identification d`un algorithme de depistage du vih par des tests

MINISTERE DE L’EDUCATION NATIONALE REPUBLIQUE DU MALI
******************* UN PEUPLE-UN BUT-UNE FOI
UNIVERSITE DE BAMAKO
FACULTE DE MEDECINE, DE PHARMACIE
ET D’ODONTO-STOMATOLOGIE
******************
Année académique 2002-2003 Thèse N°………../
IDENTIFICATION D’UN ALGORITHME DE DEPISTAGE
DU VIH PAR DES TESTS RAPIDES UTILISABLES
DANS LES CENTRES DE CONSEILS ET DE
DEPISTAGE VOLONTAIRE (CCDV) AU MALI.
THESE
Présentée et soutenue publiquement le 18 janvier 2003 à 12 Heures
Devant la Faculté de Médecine, de Pharmacie et d’Odonto-Stomatologie par :
Mr. SANGARE Daouda Bakary
Pour obtenir le grade de : Docteur en Pharmacie
( Diplôme d’Etat )
JURY
Président : Professeur Amadou DIALLO
Membres : Docteur Bénoît Y. KOUMARE
Docteur Daouda MINTA
Directeur de thèse : Professeur Flabou BOUGOUDOGO

Identification d’un algorithme de dépistage du VIH par des tests rapides utilisables dans les CCDV au Mali
Daouda Bakary SANGARE Thèse Pharmacie
1
SOMMAIRE
…………….……………………………………………..…………1
I. INTRODUCTION ………………………………………………………….4
II. OBJECTIFS
…………………………………………………………………8
III. GENERALITES ………………………………………………….………...9
1. Le VIH …………………………………………………………………..…….9
1.1- Définition et classification
…………………………………………….10
1.2- Structure antigénique et organisation génétique
…………….10
1.3- Sites biologiques-Réplication - Variabilité génétique
………14
2. L’infection par le VIH ……………………………………………………19
2.2- Historique …………………………………………………………………...19
2.3- Histoire naturelle de l’infection
(Evolution de la maladie) ……….20
2.2.1- Modes de transmission…………………………………………………20
2.2.2- Evolution clinique ……………………………………………………….22
2.2.3- Evolution des marqueurs au cours de l’inection…………………..23
2.2.4- Remarque : Origine du déficit immunitaire…………………………25
3. Epidémiologie ……………………………………………………..………26
3.1- Epidémiologie de l’infection dans le monde
…………..………26
3.2- Situation épidémiologique du VIH/SIDA au Mali
………………30
4. Diagnostic biologique de l’infection
……………………….……..31
4.1- Conditions de prescription
……………………………………..…….31
4.2- Stratégies de dépistage …………………………………………..……32
4.2.1 Stratégie I…………………………………………………………………..…33
4.2.2 Stratégie II………………………………………………………………….…33
4.2.3 Stratégie III……………………………………………………………………33
4.2.4 Représentation algorithmique des stratégies………………………….33
4.2.5 Indication des stratégies…………………………………………………..36
4.3- Diagnostic direct :
………………………………………………………37
4.3.1 La détection d'antigènes du VIH …………………………………………37

Identification d’un algorithme de dépistage du VIH par des tests rapides utilisables dans les CCDV au Mali
Daouda Bakary SANGARE Thèse Pharmacie
2
4.3.2 La PCR (polymerase Chain Reaction) ……………………………….…37
4.4- Diagnostic indirect…………………………………………………………37
4.4.1 Tests rapides……………………………………………………………..…37
4.4.2 Tests ELISA ………………………………………………………...………39
4.4.3 Tests de confirmation…………………………………………………..…41
5. Contrôle de l’infection
…………………………………………………43
5.1- Traitement : Stratégies-Interêts-Limites ……………………….43
5.2- Prévention
…………………………………………………………………44
5.2.1. Surveillence épidémiologique……………………………..…………44
5.2.2. Dépistage et traitement des IST (Infections………………….……44
Sexuellement Transmissibles)
5.2.3. L‘I.E.C (Information Education Conseils) …………….……………44
5.2.4. Les C.C.D.V. (Centre de Conseils et de Dépistage Volontaire) ……..…45
5.2.5.
L’utilisation des antirétroviraux……………………………………..45
5.2.6. La lutte contre la pauvreté……………………………………………45
IV. METHODOLOGIE
…………………………………………………46
1. Population d’étude et prélèvements ………………………..……46
1.1 Population d’étude………………………………………………………...46
1.2 Critères de choix des échantillons……………………………………..46
1.3 Extraction du sérum à partir du sang prélevé sur papier filtre……46
1.4 Considérations éthiques………..………………………………………..47
2. Méthodes d’étude ………………………………………………………48
2.1- Présentation des tests à valider ……………………………………….48
2.1.1. ImmunoComb II HIV 1/2 BiSpot (PBS Organics, France) …………...48
2.1.2. Genie II HIV 1/2 (SANOFI DIAGNOSTICS, France) …………………..51
2.1.3. Determine HIV 1/2 (ABBOTT, DIVISION DIAGNOSTIC, France) …...53
2.1.4. Oraquick HIV 1/2 (ORASURE TECHNOLOGIES, Inc, USA) ………...57
2.1.5. Hemastrip HIV 1/2 (SALIVA DIAGNOSTIC SYSTEMS, Inc, USA) ….60
2.2- Présentation des tests de référence…………………………………..62
2.2.1. Murex HIV 1-2-0 (MUREX BIOTECH LIMITED, ANGLETERRE) ……62
2.2.2. Vironostika Uniform II plus O (ORGANON TEKNIKA, PAYS-BAS) ..66

Identification d’un algorithme de dépistage du VIH par des tests rapides utilisables dans les CCDV au Mali
Daouda Bakary SANGARE Thèse Pharmacie
3
2.2.3. Genscreen HIV 1/2 Version 2 (BIO-RAD, France)……………………69
2.2.4. Algorithme de dépistage pour les tests de référence……………...71
2.3- Caractéristiques opérationnelles et coût des tests ………………..73
2.4- Analyse statistique ………………………………………………………74
V. RESULTATS ……………………………………………………….75
1. Comparaison des résultats sérologiques………………………….…75
2. Comparaison des performances des tests à valider……………….76
3. Paramètres d’appréciation de la fiabilité………………………………77
4. Comparaison des caractéristiques spécifiques à celles des divers
fabricants………………………………………………………………………..78
VI. COMMENTAIRES ET DISCUSSIONS
…………………80
1. Caractéristiques opérationnelles et coût des tests………………..80
2. Comparaison des paramètres d’appréciation ..……………………80
2.1. ImmunoComb II HIV 1/2 BiSpot (PBS Organics, France) …………..80
2.2. Genie II HIV 1/2 (SANOFI DIAGNOSTICS, France) ………………….81
2.3. Determine HIV 1/2 (ABBOTT, DIVISION DIAGNOSTIC, France) …...81
2.4. Oraquick HIV 1/2 (ORASURE TECHNOLOGIES, Inc, USA) ..…..….81
2.5. Hemastrip HIV 1/2 (SALIVA DIAGNOSTIC SYSTEMS, Inc, USA).…81
3. Quelques observations sur la première phase.…………………….83
4. Quelques observations sur la deuxième phase…………………….83
VII. CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS ………….85
1. Conclusion ………………………………………………………………..85
2. Recommandations……………………………………………………….87
VIII. REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES …………….90
IX. ANNEXES
………………………………………………………94

Identification d’un algorithme de dépistage du VIH par des tests rapides utilisables dans les CCDV au Mali
Daouda Bakary SANGARE Thèse Pharmacie
4
I. INTRODUCTION
Le SIDA (Syndrome d'Immuno Déficience Acquise) est une infection due à un
virus de la famille des rétrovirus appelé VIH (Virus de l'Immuno-déficience
Humaine).
Vingt ans durant (1981 - 2001) le SIDA est devenu l’un des dévastateurs
impitoyables de l'espèce humaine. Dans sa progression effrénée, il a déjà fait
plus de vingt millions de morts à travers le monde dont 2,3 millions pour la seule
période 2000 - 2001. Avec 10000 décès par jour, il surclasse le paludisme et
devient ainsi la première cause de mortalité dans le monde. La mort des
victimes, à majorité jeunes, paralyse l‘économie des pays à prévalence élevée.
Le fléau constitue aujourd'hui une pandémie avec 40 millions de personnes
infectées dans le monde en 2000 - 2001 dont 28.1 millions en Afrique au sud du
Sahara, soit 70% des cas.
L’OMS/ONUSIDA voit ses chiffres à la hausse. En effet dans son rapport publié
le 26 novembre 2002, il estime à 5 millions le nombre de nouveaux cas et à 42
millions le nombre de séropositifs dans le monde (+2 millions en un an). Si rien
n’y était fait, ce chiffre doublerait en 10 ans. L’Afrique paye toujours le plus lourd
tribut avec 29 millions de séropositifs (+ 3,5 millions par rapport à 2001) et 2,4
millions de décès sur 3 millions. [31]
Le SIDA s'annonce comme l'ennemi juré de l'espèce humaine avec 5 nouveaux
cas par minute à travers le monde [29].
En juillet 2002, l’ONUSIDA a noté un accroissement de ce chiffre avec 1 mort
toutes les 11 secondes et un nouveau cas survient toutes les 6 secondes.
La situation est d'autant plus dramatique que la majorité des victimes du SIDA
ignore leur infection par le VIH.