La nourriture favorite du Microbiome - Pourquoi les fibres

LE MICROBIOTE INTESTINAL
« Les êtres humains sont des superorganismes, dont deux génomes déterminent le
phénotype : le génome hérité d’origine humaine (25 000 gènes) et le génome acquis de
l’environnement (plus d’1 million de gènes). Ces deux génomes doivent travailler
harmonieusement ensemble, comme un hologénome, afin de maintenir un bon état de
santé. La nutrition joue un rôle crucial en modulant directement notre microbiome et
notre santé. Une alimentation déséquilibrée peut transformer le microbiome en un
« pathogène » de nombreuses maladies. De plus en plus de preuves s’accumulent pour
soutenir l’hypothèse selon laquelle l’obésité et les troubles métaboliques associés se
développent en raison d’une inflammation de bas grade, chronique et systémique, induite
par un microbiote déséquilibré par l’alimentation ».
L Zhao - 2010
On emploie le terme microbiote pour désigner l’ensemble des micro-organismes et celui
de microbiome pour désigner l’ensemble de leurs gènes.
En 2008, sont lancés deux programmes de recherche, Metahit en Europe et Human
Microbiome Project aux Etats-Unis, et en 2011, l’ensemble du génome bactérien est
séquencé et identifié.
Le microbiote intestinal est actuellement l’objet d’énormément d’études et intéresse
beaucoup les médias et les indusriels.
Voici, en 57 minutes, une émission diffusée sur ARTE
http://www.dailymotion.com/video/x1jp95s_le-ventre-notre-deuxieme-cerveau_news
Celle-ci également, en 13 minutes :
https://www.youtube.com/watch?v=srXAw5GXkGg
Si le microbiote intestinal occupe une telle place dans notre santé, c’est largement de
par son influence sur le système immunitaire où il exerce une action modulatrice.
La constatation que les maladies auto-immunes et les allergies sont en forte
augmentation dans les pays développés, alors que les maladies infectieuses régressent, a
été faite durant les années 80.

Ces observations conduisent dès 1989 à formuler l’hypothèse de l’hygiène, selon
laquelle la diminution des infections microbiennes en était la cause.
En 2003, le Pr Graham Rook reformula cette hypothèse : ce n’était pas tant la diminution
de l’exposition aux pathogènes qui était délétère mais plutôt l’absence de contact avec
des microbes bénéfiques. On appela cette hypothèse « l’hypothèse des vhieux amis »
Dans cette vidéo, prise lors du 2ème sommet sur le microbiote en 2013, le Pr Rook
explique que le système immunitaire est un peu comme le cerveau, qu’il doit être
éduqué- et que ses « professeurs » sont des microbes.
S’il n’est pas éduqué, il s’emballe facilement, à la gâchette facile et s’attaque à des
innocents tels que des cellules du corps (ce qui donne des maladies auto-immunes) tels
que des aliments (ce qui donne les intolérances ou les allergies alimentaires) ou de
simples pollens, acariens (ce qui donne les allergies aériennes).
http://www.gutmicrobiotawatch.org/the-immune-system-is-like-an-army-an-
interview-with-prof-graham-rook/
Le Pr Rook a un site : http://www.grahamrook.net

Ce site est passionnant, il parle en effet des maladies auto-immunes et des allergies mais
également des troubles psychiatriques.
Cette raréfaction ou disparition du contact avec ces « vieux amis » entraînerait en effet
une plus grande vulnérabilité au stress et à la dépression (onglet « Psychiatry »).
Par ailleurs, dans l’onglet « Green space », il propose l’idée selon laquelle les effets
bénéfiques sur la santé, dûment constatés, des séjours en milieu naturels, seraient sans
doute en partie attribuables à une exposition plus importante à des micro-organismes.
Dans cette vidéo, il propose, après l’exposition de cette théorie, de verdir les villes afin
d’améliorer la biodiversité.
https://www.youtube.com/watch?v=dM7cqER3t9U&list=PLSFs2CJ-
iC6XDD6jmGZH0JO26CTfExKV_&index=6
Le schéma suivant est tiré de son livre : « The Hygiene Hypothesis and Darwinian
Medicine

La partie centrale, en violet, est occupée par l’intestin, dans lequel deux facteurs sont
essentiels :
-la qualité du microbiote
-la perméabilité de la barrière intestinale
Ces deux éléments sont liés, la dysbiose (un autre terme pour désigner un microbiote
altéré) et la perméabilité entretiennent des relations croisées.
La vidéo de Nathalie Delzenne, reçue à l’Académie Royale de Médecine de Belgique, sur
Youtube date de 2014. A partir de la minute 20, elle est consacrée aux prébiotiques et à
leurs effets bénéfiques dans l’obésité.
https://www.youtube.com/watch?v=CZ49vBQvWv0
La perméabilité intestinale peut également être altérée par des aliments, au premier
rang desquels se situe le gluten.
Beaucoup de médecins proches des médecines naturelles, des naturopathes mais aussi
des patients préfèrent recommander de ne manger ni grains, ni céréales, ni
légumineuses en cas de maladie auto-immunes.
COMMENT APPORTER DES PREBIOTIQUES ?
Les prébiotiques sont présents dans l’alimentation et peuvent également se trouver sous
forme de suppléments.
MANGER DES LEGUMES VARIÉS, EN GRANDE QUANTITÉ
Un changement alimentaire est susceptible d’amener en quelques semaines de
modifications du microbiote.
Un des leviers majeurs dans l’alimentation est représenté par les fibres alimentaires.
La nourriture favorite du Microbiome - Pourquoi les fibres des végétaux sont essentielles
https://www.youtube.com/watch?v=PF77iyMVXyQ
et
Fibres alimentaires, renaissance d'un concept en nutrition et santé: Nathalie Delzenne at
TEDxLiège
https://www.youtube.com/watch?v=InhKNq2wFFI&feature=youtu.be
Certaines fibres alimentaires sont en effet des prébiotiques, qui par définition favorisent
le développement des bactéries bénéfiques.

Elles sont issues du règne végétal à l’exception de la chitine présente dans la carapace
des crustacées.
Ce sont des polysacharrides qui résistent à la digestion et parviennent au côlon pour
être fermentées par les bactéries.
Les prébiotiques les plus connus sont l’inuline et les amidons résistants. Il en existe
probablement une infinité. Il nourrissent spécifiquement certaines espèces bactériennes
- certaines bactéries aiment peut-être les salsifis, alors que d’autres vont préférer le
chou vert ou les poivrons…
D’où l’intérêt d’une alimentation variée. En effet, la richesse –la biodiversité du
microbiote- est corrélée à la bonne santé.
Les légumes n’apportent pas que des fibres, ils exercent aussi des effets bénéfiques sur
la santé car ils sont riches en anti-oxydants et en toute sorte de phytonutriments dont on
est loin de connaître tous les modes d’action.
Un polypénol, le fameux resveratrol présent dans le vin, a également des vertus
prébiotiques
Le meilleur service à rendre à la population est de fournir de bonnes recettes de
légumes.
Les AMAP qui fournissent souvent de grandes quantités de légumes qu’on ne sait pas
utiliser y ont pensé et on trouve des recettes sur le site : http://recettes.de/amap
SE SUPPLÉMENTER EN FIBRES ?
A défaut de consommer suffisamment de légumes, il est possible de prendre des
suppléments de fibres, sous forme de comprimés ou de poudres.
Cela reste certainement un moyen bien inférieur à une alimentation riche en légumes
variés. C’est cependant préférable à ne pas absorber assez de fibres.
La plupart des prébiotiques sont des sucres complexes (polysaccharides,
oligosaccharides) que l’organisme ne peut digérer et que les bactéries vont fermenter.
L’industrie fabrique des prébiotiques, c’est d’ailleurs un produit issu de l’inuline et de
fructo-oligosaccharides qui est à l’origine du terme.
Il est présent sur le marché sous la marque Synergy.
Les xylooligosaccarides, dont le Xylitol, présent dans les chewing-gum, sont issus du
bois.
Le polydextrose est très utilisé dans l’industrie agroalimentaire comme édulcorant et est
un produit de synthèse, à partir de dextrose et de sorbitol.
Le lactulose est produit par la synthèse de lactose et de fructose, il donne le laxatif
Duphalac.