Médecine personnalisée les questions actuelles Ce qui est simple

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22/06/2015
Deauville 10 6 2015
Médecine personnalisée
les questions actuelles
Jean-Yves Blay
(Lyon, CLB, CRCL, U 1052, Eq 11)
LYRIC INCa 4664, DevWECAN, NetSARC, RREPS
Eurosarc FP7-278742
French Sarcoma Group
EORTC
Ce qui est simple est toujours
faux.
Ce qui ne l'est pas est
inutilisable.
(Paul Valéry)
1
22/06/2015
Sujets
• Hétérogénéité tumorale
• Drivers?
• Héterogénéité du stroma
• Thérapeutique
Learning More in the 20th Century
Leukemias,
Blood
Cancers
Lung
Cancer
Prostate
C
Cancer
Colon
Cancer
Breast
Cancer
Other
Cancers,
including
Sarcomas
Appreciating the Complexity of Cancers
in the 21st Century
2
22/06/2015
Deauville 10 6 2015
Mutations
kinases
Amplification
12q13-15
MDM2/CDK4
WD/DDLPS
TSG loss
NF1, TSC1/2
GIST
Multiples
niveaux
Sarcomas and
aggressive connective
d’hétérogénéité
tissue tumors
Ntl
Group
MPNST
PEComas
T
Translocations
l
ti
DFSP
SyS
Ewing
Mutations
APC/bCat
Desmoids
Genomique
complexe
LMS, UPS
3
22/06/2015
Identifying actionable targets in advanced cancer patients:
Preliminary results from the ProfiLER program.
ESMO 2014
P. Cassier,
Cassier, O.Trédan
O.Trédan,, C. Seigne,
Seigne, E. Lavergne,
Lavergne, J. Fayette, F. Desseigne,
Desseigne, P. Biron,
Biron, C. de la Fouchardière,
Fouchardière, I. RayRay-Coquard
Coquard,, M. Pérol, D. Frappaz,
Frappaz, M.
Bernardin,, Q. Wang, V. Attignon,
Bernardin
Attignon, D. Pissaloux
Pissaloux,, V. Combaret,
Combaret, V. Agrapart
Agrapart,, M.E. Fondrevelle,
Fondrevelle, D. Pérol, J.Y. Blay,
Blay, Centre Léon Bérard
Bérard,, 28 rue
Laennec, Lyon, France
N=1590 patients as of June 2015 (single center)
Identifying actionable targets in advanced cancer
patients: Preliminary results from the ProfiLER
program.
ESMO 2014
4
22/06/2015
De multiples niveaux de complexité (1): Génomique
5
22/06/2015
11
De multiples niveaux de complexité (3) : intercellulaire
6
22/06/2015
De multiples niveaux de complexité (4): 4D / temporelle
– Hétérogénéité tumorale induite par la
thérapeutique
• Après imatinib
Debiec Rychter et al, Heinrich et al 2006
• Après sunitinib
Fletcher et al ECCO 2007
+ Exon 13
+ Exon 14
Exon 11 mutation étant
la mutation primaire…
+ Exon 17
Vers une fragmentation
des maladies
Damien Hirst
« 1-bromoadamantane »
« Acivicin »
« Arginosuccinic acid »
7
22/06/2015
Sujets
• Hétérogénéité tumorale
• Drivers?
• Héterogénéité du stroma
• Thérapeutique
8
22/06/2015
Drivers
« Pilotes »
La pression thérapeutique
induit l’émergence
de résistances « simples »
Deauville 10 6 2015
Mutations
kinases
Amplification
Sein, LPS,…
Perte GST,
p53, APC, BRCA1
GIST
Mélanomes
…
Sein, CRC,
sarcomes..
Carcinomes, sarcomes
T
Translocations
l
ti
Poumon
Sarcomes
…
Mutations
APC/bCat
Desmoides
Genomique
complexe
…
9
22/06/2015
KIT and PDGFR are mutated in GIST
KIT
PDGFR
•KIT & PDGFRA : 85%
Imatinib sensitive
+ Sunitinib sensitive
•Other
Oth k
key genes
involved:
•NF1, Raf, SDH,
IGF1R
Exon 9 (11%)
Exon 11 (67.5%)
Membrane
Exon 12 (0.9%)
E
Exon
13,14
13 14 (1%)
Exon 14 (0.3%)
Exon 17 (0.5%)
Cytoplasm
Exon 18 (6.3%)
Heinrich et al. Hum Pathol. 2002;33:484; Science
2003,
Corless et al. Proc AACR. 2003
GISTS : 10 different diseases
GIST are at least 10 diseases
KIT exon 9 mutants (10% of patients)
10
0
90
80
70
60
50
40
30
20
10
0
0
1
2
Median PFS
(months)
6 / 19
3-year
estimate (%)
5 / 17
P value
(logrank test)
0.017
3
Years
4
Dose
Adjuvant
KIT Exon 11
Im 400
+
KIT exon 9
Im 800
+
Non D842V
Im 400
+
D842V:
0
0
KIT/PDGFR WT
Im 400
+/?
NF1
?/Im 400
+/?
SDHB
?/Im 400
+/?
?
?
?
?
PDGFRA
5 Raf
Pediatric
KIT exon 9 mutants: 400 mg / 800 mg
Other patients: 400 mg / 800 mg
10
22/06/2015
GIST exon 11 Kit with Del 557-558:
Favorable predictive factor?
Patients having at least 5 yrs of fu, BFR14 trial (Blesius et al, ASCO 2011)
P= 0.02
< 556
557/558
> 559
CR
30%
43.1%
23.5%
PR
57.5%
40.3%
45.1%
SD
10%
16.7%
31.4%
JF Emile et al, ASCO 2013
B2222
17% of pts are always under IM at 9 yrs (Von Mehren et al, ASCO 2011)
SWOG S0033 22% of pts are alive at 10 year. Half of them were still under IM at
the time of the analysis (Demetri et al, ASCO 2014)
The majority have a KIT exon 11 mutation: majority of del 557-558?
esmo.org
26‐30 September 2014, Madrid, Spain
Hétérogénéité tumorale
– Hétérogénéité tumorale induite par la
thérapeutique
• Après imatinib
Debiec Rychter et al, Heinrich et al 2006
• Après sunitinib
Fletcher et al ECCO 2007
+ Exon 13
+ Exon 14
Exon 11 mutation étant
la mutation primaire…
+ Exon 17
11
22/06/2015
Drug
Sensitivity
Primary
Mutations
Protein
Domain
Secondary
Mutations
IM SU REG PON
Sensitive
NR
N
Not reported
N
p
Ligand binding
Exon 13
V654A
Exon 14
T670I
Exon 9 : 12%
Exon 11: 70%
JM
D816A/G/H/V
Exon 13: 1%
ATP binding
D820A/E/G/Y
K642E
Exon 17
Exon 17: 1%
N822H/K
Y823D
Activation Loop
N822H/K, D820Y
Exon 18
NR
A829P
esmo.org
26‐30 September 2014, Madrid, Spain
Gramza
et al, Clinical Cancer Research 15:7510, 2009
Heinrich et al, ASCO 2013 Poster/Abstract 10509
Deauville 10 6 2015
Mutations
kinases
Amplification
Sein, LPS,…
Perte GST,
p53, APC, BRCA1
GIST
Mélanomes
…
Sein, CRC,
sarcomes..
Carcinomes, sarcomes
T
Translocations
l
ti
Poumon
Sarcomes
…
Mutations
APC/bCat
Desmoides
Genomique
complexe
…
12
22/06/2015
MCSFR inhibitors in PVNS with t(1,2)
CROL 2014
Figure: Response to imatinib in PVNS
• Case report in 2008
– (Ann Oncol 2008)
18/09/06
08/11/06
28/02/07
• Retrospective study 2011
– (Cancer 2011)
8
7
6
• Prospective study 2012
– (Proc ASCO 2012)
5
4
1st interim analysis
3
2nd interim analysis
3rd interim analysis
2
1
0
0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1
Phase 1 study of RG7155, a novel anti-CSF1R
antibody, in patients with locally advanced
pigmented villonodular synovitis (PVNS)
P.A. Cassier, C.A. Gomez-Roca, A. Italiano, M. Cannarile, C. Ries, A.
Brillouet, C. Mueller, G. Meneses-Lorente, M. Baehner, J. Ratnayake, R.
Harding, K. Abiraj, N. Gass, K. Noh, R.D. Christen, M. Campone,
C. Le Tourneau, J. Delord, D. Rüttinger, J.-Y. Blay
Study fully sponsored by F. HOFFMANN-LA ROCHE
13
22/06/2015
RG7155 induces high ORR in PVNS
Time Point Responses (RECIST 1.1)
Previously failed nilotinib and/or imatinib treatment
Ries et al. Cancer Cell 2014 (in press)
Deauville 10 6 2015
Mutations
kinases
Amplification
Sein, LPS,…
Perte GST,
p53, APC, BRCA1
GIST
Mélanomes
…
Sein, CRC,
sarcomes..
Carcinomes, sarcomes
T
Translocations
l
ti
Poumon
Sarcomes
…
Mutations
autres
Genomique
complexe
APC/bCat, Histones
Desmoides
…
14
22/06/2015
15
22/06/2015
Drivers
« Pilotes faibles»
Peu de réponses ,
moins de résistances secondaires
Moins bien comprises
The missed opportunity of IGF1R Ab
IGF1 inhibitors as potential
targeted
d therapy
h
iin ES ?
Prieur 2004, Olmos 2009,
Pappo 2011
16
22/06/2015
Deauville 10 6 2015
Mutations
kinases
Amplification
Sein, LPS,…
Perte GST,
p53, APC, BRCA1
GIST
Mélanomes
…
Sein, CRC,
sarcomes..
Carcinomes, sarcomes
T
Translocations
l
ti
Poumon
Sarcomes
…
Mutations
APC/bCat
Desmoides
Genomique
complexe
…
CROL 2014
17
22/06/2015
CROL 2014
Nat Gen 2010
CROL 2014
18
22/06/2015
Sujets
• Hétérogénéité tumorale
• Drivers?
• Héterogénéité du stroma
• Thérapeutique
Anti-PD1
Activating
Receptors
Inhibitory
Receptors
Anti-PD1
Agonist
antibodies
Antagonist
antibodies
Immune cell activation
resulting in tumor cell death
Tumor activity > autoimmunity
19
22/06/2015
20
22/06/2015
21
22/06/2015
22
22/06/2015
Material and Methods
•
Th C
The
Cancer C
Cellll Li
Line
Encyclopedia (CCLE)
project provides public
access to genomic
data, analysis and
visualization for about
1000 cell lines:
–
–
–
–
Gene expression
profiles (U133
Plus2) in 1,036 cell
lines
Targeted NGS of
1,651 genes in 905
cell lines
Copy number
alterations
Pharmacologic
characterization (24
drugs)
http://www.broadinstitute.org/ccle
Pardoll et al. 2012, Nat Rev Cancer
23
12
10
8
6
Gene expression (log2)
14
4
mesothelioma
thyroid
glioma
sarcoma
VADS
urinary_tract
haematopoietic_malignancy
oesophagus
kidney
breast
NSCLC
biliary_tract
liver
pancreas
melanoma
stomach
neuroblastoma
endometrium
ovary
colorectal
prostate
SCLC
urinary_tract
thyroid
VADS
kidney
biliary_tract
pancreas
glioma
NSCLC
mesothelioma
oesophagus
prostate
ovary
colorectal
endometrium
breast
haematopoietic_malignancy
sarcoma
liver
stomach
melanoma
neuroblastoma
SCLC
Gene expression (log2)
22/06/2015
PD L1
PD-L1
PD L2
PD-L2
14
12
10
8
6
4
Sujets
• Hétérogénéité tumorale
• Drivers?
• Héterogénéité du stroma
• Thérapeutique
24
22/06/2015
49
50
25
22/06/2015
A new vision of the disease
Histology
Stroma
(immune cells…)
Molecular
typing
A new vision of the disease
Trials on subsets
of histotypes
Histology
Stroma
(immune cells …)
Molecular
typing
Trials on genotype?
e.g. CREATE
26
22/06/2015
Nous ne cheminons pas à la même vitesse!
•
Gene expression profile
Mindact EORTC 10041
Nouveaux essais moléculaires
Quel sous type? Quelle cible? Quels molécule?
27
22/06/2015
Première génération d’essais moléculaires
• Un médicament
ou
• Une
U pathologie
th l i
ou
• Une groupe de mutations & plusieurs médicaments
• Basket trials, ACSE
• MOSCATO,
MOSCATO SAFIR
• SHIVA PROFILER MOST
28
22/06/2015
20 indications of pembrolizumab
in a phase II study
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
A1 Colon or Rectal Adenocarcinoma
•
A2 Anal Canal Squamous Cell Carcinoma
•
A3 Pancreas
P
Ad
Adenocarcinoma
i
A4 Esophageal Squamous Cell Carcinoma or
•
Adenocarcinoma (Including GE Junction)
A5 Biliary Tract Adenocarcinoma (Gallbladder •
•
and Biliary Tree but
•
excluding Ampulla of Vater Cancers)
•
A6 Carcinoid Tumors
A7 Neuroendocrine Carcinomas (Well or
moderately differentiated Pancreatic
Neuroendocrine Tumor))
B1 ER Positive HER2 Negative Breast Cancer
B2 Ovarian Epithelial, Fallopian Tube or
Primary Peritoneal Carcinoma
B3 Endometrial Carcinoma
B4 Cervical Squamous Cell Cancer
B5 Vulvar Squamous Cell Carcinoma
C1 Small Cell Lung Cancer
C2 Mesothelioma (Malignant Pleural
Mesothelioma)
D1 Thyroid Cancer (Papillary or Follicular
Subtype)
D2 Salivary Gland Carcinoma
D3 Nasopharyngeal Carcinoma
E1 Glioblastoma Multiforme
E2 Leiomyosarcoma
E3 Prostate Adenocarcinoma
29
22/06/2015
My Own Specific Treatment
(MOST)
•
Design: two-period, national,
multicentre, randomised, open-label,
phase II studyy using
p
g a randomised
discontinuation design
•
Aim: to evaluate, in patients with
advanced solid tumours after at
least 1 prior systemic treatment
regimen, the clinical benefit of a
maintenance treatment in patients
with stable disease after a 12-week
i d ti treatment
induction
t t
t with
ith a therapy
th
targeting the molecular alterations
identified in the patient’s tumour
•
Start date: July 2013/ March 2014!
30
22/06/2015
MOST : TRAITEMENTS
Altérations documentées dans les gènes « actionnables » Thérapie ciblée suivants
correspondante
Voie
Dosage initial
Nilotinib
PO
400 mg BID
Everolimus
PO
10 mg QD
Sorafenib
PO
400 mg BID
Lapatinib**
PO
1500 mg QD
Pazopanib**
PO
800mg QD
Vemurafenib**
PO
960mg BID
Crizotinib**
PO
250mg BID
Tumeurs avec des mutations, amplifications, translocations de
ABL1, KIT*, PDGFRA*, PDGFRB*, DDR1, DDR2, CSF1R, ou de
leurs ligands.
Tumeurs avec des mutations de PIK3CA, PIK3R1, AKT1, AKT2,
mTOR ou perte de TSC1, TSC2 ou PTEN.
Tumeurs avec des mutations, amplifications, translocations de
VEGFR1‐3*, PDGFRB*, FLT3, BRAF (autres que mutations V600),
CRAF, KRAS ou RET, ou de leurs ligands.
Tumeurs avec des mutations ou amplifications de HER1 ou
HER2.
Tumeurs avec des mutations, amplifications, translocations de
VEGFR1‐3*,
VEGFR1
3 , PDGFRA
PDGFRA*,, PDGFRB
PDGFRB*,, KIT
KIT* ou de leurs ligands.
Tumeurs avec des mutations BRAFV600.
Tumeurs avec des mutations ou amplifications de ALK, MET,
RON, AXL, TYRO3 ou ROS1.
* Si plusieurs traitements peuvent être administrés (thérapies ayant des cibles communes), le choix de la thérapie ciblée à
administrer est laissé à l’appréciation du RCP moléculaire ayant revu le profil de la tumeur du patient.
** Discussions en cours pour fourniture du produit par le laboratoire pharmaceutique. Ouverture des groupes de traitement
correspondants (par amendement) dès disponibilité du produit dans l’étude.
61
To address major scientific questions
Oncology research … a « hard science »
with multidimensional complexity
1900
17/23 solved
2000
1/7 solved
31
22/06/2015
Conclusions
• Fragmentations nosologiques
• Cibler les altérations primaires
– Le paradigme 2000-2014
• Intégrer
I té
la
l complexité
l ité ett l’hété
l’hétérogénéité
é éité pour développer
dé l
de
d
nouvelles stratégies thérapeutiques
– Le paradigme 2014-2024
• Hétérogénéité tumorale commence a être mesurable
• Histologie, moléculaire, stroma, patient, temps
• Intégrer la complexité
• Evaluation pharmacodynamique
• Collaborations internationales
32
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