fiche_resume 2017CAPESfr

Profil N° (à remplir par VAS) FINANCEMENT Demandé
Acquis GIP Seine Aval / Ifremer
Fiche Résumé du sujet de thèse 2017 Champs disciplinaire Autres et Autres
Titre de la thèse : (1-2 lignes)
Capacité et fonctionnement trophique de la baie de Seine : relation avec le recrutement des espèces
nourriceries-dépendantes
3 mots-clés : (1 ligne) Capacité trophique, recrutement, écosystèmes côtiers ACRONYME CAPES
Unité/équipe encadrante :
UMR Inra - Agrocampus Ouest / Ecologie & Santé des Ecosystèmes, Rennes
Unité Ecologie et Modèles pour l’Halieutique, Ifremer Nantes.
Nom du responsable scientifique
Le Bris Hervé, UMR ESE, Rennes
nom du codirecteur le cas échéant :
Brind’Amour Anik, UR EMH, Nantes
Contact :
LE BRIS Hervé
65 rue de St Brieuc
CS 84215
35042 RENNES Cedex
Tél : [phone]
Fax : [phone]
Mail : [e-mail]
BRIND'AMOUR Anik
Rue de l'île d'Yeu
B.P. 21105
44311 Nantes Cedex 03
FRANCE
tel : [phone]
fax : [phone]
e-mail : [e-mail]
Contexte socioéconomique et scientifique : (10 lignes)
Le nombre de recrues d’une espèce nourricerie-dépendante étant directement proportionnel à la superficie de ces
habitats côtiers, le maintien de la taille ainsi que de la qualité de tels habitats est décisif dans le renouvellement des
espèces de poissons qui leur sont associées. Depuis les 30 dernières années, l’estuaire de Seine a subi de profondes
modifications morphologiques. Or, cet estuaire assure une fonction de nourricerie, indispensable au recrutement et
donc au renouvellement des stocks de plusieurs espèces de poissons. De récents travaux ont estimé à plus de 40%
la perte de production de juvéniles de soles en estuaire de Seine depuis 1850 (Rochette et al. 2013), la principale
cause évoquée étant la forte diminution de la surface des nourriceries - estimée à près de 33% - pour cette espèce
(Delsinne, 2005). En parallèle, la qualité trophique de certains habitats tels les vasières intertidales, montrent des
diminutions importantes de proies potentielles pour les poissons (e.g. Hediste diversicolor, Bessineton, 2009).
Les hypothèses et questions posées (8 lignes)
L'objectif général de la thèse est de comprendre les liens entre la capacité trophique de la baie de Seine et la
production de juvéniles de poissons. Il s’agit de décrire les structures trophiques au sein et entre les secteurs de la
baie de Seine, de quantifier les liens trophiques entre ces secteurs et de déterminer les relations entre leur
fonctionnement trophique et la qualité (croissance et condition) des juvéniles de poissons.
Les grandes étapes de la thèse et démarche (10-12 lignes)
1. Analyse des réseaux trophiques et estimation de la contribution relative des différents secteurs au régime
alimentaire des espèces sélectionnées.
2. Estimation de la variabilité temporelle de la capacité trophique de la baie de Seine et effets sur la croissance et la
condition des juvéniles
3. Quantification de la variabilité interannuelle de la capacité trophique et étude du lien avec le recrutement des
espèces ciblées.

Approches méthodologiques et techniques envisagées (4-6 lignes).
La thèse reposera sur les données issues des campagnes d'échantillonnage des juvéniles bentho-démersaux de la
baie de Seine ainsi que les données de faune benthique. Elle mobilisera i) des données issues d’analyse isotopique
et de contenus digestifs, ii) des données de biomasses de proies et prédateurs, d’indice de condition, de croissance
et d’indice de recrutement, iii) des données environnementales (débit, salinité, profondeur…). Elle fera appel à la
constitution de base de données, des analyses multivariées, des analyses de séries temporelles, des approches de
modélisation (GLM, GAM…) et des analyses géostatistiques.
Compétences scientifiques et techniques requises par le candidat (2 lignes)
Le candidat doit avoir des connaissances avérées en analyses de données et une aisance en programmation
(langage R). Des connaissances en écologie (marine) sont également essentielles.