2. Les agents de maladies infectieuses

Phytopathologie: l'Étude de la Santé des Plantes
Guy R. Knudsen, Ph.D., J.D., et Louise-Marie C. Dandurand, Ph.D.
Université d’Idaho, États-Unis
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2. Les agents de maladies infectieuses
2a. Ce qui est un agent pathogène des plantes?
Les organismes phytopathogènes sont pour la plupart les champignons, les bactéries, les
nématodes, et les virus (il ya aussi quelques plantes parasites).
Les champignons et les nématodes peuvent entrer dans les plantes par les blessures ou les
ouvertures naturelles, et aussi directement.
Les bactéries et les virus peuvent entrer dans les plantes par les blessures ou les
ouvertures naturelles, ou par vecteurs, mais jamais directement.
2b. Les Champignons, et les maladies cryptogamique
La mycologie est la science étudiant les champignons. On
utilise les termes ‘maladie cryptogamique’ ou ‘maladie
fongique’ pour les maladies causées à une plante par un
champignon ou un autre organisme filamenteux (cas des
Oomycetes) parasite. L'étude des champignons est la
mycologie, et la mycologie végétale est une branche de la
phytopathologie.
Les champignons sont présents dans le sol, plantes, débris
végétaux, lichen, parasites de l'homme, des animaux et des
plantes. Une levure, eucaryote unicellulaire, est aussi un
champignon.
Figure 1. Les hyphes et spores
du champignon Penicillium.
Photo licence Wikimedia
Commons.

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Figure 3. Maladie de l'oïdium. Ce champignon est
un parasite obligatoire. Photo license Wikimedia
Commons.
Les cellules des champignons (la plupart) sont arrangées dans une structure appelé le
hyphe, et plusieurs hyphes font un assemblage qui s’appelle le mycélium (Figure 2)
Toutes les champignons sont hétérotrophes (ils doivent obtenir leur carbone des autres
organismes, vivants ou morts) et chimiotrophes (ils obtiennent leur énergie de les
chimiques ; dans ce cas, les mêmes composés organiques) . Aussi, on peut dire que les
champignons sont "absorbotrophes" : ils se nourrissent par absorption. Ils sécrètent des
enzymes qui digèrent des polymères dans le milieu extérieur (par exemple, le glucose est
un monomère utilisé par toutes les organismes
dans la production d’énergie. La cellulose est
un polymère qui est commun dans la nature,
par exemple les cellules des plantes sont
composées de la cellulose.
La plupart des champignons sont
saprophytique: leurs nourriture est les
substances organiques non-vivant. Mais, il y a aussi beaucoup d’espèces du champignon qui
sont parasitiques, comme les parasites des plantes ou les parasites des animaux (Figure 3).
Les champignons parasitiques causent la plupart des maladies des plantes.
Certains champignons sont des «parasites
obligatoires", ce qui signifie qu'ils
peuvent compléter leur cycle de vie
seulement en association avec un hôte
vivant. Par exemple, les champignons de
l'oïdium sont des parasites obligatoires
(Figure 4). Cependant, de nombreux
champignons phytopathogènes sont
Figure 2. Le champignon
Penicillium se développe sur un
orange. Photo Wikimedia Commons.

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Figure 4. Schéma de la structure cellulaire
d’une cellule bactérienne typique. Photo
license Wikimedia Commons.
capables de survivre et de se reproduire sur les matières végétales mortes, mais peuvent
aussi attaquer les hôtes vivants. Les organismes qui vivent sur la matière organique morte
sont appelés «saprophytes». Certains champignons sont essentiellement saprophytes, mais
peuvent attaquer les plantes affaiblies ou blessés; ceux-ci sont appelés «pathogènes
opportunistes».
Quelques champignons fournissent également de la nourriture pour animaux, y compris les
nématodes, les insectes, les acariens et les mammifères. Par exemple, beaucoup d’acariens
et les insectes mangent des champignons dans le sol et sur le sol de la forêt. En outre,
certains nématodes se nourrissent de champignons dans le sol.
La plupart des champignons sont aérobies, mais il y des espèces (comme les levures) qui
font la fermentation sans oxygène (par exemple, dans la production du pain, du vin, et de la
bière).
Les champignons reproduisent par les spores. Les spores sont sexuelles ou asexuelle. On
trouve les spores dans les structures diverses. Les spores, pour la plupart, sont
disséminées par le vent et par la pluie.
Il y a une groupe des champignons, qui on appelle
les “champignons inférieurs”, qui a des spores qui
peuvent nager (dans l’eau sur les feuilles des
plantes, ou dans le sol). En fait, ils sont mieux
classés que les protistes.

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2c. Les Bactéries
Les bactéries (Bacteria), sont des organismes vivants unicellulaires (Figure 5) et
procaryotes présents dans tous les milieux (les procaryotes sont des organismes
unicellulaires dont les dimensions sont de l'ordre du micromètre; on doit donc utiliser un
microscope pour les observer; les cellules procaryotes sont formés d'une cellule unique
dépourvue de noyau). Les bactéries présentent de nombreuses formes : sphériques
(coques), allongées ou en bâtonnets (bacilles), et formes plus ou moins spiralées. Pour la
pluspart, les bactéries phytopathogènes sont du forme bacille. L’étude des bactéries est la
bactériologie, une branche de la microbiologie.
Les bactéries sont ubiquitaires et sont présentes dans tous les types de biotopes rencontrés
sur la Terre. Elles peuvent être isolées du sol, des eaux douces, marines ou saumâtres, de
l’air, des profondeurs océaniques, des déchets radioactifs, de la croûte terrestre, sur la peau
et de l’intestin des animaux. Il y a environ 40 millions de cellules bactériennes dans un
gramme de sol et 1 million de cellules bactériennes dans un millilitre d’eau douce.
2d. Les Nématodes
Les nématodes sont des vers ronds non segmentés (animaux) qui sont des parasites des
plantes ou des animaux, ou ils vivent non parasite dans le sol ou l'eau.
Toutes les nématodes phytoparasites ont un organe
d'alimentation, appelé un stylet, par lequel ils percent les
cellules végétales et d'ingérer le contenu (Figure 6).
Nématodes parasites des plantes peuvent se nourrir de
l'extérieur des racines des plantes (ectoparasites), ou peuvent
pénétrer et se nourrir à l'intérieur des racines (ou, dans
Figure 5. Nématode pathogène
des plantes, montrant le stylet.

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certains cas, les tiges) (endoparasites).
En outre, les nématodes parasites des plantes sont caractérisés comme ceux qui restent
dans un site d'alimentation (sédentaires), ou qui se déplacent autour de soit à l'intérieur ou
à l'extérieur de la plante hôte (migrateurs).
2e. Virus
Les virus sont non-vivant, mais ils causent plusieurs maladies et peuvent reproduire
seulement avec l’aide d’un hôte.
-Ils ont un construction assez simple : un manteau protéine (= « capside »), qui contient
l’acide nucléique (ADN ou ARN)
- toutes les virus sont parasitiques ! Leurs hôtes inclurent les animaux, plantes, protistes,
champignons, bactéries, archées (toutes les êtres vivants)