Méthodologie et outils statistiques : bases épidémiologiques Dr Roch Giorgi [email protected] LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée, Marseille, France http://cybertim.timone.univ-mrs.fr Introduction à l’épidémiologie Ce cours a pour but de présenter les différents types d’épidémiologie : – l’épidémiologie descriptive : elle a trouvé son développement par l’étude des maladies contagieuses; – l’épidémiologie analytique : dont le but est d’étudier les facteurs de risque de différentes maladies. L’épidémiologie d’intervention sera abordée dans le cours « Principe des essais contrôlés ». © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Épidémiologie descriptive • Contrôle sanitaire : vise à – repérer – isoler – soigner (patient et entourage) • Étude de la fréquence d’une maladie : – déterminer les priorités – détecter les modifications – variations temporelles, spatiales © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Épidémiologie descriptive Exemples : – application géographique : étude de Snow (Snow, 1855) • • • • épidémie de choléra à Londres au XIXème siècle étude de la répartition des cas selon les quartiers juxtaposition des cas et des fontaines de la ville détermination des fontaines contaminées – étude de Doll et Hill sur les cancers broncho-pulmonaires • constatation d’une augmentation de l’incidence de ce cancer chez l’homme dès 1930 • l’amélioration de la qualité du diagnostic et la mise en place de systèmes exhaustifs d’enregistrement des cas ont permis d’aboutir à un consensus sur cette augmentation en 1950. Ceci était difficile en l’absence d’explications étiologiques convaincantes et de la méthodologie peu rigoureuse des études réalisées jusqu’alors dans le domaine. © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Épidémiologie descriptive Cig/hab/j 15 10 5 E-U France Risque cumulé (/ mille) Exemple : Évolution de la consommation moyenne de cigarettes par habitants en France et aux États-Unis de 1950 à 1990 et de la mortalité par cancer du poumon chez les hommes âgés de 40 à 44 ans en France et aux États-Unis de 1950 à 1990 (source : Bouyer, 1995). 0 4 E-U 3 France 2 1 0 1950 1955 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 Années 1950 1955 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 Années © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Épidémiologie analytique • Étudie les causes et les facteurs de risques – L’épidémiologie descriptive a conduit à un constat (augmentation de la morbidité ou de la morbidité) dans une population(groupe, pays, …) Hypothèse Formulations d’hypothèses explicatives qu’il faut vérifier : liaison entre un facteur à expliquer et un (des) facteur(s) explicatif(s) Mise en place d’études méthodologiquement correctes Méthode pour la vérifier Généralisation possible des résultats ? © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Épidémiologie analytique Exemples Doll et Hill : il s’agit de 2 études portant sur les cancers broncho-pulmonaires et la consommation de tabac • étude cas-témoins (Doll et Hill, 1950, 1952) : – 1 465 cas diagnostiqués dans 20 hôpitaux de Londres – appariement 1 cas / 1 témoin sur le sexe, âge avec des patients hospitalisés pour une pathologie non cancéreuse – recueil de données relatives à la consommation de tabac, à l’exposition à des polluants, … – conclusions : l’usage de cigarettes est le facteurs le plus associé au cancer broncho-pulmonaire – étude toutefois critiquée lors de sa parution © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Épidémiologie analytique • étude de cohorte (Doll et Hill, 1954, 1956) : – but : comparer l’incidence des cancers broncho-pulmonaires en fonction de la consommation de tabac à l’inclusion – 40 000 médecins inclus – les résultats confirment l’étude cas-témoins – l’incidence des cancers broncho-pulmonaires est sensiblement plus élevée chez les fumeurs par rapport aux non fumeurs – l ’augmentation est fonction de la quantité consommée – …. FDR Non fumeurs Fumeurs 1-14 g/j 15-24 g/j ≥ 25 g/j Consommation TI (0/00) 0,07 0,47 0,86 1,66 RR 1,0 6,7 12,3 23,7 FDR : facteur de risque; TI : taux d’incidence; RR : risque relatif © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Les différents types d’enquête • Il existe différents types d’enquête épidémiologique • Leur utilisation répond à des critères particuliers • Elles peuvent être présentées sous différentes formes : – en fonction de leur but – selon une classification chronologique – en fonction des caractéristiques de la population d’étude © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Les différents types d’enquête • Expériences : – attribution de l’exposition contrôlée par l’investigateur – randomisée ou non ex : essais thérapeutiques, évaluation des actions de santé • Enquêtes d’observation : – exposition indépendante de l’investigateur – descriptives ou étiologiques © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Les différents types d’enquête • Classification chronologique : Rétrospective Prospective temps Maladie Transversale © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Les différents types d’enquête • Classification selon les caractéristiques de la population d’étude : – cohorte : • individus d’une population (d’un échantillon représentatif), • avant l’exposition au(x) facteur(s) • Enquête idéale? – exposés-non exposés : • individus d’une population (d’un échantillon représentatif), • l’exposition au(x) facteur(s) a déjà eu lieu • Ex : Framingham, Hiroshima – cas-témoins : • comparaison de malades et de non malades « identiques » • exposition antérieure à l’apparition de la maladie – transversale : • échantillon représentatif de la population, indépendant de l’exposition et de l’état de santé © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Différents Types d’Études (1) • Étude de cohorte – Avant l’exposition au(x) facteur(s) – Après l’exposition au(x) facteur(s) Malades Exposés Non Malades Cohorte Malades Non Exposés Non Malades Cause © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Effet Temps Différents Types d’Études (2) • Étude cas-témoins – Comparaison de malades et de non malades « identiques » – Biais de classement Exposés Malades Non Exposés Exposés Non Malades Non Exposés Exposition ? © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Détermination de la maladie Différents Types d’Études (3) • Étude transversale – Unique – Répétée Non Malades Malades Non Malades Non Malades Non Exposés Exposés Malades Exposés Non Malades Exposés Non Malades Exposés Exposés Non Exposés Non Exposés Non Exposés Malades Temps © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Quelques références • Rumeau-Rouquette C, Blondel B, Kaminski M, Bréart G. Epidémiologie méthodes et pratique, Médecine-Sciences Flammarion, Paris, 1994. • Bouyer J, Hémon D, Cordier S, Derriennic F, Stücker I, Stengel B, Clavel J. Epidémiologie : Principes et méthodes quantitatives, Inserm, Paris, 1995. © Roch Giorgi, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée