4. Eucaryotes: les Protistes, Plantes, Champignons, et Animaux

Microbiologie en Santé et l’Agriculture: Un Cours de Microbiologie Générale
Guy R. Knudsen, Ph.D., J.D., et Louise-Marie Dandurand, Ph.D., Université d’Idaho, USA
Figure 1. Giardia protozoaire isolée de l'intestin
de rat. Les paires de flagelles filiformes faciliter
la mobilité. Le protozoaire Giardia cause la
maladie diarrhéique appelée giardiase. Photo:
Dr. Stan Erlandsen et Dr. Dennis Feely, CDC.
4. Eucaryotes: les Protistes, Plantes, Champignons,
et Animaux
4a. Les Protistes
Les protistes sont un groupe diversifié de micro-organismes eucaryotes. Historiquement,
les protistes ont été traités comme un royaume biologique officiellement appelé le protistes
et inclus plupart des organismes unicellulaires qui ne rentrent pas dans les autres
royaumes. Mais plus récemment, les recherches moléculaire a été utilisée pour redéfinir ce
groupe dans la taxonomie moderne comme embranchements divers et souvent lointain
rapport.
Le groupe des protistes est maintenant considéré comme signifiant embranchements
divers qui ne sont pas étroitement liées à travers l'évolution et ont des cycles de vie, les
niveaux trophiques, les modes de locomotion et de structures cellulaires. Outre leurs
niveaux relativement simples d'organisation, les protistes n'ont pas beaucoup en
commun. Ils sont unicellulaires ou parfois pluricellulaires, sont sans tissus spécialisés, et
cette organisation cellulaire simple distingue les protistes d'autres eucaryotes, tels que les
champignons, les animaux et les plantes.
Les protistes sont traditionnellement répartis en
plusieurs groupes en fonction de similitudes avec
les royaumes «supérieures»: le unicellulaire
"comme des animaux" protozoaires
(hétérotrophes, chimiotrophes) (Figure 7.
Giardia protozoaire isolée de l'intestin
de rat. Les paires de flagelles filiformes
faciliter la mobilité. Le protozoaire
Giardia cause la maladie diarrhéique
appelée giardiase. Photo: Dr. Stan
Erlandsen et Dr. Dennis Feely, CDC.), ou
la «comme des plantes" protophytes (essentiellement des algues unicellulaires, ils sont

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autrotrophes et phototrophes) (Figure 8), et ausi les «comme des champignons"
myxomycètes et oomycetes (hétérotrophes, chimiotrophes). Ces subdivisions
traditionnelles, largement basé sur les points communs superficielles, ont été remplacées
par des classifications basées sur la parenté phylogénétique (évolution des organismes).
Toutefois, les termes anciens sont encore utilisés comme noms informels pour décrire la
morphologie et l'écologie des divers protistes. On peut parler de trois grands groupes de
Protistes: les algues unicellulaires (qui sont phototrophes et autotrophes), les protozoaires
(chimiotrophes, hétérotrophes), et les <<champignons inférieurs>> (chimiotrophes,
hétérotrophes).
Les algues unicellulaires : Le terme «algues»
comprend certaines plantes aquatiques, mais
aussi des protistes photosynthétiques aquatiques.
(le terme « aquatique » signifie vivre dans
l'eau douce ou d'eau salée.)
(le terme «photosynthétique» signifie
obtenir de l'énergie des rayons du soleil)
Les algues unicellulaires sont des protistes
photosynthétiques. On les trouve partout,
spécialement dans les corps de l’eau.
Les protistes vivent dans presque n'importe quel
environnement qui contient de l'eau liquide. Ils
sont photosynthétiques et sont des producteurs
primaires vitales dans les écosystèmes, en
particulier dans l'océan dans le cadre du plancton.
Un groupe de protistes, les diatomées (Figure 9),
est l'un des groupes plus importants et les plus
significatifs de vue écologique organismes sur la
Terre. Ils se produisent un peu partout qui a de la
lumière (la plupart des espèces ont besoin de lumière
pour la photosynthèse) et de l'eau - dans les océans, les
lacs et les rivières, marécages, marais et tourbières;
mousse humide et les visages des rochers.
Figure 3. Diverses diatomées.
Licence Wikimedia Commons.
Figure 2. Spirogyra, une algue verte
filamenteuse. Photo: Bob Blaylock, licence
Wikimedia Commons.

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En raison de leur abondance dans le plancton marin, en particulier dans les zones riches en
éléments nutritifs dans les océans de la planète, les diatomées représentent probablement
autant que 20% de la fixation photosynthétique global du carbone (~ 20 Pg de carbone fixé
par année), ce qui est plus que tout l'forêts tropicales du monde.
Les protozoaires: Les protozoaires sont hétérotrophes et chemotrophs. Certaines d'entre
elles consomment des bactéries et autres micro-organismes. D'autres protozoaires sont
responsables d'une gamme de maladies humaines graves, telles que la malaria et la maladie
du sommeil. Par exemple, il ya cinq espèces de parasites du genre Plasmodium, qui
provoquent le paludisme chez l'homme.
Transmission des protozoaires qui vivent dans un intestin de
l'homme, tels que Entamoeba histolytica (Figure 10), à un autre
être humain se produit généralement par une voie fécale-orale
(par exemple, de la nourriture ou de l'eau ou de personne à
personne de contact contaminés). Protozoaires qui vivent dans
le sang ou les tissus des êtres humains sont transmis à d'autres
humains par un arthropode vecteur (par exemple, par la
piqûre d'un moustique ou mouche de sable).
Les champignons inférieurs: Le protiste Phytophthora infestans, micro-organisme
eucaryote précédemment considéré comme un champignon, provoque le mildiou dans les
pommes de terre. Une compréhension plus approfondie de biologie de protistes peut
permettre à ces maladies à traiter plus efficacement. Autres membres de cette groupe
(Oomycetes) sont principalement aquatique, et beaucoup d'entre eux provoquent des
maladies des plantes ou des animaux aquatiques tels que les poissons.
4b. Les Plantes
Relativement peu d'espèces de plantes sont microscopiques, bien que les algues vertes sont
parfois appelées "plantes". Auparavant, le terme «plante» a été utilisé pour inclure les
bactéries, les protistes nombreux et les champignons, mais cette taxonomie est maintenant
obsolète. Comme nous l'avons vu, les bactéries, les protistes et champignons forment des
Figure 4. Le protozoaire Entamoeba
histolytica. Photo CDC.

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groupes taxonomiques distinctes. En particulier des bactéries, qui sont les procaryotes, ne
sont pas étroitement liés aux plantes. Toutefois, les algues vertes sont probablement les
ancêtres des plantes terrestres terrestres.
4c. Les Champignons
La mycologie est la science étudiant les champignons. Les champignons sont présents dans
le sol, plantes, débris végétaux, lichen, parasites de l'homme, des animaux et des plantes.
Une levure, eucaryote unicellulaire, est aussi un champignon.
Toutes les champignons sont hétérotrophes et chimiotrophes
Les cellules des champignons sont arrangées dans une structure appelé le hyphe, et
plusieurs hyphes font un assemblage qui s’appelle le mycélium (Figure 11).
Les champignons sont "absorbotrophes" : ils se nourrissent
par absorption. Ils sécrètent des enzymes qui digèrent des
polymères dans le milieu extérieur (par exemple, le glucose
est un monomère utilisé par toutes les organismes dans la
production d’énergie. La cellulose est un polymère qui est
commun dans la nature, par exemple les cellules des plantes
sont composées de la cellulose.
La plupart des champignons sont saprophytique: leurs
nourriture est les substances organiques non-vivant.
Mais, il y a aussi beaucoup d’espèces du champignon qui sont
parasitiques, comme les parasites des animaux ou les
parasites des plantes (Figure 12). Les champignons parasitiques causent la plupart des
maladies des plantes.
Certains champignons attaquent des insectes, y compris
les insectes nuisibles.
Les champignons fournissent également de la nourriture
pour animaux, y compris les nématodes, les insectes, les
Figure 5. Les hyphes et spores
du champignon Penicillium.
Photo licence Wikimedia
Commons.
Figure 6. Le champignon
Penicillium se développe sur un
orange. Photo Wikimedia Commons.

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Figure 7. Le nematode Caenorhabditis
elegans. Photo Wikimedia Commons.
acariens et les mammifères. Par exemple, beaucoup acariens et les insectes mangent des
champignons dans le sol et sur le sol de la forêt. En outre, certains nématodes se
nourrissent de champignons dans le sol.La plupart des champignons sont aérobies, mais il
y des espèces (comme les levures) qui font la fermentation sans oxygène (par exemple,
dans la production du pain, du vin, et de la bière).
Les champignons reproduisent par les spores. Les spores sont sexuelles ou asexuelle. On
trouve les spores dans les structures diverses. Les spores, pour la plupart, sont
disséminées par le vent et par la pluie.
Il y a une groupe des champignons, qui on appelle les “champignons inférieurs”, qui a des
spores qui peuvent nager (dans l’eau sur les feuilles des plantes, ou dans le sol). En
phylogénie moderne, ils sont effectivement inclus dans les protistes
-on va discuter les champignons encore, dans notre discussion de la phytopathologie
4d. Les Animaux
Les animaux microscopiques les plus importants sont
les nématodes (Figure 13) et autres helminthes.
Les nématodes sont des vers ronds non segmentés
(animaux) qui sont des parasites des plantes ou des
animaux, ou ils vivent non parasite dans le sol ou
l'eau.
Il y a des nématodes qui sont parasites, alors ils
sont helminthes, mais aussi il y a beaucoup
d’espèces de nématodes qui ne sont pas parasites (ils mangent les substances organiques,
ou les bactéries, ou les champignons, ou les autres nématodes).