie écologique
Réseau
trophique
Compétition entre
plantes
MO
Réseau
trophique
Propriétés
physico-chimiques
Ajouter un organisme du sol ayant un effet
favorable direct ou indirect
Utilisation de l’ingénierie écologique
Ajouter une plante qui maintient une
rétroaction positive
Réseau
trophique
Compétition entre
plantes
MO
Réseau
trophique
Propriétés
physico-chimiques
Exemple 1: vers de terre et charbon de bois
Bactéries
MO
Minéralisation
Bactéries
CEC
Phytohormones
Structuration du sol
Manipulation des bactéries
Minéralisation + stockage des nutriments minéraux
Possibilité d’interactions?
Exemple 1: vers de terre et charbon de bois
Thèse de D. Noguera
Expérience en serre (CIAT de
Cali) sur le riz
Contrôle, Vers, Charbon, V+C
3 sols + un trt avec fertilisation
Les effets dépendent
du sol
X 4!!!
Effets plus fort sans
fertilisant
Pas d’interaction V X C
Sol:
Exemple 1: vers de terre et charbon de bois
Comprendre les mécanismes
+ Mesures de nombreux paramètres et de l’allocation
des ressources (shoot/root, nombre et taille des
grains…)
+ Biologie moléculaire sur le riz: expression de différents
gènes
Comparaison de la sensibilité de différentes variétés de riz
Sensibilité très variable
Les vers comme possible pression évolutive
Il faut bien choisir le sol et la variété de plante
cultivée pour utiliser les vers et le charbon de
bois
Exemple 2: choisir la ‘‘bonne’’ espèce de
vers
Les vers modifient la structure et l’activité des communautés
bactériennes des sols
Il faut promouvoir des espèces ayant un effet favorable
(+ de minéralisation, - de nitrification et de dénitrification …etc.)
Par quels mécanismes les vers influencent-ils les
communautés bactériennes?
+ Existe-t-il des bactéries symbiotiques (tube digestif)?
+ Quel est le rôle du mucus?
Exemple 2: choisir la ‘‘bonne’’ espèce de
vers
Travaux de V. Roy, P. Mora, E. Miambi, I. Barois
Comparaison par DGGE des
communautés bactériennes
+dans diff sols
+ dans le tube digestif
+ dans du sol+mucus
+ sol+glucose
L’effet du type de sol est plus important que celui du ver
Pas de bactérie symbiotique?
Le mucus n’a pas seulement un effet ‘‘énergétique’’ comme
celui du glucose
Stimulation plus fine et sélection spécifique de groupes
bactériens?
Exemple 3: optimiser l’influence des
acacias dans un pâturage
UR Solutions, Thèse de S. Grellier
Pâturages
Zoulous
dans le
KwaZuluNatal
Compétition?
facilitation?
Les acacias ont-ils un effet positif et sur le pâturage et la
production bovine?
Quelle serait la densité idéale d’acacias?
(haie?)
Leur disposition?
Exemple 3: optimiser l’influence des
acacias dans un pâturage
Des interactions complexes passant par le sol
La lumière mais aussi:
L’eau
Pluie interceptée
Evaporation
Ruissellement
Ascenseur
hydraulique
Ruissellement
Infiltration
Eau de Subsurface:
Exemple 3: optimiser l’influence des
acacias dans un pâturage
Des interactions complexes passant par le sol
La lumière mais aussi:
L’azote
Litière
enrichie en N
Fixation
symbiotique
Nécessité de
mesurer tous les
flux, intégration
dans un modèle
Compétition pour
l’azote minéral
Exemple 4: exemple d’intégration des flux
Modéliser la limitation par les nutriments
Syst d’équations différentielles, calculs à l’équilibre
Importance des entrées/sorties et flux de recyclage interne
P* =

1
md
un
un  1
+ Rn
 Rd

d p + l p − f p  md + ld un + ln
u n + ln  1 − α
dp
md
un
α=
d p + l p − f p md + ld un + ln
Efficacité du recyclage
qui doit être la cible de
l’ingénierie écologique
Exemple 4: exemple d’intégration des flux
Modéliser la limitation par les nutriments
Prise en compte de plus de mécanismes
Effets à court et long terme
des vers de terre
Effet de l’inhibition de la
nitrification par les graminées
africaines
Barot et al. Functional Ecology
2007
Boudsocq et al. Functional Ecology
2008
Travaux de JC Lata à Lamto
Besoins de collaboration au sein de FIRE
Mesurer finement des flux de nutriments en
démêlant différents processus (ex des vers de
terre). Utilisation de marqueurs isotopiques
Intégrer les mécanismes
écologiques de l’échelle
des individus ou du m2 à
l’échelle du paysage ou de la
région
Intégrer les rétroactions entre
échelles
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