THÈSE pour le DIPLÔME D`ÉTAT DE DOCTEUR EN PHARMACIE

UNIVERSITÉ DE NANTES
FACULTÉ DE PHARMACIE
ANNÉE 2013 N° 056
THÈSE
pour le
DIPLÔME D’ÉTAT
DE DOCTEUR EN PHARMACIE
par
Anne-Sophie Denise
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Présentée et soutenue publiquement le 30 septembre 2013
Vaccination antigrippale : impact de la pandémie A(H1N1)2009
sur les campagnes de vaccination saisonnière et comparaison de
la morbi-mortalité de 2006 à 2012
Président : Mme Nathalie CAROFF, Professeur de Bactériologie
Directeur de thèse : Mme Virginie FERRÉ, Professeur de Virologie
Membre du jury : Mme Anne MOREAU-KLEIN, Pharmacien biologiste

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Remerciements
À            e
soutenue dans ce projet qui a mis du temps à mûrir. Votre patience et
À Madame le Professeur Nathalie Caroff, je vous remercie sincèrement de me faire
plaisir de présider ce jury, ainsi que de prendre le temps de juger ce travail.
À Madame le Docteur Anne Moreau-
du jury et de juger ce travail. Je vous remercie également pour votre aide précieuse au
démarrage de cette thèse.

3
Aux équipes du CepiDc, du réseau OSCOUR® et du Département des Maladies Infectieuses
         et    
 de ce projet.
Au  transmettre les documents dont
vous disposiez.
À France, 
nécessaires, avec ton regard plus littéraire et pointilleux que le mien. Je vais tenter de régler
mon problème avec les virgules.
À mes quatre grands-parents, merci pour votre présence et votre regard bienveillant.
  vous voir plus
souvent.
À es études et encore
 avoir fait de moi celle que je suis.
Et enfin, à Jean-Marie, sans qui , merci pour le bonheur
     le premier pas
qui se concrétisent.

4
Table des matières
Remerciements................................................................................................................. 2
Liste des figures ................................................................................................................ 7
Liste des tableaux ............................................................................................................. 8
Liste des annexes .............................................................................................................. 9
Liste des abréviations ......................................................................................................10
INTRODUCTION ...............................................................................................................12
CONTEXTE .......................................................................................................................14
1 Définitions : épidémie ou pandémie ..........................................................................14
2 Rappels historiques sur la grippe ...............................................................................14
2.1 Découverte du virus de la grippe ................................................................................ 14
2.2 Les grandes pandémies du XXe siècle ......................................................................... 15
3 Présentation des virus grippaux .................................................................................17
3.1 Structure ..................................................................................................................... 17
3.2 Nomenclature ............................................................................................................. 19
3.3 Cycle de multiplication ................................................................................................ 20
3.4 Hôtes ........................................................................................................................... 22
3.5 Variabilité génétique ................................................................................................... 23
4 Physiopathologie des infections grippales ..................................................................25
4.1 Transmission des virus grippaux ................................................................................. 25
4.2 Signes cliniques ........................................................................................................... 26
4.3 Complications .............................................................................................................. 28
4.4 Les populations les plus fragiles.................................................................................. 30
5 Émergence et évolution de la pandémie de grippe A(H1N1)2009 ................................30
MÉTHODES ......................................................................................................................36
1 Mise en place d’une surveillance épidémiologique spécifique ....................................36
1.1 Surveillance épidémiologique de la grippe saisonnière ............................................. 36
1.1.1 En communauté ................................................................................................... 36
1.1.2 En milieu hospitalier ............................................................................................. 40

5
ctions respiratoires aiguës ................................................ 40
1.1.4 Les décès liés à la grippe ...................................................................................... 41
1.1.5 Surveillance virologique ....................................................................................... 42
1.2 Surveillance épidémiologique spécifique de la pandémie de grippe A(H1N1)2009 .. 42
1.2.1 Définition de cas ................................................................................................... 43
1.2.2 Organisation de la surveillance ............................................................................ 44
1.2.2.1 La phase de confinement .............................................................................. 45
1.2.2.2 La phase de limitation ................................................................................... 46
1.2.2.3 La surveillance des décès ............................................................................... 48
1.2.2.4 La surveillance virologique ............................................................................ 49
1.3 Les indicateurs de morbi-mortalité de la grippe ........................................................ 49
2 Introduction d’une prise en charge thérapeutique et préventive spécifique ...............51
2.1 Traitement et prophylaxie de la grippe ...................................................................... 51
2.1.1 Les thérapeutiques possibles ............................................................................... 51
2.1.2 Prophylaxie ........................................................................................................... 53
 ........................................................................................ 53
2.1.2.2 Les vaccins contre la grippe saisonnière ....................................................... 54
i Composition ......................................................................................................... 54
ii Production industrielle ........................................................................................ 56
iii Les différents vaccins antigrippaux commercialisés en France ......................... 57
iv Effets indésirables .............................................................................................. 57
v Contre-indications ............................................................................................... 58
2.1.2.3 Chimioprophylaxie ......................................................................................... 58
2.2 Organisation de la vaccination antigrippale saisonnière en France ........................... 59
2.2.1 Les recommandations du HCSP en 2013 .............................................................. 59
2.2.2 Organisation de la prise en charge de la vaccination antigrippale ...................... 61
2.3 Prise en charge thérapeutique spécifique de la grippe A(H1N1)2009 ....................... 64
2.3.1 Phase de prise en charge hospitalière systématique ........................................... 64
2.3.2 Phase de prise en charge mixte ........................................................................... 65
2.3.3 Phase de prise en charge ambulatoire ................................................................. 65
2.4 Des mesures préventives spécifiques de la pandémie de 2009 ................................. 66
2.4.1 Des campagnes de communication pour la prévention ...................................... 66
2.4.2 Organisation de la vaccination ............................................................................. 68
2.4.2.1 Planification de la vaccination ....................................................................... 68