magister en biologie - Université Kasdi Merbah Ouargla

UNIVERSITE KASDI MERBAH OUARGLA 2009/2010
MAGISTER EN BIOLOGIE
CYCLE D’ETUDES 3ème
FACULTE Sciences de la Nature et de la Vie et des Sciences de la
Terre et de l’Univers
DEPARTEMENT
Biologie
INTITULE DE LA PG Microbiologie Appliquée
RESPONSABLE
Dr. OULD EL HADJ-KHELIL Aminata
[email protected]
NOMBRE DE POSTES
12
HABILITATION
Arrêté n° 223 du 22/07/2009
DIPLOME DELIVRE
Magister en Biologie – Spécialité:
Microbiologie Appliquée
OBJECTIF DE LA FORMATION
Le projet d'ouverture de la
post graduation en
microbiologie appliquée dans notre Université vient suite
aux motifs suivants:
• La demande massive formulée par les étudiants en fin
de cycle de cette filière
• Besoins économiques: Vision de la création des micro-
entreprises régionales à long terme
•
L'émergence de l'agriculture oasienne et
l'intensification agricole en zone aride, déjà mise en
place par la population locale et les pouvoirs publics
d’où la recherche de la valorisation des produits et
sous produits
• L'existence de moyens humains et matériels
•
Relation avec le milieu professionnel actif en la
matière
Cette post graduation
ne fera qu'accroître le bien fondé
des sciences biologiques avec ses diverses filières
inhérentes aux sciences biologiques. Enfin, ceci ne fera que
renforcer le pôle d'excellence en matière d'enseignement
vers lequel aspire notre Université. Par ailleurs, l'existence
de la filière sciences biologiques (Tronc Commun + 3
options) depuis sa création, devrait favoriser l'ouverture
de la dite post graduation.
La mise en place d’une formation post-graduée se
pose donc comme un prolongement logique visant à

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étendre le champ d’intervention du département et à
cristalliser un savoir non encore entièrement valorisé. Elle
conduit à une qualification orientée vers la recherche-
développement dans le but de mettre en valeur et de
promouvoir le secteur de l
a biologie et surtout dans ce
contexte celui de la microbiologie.
POURSUITES D’ETUDES
Thèse de Doctorat
CONDITIONS D’ACCES Concours
PUBLIC CONCERNE
• Ingénieur en contrôle de qualité
• Ingénieur en technologie alimentaire
• Ingénieur en nutrition humaine
• DES en biologie (option : biochimie et microbiologie)
• Licence en biologie (4 ans)
DEBOUCHES • Enseignement supérieur
• Centres de recherche

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PLANNING DES COURS
INTITULE DES COURS
VOLUME
HORAIRE (h) COEF.
SEMESTRE1 Microbiologie de l'Environnement 30 01
Techniques moléculaires et leurs
applications 60 03
Biodégradation et transformations
microbiologiques 30 01
Biotechnologie de l’environnement 40 02
Informatique 30 01
SEMESTRE2 Microbiologie de l'Environnement dans les
industries agroalimentaires 60 03
Microbiologie alimentaire 60 03
La microbiologie industrielle et la
biotechnologie 30 02
Anglais technique 30 03
Pédagogie 30 01
Techniques d’analyses microbiologiques
60
03

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PROGRAMMES DES COURS
MICROBIOLOGIE DE L’ENVIRONNEMENT
1. Introduction et concepts généraux
2. Diversité des microorganismes
3. Méthodes d'étude en microbiologie de l'environnement
4. Communautés microbiennes
5. Rôle des microorganismes dans les cycles bio-géochimiques
6. Localisation des microorganismes dans la biosphère
7. Ecologie microbienne en milieu aquatique
8. Eaux souterraines et sources hydrothermales
9. Tapis bactériens et biofilms
10. Dégradation bactériennes des matériaux
11. Corrosion bactériennes des métaux
12. Exemples et étude de cas
BIODEGRADATION ET TRANSFORMATIONS MICROBIOLOGIQUES
1. Processus d'oxydo-réduction et diversité du métabolisme énergétique chez les bactéries
2. Voies métaboliques impliquées dans dégradation des xénobiotiques
3. Dégradation aérobie et anaérobie
4. Mécanismes enzymatiques de la biodégradation
5. Biosurfactants et capture des hydrocarbures par les bactéries
6. Biotransformation et bioaccumulation des composés métalliques
BIOTECHNOLOGIE DE L’ENVIRONNEMENT

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1 Définition des processus de la biotechnologie
1.1 Cinétique de la biodégradation ou de la biotransformation des molécules
chimiques
1.2 Définition de la réactivité biologique (culture pure, enrichissement,
microorganismes génétiquement modifiés)
2 Applications des biotechnologies environnementales
2.1 Station d'épuration pour le traitement de l'eau
2.2 Biofiltre pour le traitement de l'air
2.3 Biotertre pour le traitement du sol
2.4 Biomonitoring – utilisation des systèmes biologiques pour le suivi des
molécules chimiques, analyse des gènes, contrôle de la toxicité
MICROBIOLOGIQUE DE L’ENVIRONNEMENT DANS LES INDUSTRIES AGROALIMENTAIRES
1 Contaminations microbiologiques des circuits industriels
1.1 La qualité de l'eau dans l'industrie agroalimentaire
1.2 Les facteurs de risque de développement dans les installations
1.3 Les méthodes d'analyse
1.4 La réglementation et les mesures préventives
2 Formation de biofilms dans les circuits industriels
2.1 Généralités sur les biofilms
2.2 Mécanismes de formation des biofilms dans les circuits
2.3 Techniques de décontamination et de décrochage des biofilms
3 Procédés de désinfection et de nettoyage des circuits industriels
4 Qualité microbiologique et physico-chimique des effluents
5 Procédés de traitement des effluents des industries agroalimentaires