facteurs affectant l`equilibre

Étude
de la diversité génétique intraspecifique
Typer
25-30 individus non apparentés
Marqueurs
moléculaires
Représentation des génotypes dans un tableau (Exel)
Équilibre de Hardy-Weinberg

Mis en évidence en 1908 par G.h. Hardy et W.
Weinberg

Les fréquences alléliques et genotypiques restent
stable de génération en génération dans une
population diploïde idéale
Condition de l’équilibre de Hardy-Weinberg
1. La population est panmictique : le choix du conjoint se fait de manière
aléatoire
2. Tous les individus participant au processus de reproduction appartiennent à la
même génération
3. La population est isolée : aucun gène n'est introduit par des migrants
extérieurs
4. La taille de la population est infinie
5. Il n'y a pas de mutation au locus considéré
6 Il n'y a pas de sélection agissant sur le locus considéré
Loi de Hardy-Weinberg:
Equilibre de la fréquence des allèles et des génotypes au cours
des générations.
Cas d’un locus bi-allélique
Gamète 2
Gamète 1
A (p)
a (q)
A (p)
AA
p p  p
a (q)
Aa
2
Aa
p  q  pq
p  q  pq
aa
q  q  q2
Fréquence allélique F
fA  p
fa  q
p  q 1
Fréquence génotypique
f AA  p 2
f Aa  pq  pq  2 pq
f aa  q 2
p2+2pq+q2=1
Prédiction des fréquences génotypiques de la génération t+1 à
partir des fréquences alléliques de la génération t
l'axe horizontal indique les deux fréquences d'allèle p et q,
l'axe vertical indique la fréquence des génotypes
les trois génotypes possibles sont représentés par des courbes différents
Pour un système multiallèlique à n allèles la
formule devient (p1 + p2 +… pn )2 = 1.
fAiAi = Pi2
fAiAj = PiPj
GENPOP (version 1.2) ( Raymond et Rousset 1995)
deux estimation de Fis(mesure l’écart à la panmixie à
l’intérieur des populations):une basée sur le modèle de
Weir et Cockerham’s (1984) et la deuxième sur le modèle
de Robertson et Hill (1984)
Fis=1-Ho/Hs

Test d’excès d’hétérozygotes
Ho: absence d’excès en hétérozygotes
H1: présence d’excès en hétérozygotes

Test de déficit en hétérozygotes
Ho: absence de déficit en hétérozygotes
H1: présence de déficit en hétérozygotes
Ho rejetée
Valeur de Fis > P calculée
H1 acceptée
Valeur de Fis < P calculée
Ho acceptée
P est estimée utilisant la méthode des chaines de
Markov (Guo et Thompson)

Dérive génétique

Pression sélective

Migration

Mutation
Fluctuation des fréquences géniques d’une
génération à l’autre à l’intérieur d’une population
fermée (à faible effectif)
diminution du taux d’hétérozygotes
Les individus n’ont pas la même probabilité de
devenir reproducteurs et/ou n’ont pas, une fois
reproducteur la même espérance de taille de
descendance.
Evolution orientée des fréquences géniques
À sens unique
évolution rapide des
fréquences géniques
Echange entre deux
populations
Homogénéisation
génétique
Le rythme d’évolution des fréquences est très lent
Sélection et la dérive génétique
Croisement consanguin
 Homogamie
 Biais d’échantillonnage,
 Biais d’enregistrement des généalogies
 Insémination artificiel
 Allèle nul
 Effet père
