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LES "MICRO ARN" du point de
vue du pathologiste en 2008
PLAN DU COURS:
_ ARN non codants: les µARN
_ leur biosynthese
_ leur fonction
_ les outils de detection
_ la cible des µARN
_ implication en pathologie humaine
_ place du pathologiste dans le projet des µARN
_ conclusion
I° ARN non codants et µARN:
Dans le transcriptum humain ( = l'ensemble des ARN produits par une cellule ), on va
retrouver des ARN qui eux ne seront pas traduits en proteines, c'est a dire des ARN non codants:
----> la sous-famille des µARN faisant entre 18 et 25 nucleotides
mais aussi
----> d'autres sous-familles tels que les grands ARN non codants...
II° la biosynthese de ces µARN:
1) certaines sequences d' ADN vont etre transcripts en primir 2) ce primir va subir une
etape de maturation par une DNase : Drosha donnant ainsi des primirs de 70 nucleotide en forme
"d'epingle a cheuveux" 3) sorti de ceux-ci du noyau en empruntant une exportine 5 4) puis sera
pris en charge par Diacer qui donnera des µARN mature double brin 5) puis les 2 brins se
separent, le petit brin pourra se fixer sur le complexe proteique Risc; puis l'autre brin pourra
venir se fixer sur un brin d'ARNm et bloquer sa traduction ou meme le detruire.
~ 1µARN pourra bloquer plusieur grand ARN
~ plusieurs µARN pourront bloquer 1 meme grand ARN
III° principales fonctions actuelles des µARN:
Chez l' homme le let7 est utilisé dans le cadre des cancers pulmonaires; sa presence est
independante de la taille de la tumeur, et son taux diminuant sera synonime de mauvais
pronostique du cancer
Dans un tissu normal on va retrouver environ 450 µARN; et en fonction de la pathologie
tumoral que l'on aura il y aura de veritables profils d'expression des µARN etant de veritables
signatures d'un type de cancer car c'est hautement specifique; ce qui fait qu'un jour on pourra
aboutir a une nouvelle classification des cancers qui sera sur un mode histo-moleculaire.
IV° les outils de detection:
IV°1) Miccroarray, puce a µARN:
=> on a du mal a s'approvisioner en ces puces a µARN et en plus sont poly
especes.
=> 400 mg de tissu ---> (?) g d'ARN ---> 1-3 µg de µARN (mais tous ceci varira
en fonction de l'organe consideré ) le cout de la manipulation sera de 1 500 Euros
V° identification des cibles de ces µARN:
on pourra utiliser la bio informatique qui nous permetra de nous dire que pex: mir 221
aura pour cible p27Kip1, biochimiquement elle correspondra pex a une proteine du cycle
cellulaire
donc on fera des experiences d' hyper-expression de ce µARN pour voir les repercussion sur le
cycle cellulaire.
VI° implication en pathologie humaine:
--------> Tumorale :
~ pex: let7 et cancer pulmonaire
~ pex: mir 221 et 222 pour la pathologie tumorale prostatique et thyroidienne
-------> Non tumorale :
----> virale
----> inflamatoire
----> musculaire
----> degenerescence cerebrale
VII° la place du pathologiste:
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