Méthodologie et outils statistiques : bases épidémiologiques

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Méthodologie et outils statistiques :
bases épidémiologiques
Dr Roch Giorgi
[email protected]
LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée, Marseille, France
http://cybertim.timone.univ-mrs.fr
Introduction à l’épidémiologie
Ce cours a pour but de présenter les différents types d’épidémiologie :
– l’épidémiologie descriptive : elle a trouvé son développement par
l’étude des maladies contagieuses;
– l’épidémiologie analytique : dont le but est d’étudier les facteurs de
risque de différentes maladies.
L’épidémiologie d’intervention sera abordée dans le cours « Principe
des essais contrôlés ».
© Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée
Épidémiologie descriptive
•
Contrôle sanitaire : vise à
– repérer
– isoler
– soigner (patient et entourage)
•
Étude de la fréquence d’une maladie :
– déterminer les priorités
– détecter les modifications
– variations temporelles, spatiales
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Épidémiologie descriptive
Exemples :
– application géographique : étude de Snow (Snow, 1855)
•
•
•
•
épidémie de choléra à Londres au XIXème siècle
étude de la répartition des cas selon les quartiers
juxtaposition des cas et des fontaines de la ville
détermination des fontaines contaminées
– étude de Doll et Hill sur les cancers broncho-pulmonaires
• constatation d’une augmentation de l’incidence de ce cancer chez
l’homme dès 1930
• l’amélioration de la qualité du diagnostic et la mise en place de
systèmes exhaustifs d’enregistrement des cas ont permis d’aboutir à
un consensus sur cette augmentation en 1950. Ceci était difficile en
l’absence d’explications étiologiques convaincantes et de la
méthodologie peu rigoureuse des études réalisées jusqu’alors dans le
domaine.
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Épidémiologie descriptive
Cig/hab/j
15
10
5
E-U
France
Risque cumulé (/ mille)
Exemple : Évolution de la consommation moyenne de cigarettes par
habitants en France et aux États-Unis de 1950 à 1990 et de la mortalité par
cancer du poumon chez les hommes âgés de 40 à 44 ans en France et aux
États-Unis de 1950 à 1990 (source : Bouyer, 1995).
0
4
E-U
3
France
2
1
0
1950 1955 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990
Années
1950 1955 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990
Années
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Épidémiologie analytique
•
Étudie les causes et les facteurs de risques
– L’épidémiologie descriptive a conduit à un constat (augmentation de la
morbidité ou de la morbidité) dans une population(groupe, pays, …)
Hypothèse
Formulations d’hypothèses explicatives qu’il faut vérifier :
liaison entre un facteur à expliquer et un (des) facteur(s) explicatif(s)
Mise en place d’études
méthodologiquement correctes
Méthode pour la vérifier
Généralisation possible des résultats ?
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Épidémiologie analytique
Exemples Doll et Hill : il s’agit de 2 études portant sur les cancers
broncho-pulmonaires et la consommation de tabac
• étude cas-témoins (Doll et Hill, 1950, 1952) :
– 1 465 cas diagnostiqués dans 20 hôpitaux de Londres
– appariement 1 cas / 1 témoin sur le sexe, âge avec des patients
hospitalisés pour une pathologie non cancéreuse
– recueil de données relatives à la consommation de tabac, à
l’exposition à des polluants, …
– conclusions : l’usage de cigarettes est le facteurs le plus associé au
cancer broncho-pulmonaire
– étude toutefois critiquée lors de sa parution
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Épidémiologie analytique
• étude de cohorte (Doll et Hill, 1954, 1956) :
– but : comparer l’incidence des cancers broncho-pulmonaires en fonction
de la consommation de tabac à l’inclusion
– 40 000 médecins inclus
– les résultats confirment l’étude cas-témoins
– l’incidence des cancers broncho-pulmonaires est sensiblement plus
élevée chez les fumeurs par rapport aux non fumeurs
– l ’augmentation est fonction de la quantité consommée
– ….
FDR
Non fumeurs
Fumeurs
1-14 g/j 15-24 g/j ≥ 25 g/j
Consommation
TI (0/00)
0,07
0,47
0,86
1,66
RR
1,0
6,7
12,3
23,7
FDR : facteur de risque; TI : taux d’incidence; RR : risque relatif
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Les différents types d’enquête
•
Il existe différents types d’enquête épidémiologique
•
Leur utilisation répond à des critères particuliers
•
Elles peuvent être présentées sous différentes formes :
– en fonction de leur but
– selon une classification chronologique
– en fonction des caractéristiques de la population d’étude
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Les différents types d’enquête
•
Expériences :
– attribution de l’exposition contrôlée par l’investigateur
– randomisée ou non
ex : essais thérapeutiques, évaluation des actions de santé
•
Enquêtes d’observation :
– exposition indépendante de l’investigateur
– descriptives ou étiologiques
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Les différents types d’enquête
•
Classification chronologique :
Rétrospective
Prospective
temps
Maladie
Transversale
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Les différents types d’enquête
•
Classification selon les caractéristiques de la population d’étude :
– cohorte :
• individus d’une population (d’un échantillon représentatif),
• avant l’exposition au(x) facteur(s)
• Enquête idéale?
– exposés-non exposés :
• individus d’une population (d’un échantillon représentatif),
• l’exposition au(x) facteur(s) a déjà eu lieu
• Ex : Framingham, Hiroshima
– cas-témoins :
• comparaison de malades et de non malades « identiques »
• exposition antérieure à l’apparition de la maladie
– transversale :
• échantillon représentatif de la population, indépendant de l’exposition et de
l’état de santé
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Différents Types d’Études (1)
•
Étude de cohorte
– Avant l’exposition au(x) facteur(s)
– Après l’exposition au(x) facteur(s)
Malades
Exposés
Non Malades
Cohorte
Malades
Non Exposés
Non Malades
Cause
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Effet
Temps
Différents Types d’Études (2)
•
Étude cas-témoins
– Comparaison de malades et de non malades « identiques »
– Biais de classement
Exposés
Malades
Non Exposés
Exposés
Non Malades
Non Exposés
Exposition ?
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Détermination
de la maladie
Différents Types d’Études (3)
•
Étude transversale
– Unique
– Répétée
Non Malades
Malades
Non Malades Non Malades
Non Exposés
Exposés
Malades
Exposés
Non Malades Exposés Non Malades
Exposés
Exposés
Non Exposés
Non Exposés
Non Exposés
Malades
Temps
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Quelques références
•
Rumeau-Rouquette C, Blondel B, Kaminski M, Bréart G.
Epidémiologie méthodes et pratique, Médecine-Sciences Flammarion,
Paris, 1994.
•
Bouyer J, Hémon D, Cordier S, Derriennic F, Stücker I, Stengel B,
Clavel J. Epidémiologie : Principes et méthodes quantitatives, Inserm,
Paris, 1995.
© Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée
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