Regard critique face à un test

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Formation sur les tests génétiques
Dossier réalisé par :
Association Tous Chercheurs
Inmed
Parc scientifique de Luminy
13273 Marseille cedex 09
(présidente : Constance HAMMOND)
Rédaction : Marion Mathieu et David Karlin avec l'aide de Jean Thimonier

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Sommaire
INTRODUCTION ................................................................................................................... 5
BASES INDISPENSABLES DE BIOLOGIE ................................................................................ 5
[1. CELLULE, CHROMOSOME, ADN, GENE] .............................................................................................................................. 5
1.1. Cellule ................................................................................................................................................................... 5
1.2. Chromosomes et caryotype ............................................................................................................................... 6
1.3. ADN ........................................................................................................................................................................ 6
1.4. Le gène, l'unité de base d'information génétique ......................................................................................... 7
1.5. Le code génétique .............................................................................................................................................. 8
[2. MUTATION, ALLELE, POLYMORPHISME] .............................................................................................................................. 8
2.1. Les modifications génétiques ........................................................................................................................... 8
2.2. Allèles d'un gène : Allèle dominant ou récessif ........................................................................................... 11
2.3. Polymorphisme .................................................................................................................................................. 12
2.4 Causes et transmission des mutations ............................................................................................................ 13
[3. MALADIES MONOGENIQUES ET MALADIES MULTIFACTORIELLES] ............................................................................................ 14
3.1. Définitions : Maladie familiale, héréditaire, congénitale, génétique ..................................................... 14
3.2. Maladies (génétiques) monogéniques ............................................................................................................ 14
3.3. Maladies multifactorielles ............................................................................................................................... 19
[4. COMMENT SONT IDENTIFIES DES GENES DE SUSCEPTIBILITE] ................................................................................................ 20
4.1. Identification d'une composante génétique ................................................................................................. 20
4.2. Identification de gènes de susceptibilité ...................................................................................................... 21
4.3. Difficultés des études de gènes de susceptibilité ....................................................................................... 22
PRINCIPE, APPLICATIONS ET LIMITES DES TESTS GENETIQUES ...................................... 25
[1. INTRODUCTION] ............................................................................................................................................................. 25
[2. DEFINITION ET PRINCIPE D'UN TEST GENETIQUE] ............................................................................................................... 25
2.1. Définition............................................................................................................................................................ 25
2.2. Détection de modifications constitutives ou acquises à l’âge adulte ..................................................... 26
[3. DIVERSITE D’APPLICATIONS] ........................................................................................................................................... 26
3.1. Test de diagnostic ............................................................................................................................................. 26
3.2. Test pré-symptomatique ................................................................................................................................. 26
3.3. Test de diagnostic prénatal (DPN) ou préimplantatoire (DPI) .................................................................. 27
3.4. Test de susceptibilité – Test de prédisposition ............................................................................................ 27
3.5. Test du statut de « porteur sain » ................................................................................................................. 28
3.6. Dépistage d’une population (test systématique) ........................................................................................ 28
3.7. Tests pharmacogénétiques .............................................................................................................................. 29
[4. DES TESTS EVOLUTIFS ET COMPLEXES].............................................................................................................................. 29
4.1. Une complexité variable en fonction des pathologies associées .............................................................. 29
4.2. Pourquoi un délai plus long pour tester le 1er individu d’une famille ? ................................................. 30
4.3. Différence entre un test de recherche et un test en routine ................................................................... 31
VALIDITE, VALEUR INFORMATIVE ET USAGE DES TESTS GENETIQUES ........................... 32
[1. VALIDITE DU TEST] ......................................................................................................................................................... 32
[2. MIEUX COMPRENDRE LE RISQUE POTENTIEL INDIQUE PAR UN TEST] ..................................................................................... 32
2.1. Notions de prévalence, risque absolu et risque relatif, risque standard, facteur de risque, facteur
protecteur .................................................................................................................................................................. 32
2.2. Notions de sensibilité et de spécificité ......................................................................................................... 33
2.3. Règles pratiques pour évaluer le risque posé par un test.......................................................................... 34

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[3. VALEUR AJOUTEE DU TEST] ............................................................................................................................................. 35
3.1. Confirmer et affiner un diagnostic ................................................................................................................ 35
3.2. Proposer un diagnostic plus simple ou moins cher ...................................................................................... 35
3.3. Orienter vers un traitement préventif .......................................................................................................... 36
3.4. Orienter vers une hygiène de vie appropriée .............................................................................................. 36
3.5. Améliorer la surveillance de la maladie ....................................................................................................... 37
3.6. Orienter vers un traitement mieux approprié (une fois la maladie déclarée) ....................................... 37
3.7. Proposer un diagnostic prénatal ..................................................................................................................... 37
3.7. Faciliter la reconnaissance d'une maladie professionnelle ou environnementale ................................. 37
[4. RISQUES A L'ANNONCE D'UN TEST POSITIF] ........................................................................................................................ 38
4.1. Risques de discrimination ................................................................................................................................ 38
4.2. Risques psychologiques .................................................................................................................................... 38
[5. CAS PARTICULIER D'UN DEPISTAGE GENETIQUE] ................................................................................................................. 38
ENCADREMENT JURIDIQUE DES TESTS GENETIQUES ....................................................... 40
[1. DOMAINE COUVERT PAR LA REGLEMENTATION] .................................................................................................................. 40
[2. CONDITIONS DE PRESCRIPTION ET DE REALISATION] ........................................................................................................... 40
2.1. Consentement ................................................................................................................................................... 40
2.2. Prescription ........................................................................................................................................................ 41
2.3. Agrément et autorisation à la pratique des analyses de biologie médicale nécessaires à l'examen
des caractéristiques génétiques ............................................................................................................................. 41
2.4. Communication des résultats .......................................................................................................................... 41
2.5. Cas du diagnostic prénatal .............................................................................................................................. 42
2.6. Rôle du conseiller en génétique ..................................................................................................................... 42
MESSAGES PRINCIPAUX ET CONCLUSION ......................................................................... 44
BIBLIOGRAPHIE.................................................................................................................. 45

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Le but de cette formation est de permettre aux stagiaires membres d'associations de malades de :
 Comprendre en quoi consiste un test génétique, et savoir l'expliquer
 Etre capable d'indiquer dans les grandes lignes les champs d'application, les possibilités et les
limites de tels tests
 Pouvoir évaluer de façon critique les informations concernant les tests génétiques
Vous pouvez considérer que les notions de biologie et les applications des tests génétiques
mentionnées dans ce fascicule resteront valables pour les 5 ans à venir. Cependant, comme dans
tous les domaines des sciences elles sont amenées à changer en fonction de l'évolution des
technologies, des connaissances, et de la société.
Symboles utilisés dans ce fascicule
Nous avons utilisé les symboles suivants pour faciliter la lecture de ce fascicule :
Attention, confusion ou erreur à ne pas commettre
Point(s) à retenir
Complément d'information

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Introduction
L'ADN et par conséquent la génétique tiennent aujourd'hui une part importante dans notre
quotidien. On parle de « carte d'identité » ou de « patrimoine » génétique, de « terrain » ou de
« prédisposition » génétique … Les tests génétiques ne sont pas confinés à la médecine mais
envahissent la sphère juridique (tests d'identification judiciaire), sociale (tests de paternité) …
Il est vrai que les tests génétiques constituent une avancée fondamentalement différente des tests
antérieurs (biochimiques, morphologiques …) puisqu'ils ouvrent des perspectives bien plus vastes,
et notamment la possibilité de prédire, avec plus ou moins de fiabilité, la survenue de certaines
maladies. Néanmoins, il faut considérer les tests qu'ils soient biochimiques, génétiques ou
morphologiques en fonction de leur finalité et non de la technique sous-jacente.
Les tests génétiques sont des tests basés sur l’analyse de notre matériel génétique (analyse de
chromosomes, de l’ADN, d’un gène spécifique ou de son produit) pour mettre en évidence des
modifications génétiques. Ils peuvent faire appel à un large panel de techniques. Pour mieux
comprendre le principe et l’intérêt de tels tests, il est important de revoir certaines notions de bases
de génétique. C’est le thème du 1er chapitre.
Bases indispensables de biologie
[1. CELLULE, CHROMOSOME, ADN, GENE]
1.1. Cellule
La cellule est la plus petite unité capable de vivre de façon autonome. Notre organisme est composé
de l’ordre de 50 000 milliards de cellules qui communiquent entre elles et sont associées de manière
très structurée pour former un individu. Chacune de ces cellules est issue de la division d'une cellule
unique, la cellule oeuf, qui s'est divisée en 2, puis en 4, puis en 8 …
Il existe environ deux cents types de cellules chez l’homme, chacune assurant une fonction plus ou
moins spécialisée : les globules rouges transportent l’oxygène dans le sang, les lymphocytes ou
globules blancs interviennent dans la défense immunitaire (fabrication d'anticorps, destruction de
microbes), les follicules pilaires produisent des poils, etc.
La cellule est organisée comme une vraie usine miniature avec des systèmes de stockage, de
transport, de communication … dont beaucoup sont assurés par des protéines spécialisées. Les
protéines, composées d'acides aminés, jouent de multiples rôles dans la cellule. Certaines ont un
rôle architectural (par exemple la tubuline forme des câbles en forme de tube), d'autres forment des
canaux ou des pores (par exemple l'aquaporine laisse entrer ou non l'eau dans la cellule), d'autres
servent de messager (par exemple l'insuline qui régule le taux de sucre dans le sang), ou
transportent des substances (par exemple l'hémoglobine transporte l'oxygène), ... Les instructions
pour fabriquer ces protéines sont inscrites dans l’ADN.