Your Quality, our Priority Qualité et sécurité des aliments 3/6/2014 Vision globale, réponse d’experts Agenda • Présentation de la société • Biologie moléculaire • • • • Authenticté Sécurité alimentaire Contrôle à l’élevage Santé animal • Analyse métagénomique • • • • La méta, quoi ? Comment cela fonctionne ? Etudes de cas Conclusions www.quality-partner.be www.agrifood-metagenomics.com Structure Notre groupe Une vision, deux entreprises Vision globale, réponse d’expert, avec déontologie Une vision, deux entreprises Pour une approche globale de qualité et de la sécurité alimentaire KNOWLEDEGE & STRATEGY SHAREHOLDERS ANALYSES/ CERTIFICATION/ INSPECTION Expertise, 2 Spin-offs issues de la Faculté de Médecine Vétérinaire de l’Université de Liège Innovation CONSULTANCE/C OACHING Notre groupe Structure & Déontologie • Certification • Inspection • Analyse-expertise • Consultance • Formation ONE STOP SHOPPING Key facts Our activities in brief Accredited 2 companies BELAC OR Expected Turnover GA +/-6 MILLIONS € NIC 11 000 audits/year Three plants Control body ISO 22000 SAC XVI % Growth > 4000 customers ISO 17025 : Labo ISO 17020 : Inspection EN 45011 : Products Certification ISO 17021 : Mgmt Systems Cert 1st INS Retail INS Famring LABO Food microbio Your Quality, our Priority Biologie moléculaire Biologie moléculaire Authenticité: Identification et quantification des espèces animales •Identification jusqu’à 24 espèces/test •Quantification du porc, boeuf, poulet, dinde, cheval, etc •Identification de 16 espèces de poissons Sécurité alimentaire: Identification des bactéries, levures/moisissures et virus •Détection des virus : norovirus et hepatite A •Identification des bactéries •Identification des levures/moisissures www.quality-partner.be www.agrifood-metagenomics.com Biologie moléculaire Génétique animale: contrôle et gestion à l’élevage •Tremblante du mouton (Ovine scrapie susceptibility) •Hypertrophie musculaire (Cattle double muscling) •Hyperthermie maligne (Porcine stress syndrom) Santé animale: detection de maladies animales •PRRS Virus chez le porc •Psittacine Beak and Feather Disease virus (PBFD) •Chlamydophila psittaci pour les oiseaux de compagnie www.quality-partner.be www.agrifood-metagenomics.com Your Quality, our Priority Métagenomique Metagenomique Une rupture technologique Approche classique Metagénomique Dépôt de deux brevets européens: « Metagenomic Analysis of Samples » « Detection Method » www.quality-partner.be www.agrifood-metagenomics.com Métagenomique La métagénomique ciblée fournit l’identification, en une seule analyse, de plusieurs milliers de microorganismes (Bactérie et levures/moisissures) présents dans un échantillon. Approche classique Travail Temps Coût OnlyRésultats culturablebiaisés bacteria ! www.quality-partner.be Métagenomique Beaucoup plus d’informations Flexible Coût efficacité Rapide www.agrifood-metagenomics.com Comment ça marche ? Blabla Blabla BlablBlablBlabla BlBlablBlablBlablabla BlaBlablbl BlablBlablBlablBlablBlabl BlablBlablBlabl Blabl Blabla Blabla BlablBlablBlabl Bioinformatics BlablBlablBlabla High throughput sequencing BlBlablBlablBlablabla BlaBlablbl BlablBlablBablBlabl BlablBlablBlabl Blabl Blabla Blabla BlablBlablBlabla BlBlablBlablBlablabla BlaBlablbl BlablBlablBablBlabl BlablBlablBlabl www.agrifood-metagenomics.com Applications Alimentation •Contrôle qualité •Innovation •R&D, Détermination ou extension de la durée de vie Santé humaine •Tractus intestinal, peau, poumons, maladies, cancers •Etudes transversales, cohortes, cas témoins •Pré and pro biotiques Santé animale Pharmacie et cosmétique Environnement www.quality-partner.be •Nourriture pour animaux •Pré and probiotiques •Tractus intestinal •Contrôle qualité •Innovation •Détermination de la durée de vie •Remédiation (eau, sols) •Suivi de la qualité •Plantes, graines www.agrifood-metagenomics.com Etude de cas 1 Gestion d’incident Résolutions de problèmes de qualité Pas de solution Solution Non conforme € Etude de cas 1 Gestion d’incident Viande de bœuf altérée Normal flora Conforme Spoilage flora Non conforme Etude de cas 2 Altération de produits Salami non conforme • Produit de viande fermenté • Produit non conforme => gonflement • Analyses microbiologiques conformes • Plusieurs lots de produits ont été perdus • Pour le producteur, le ferment est à l’origine de la contamination www.quality-partner.be www.agrifood-metagenomics.com Etude de cas 2 Altération de produits Ferment Produit conforme Produit non conforme Etude de cas 3 Maitriise de la durée de vie Avec et sans lactate / di acétate • Augmentation de la durée de vie • Nouveaux marchés à l’export • Clean label • Identification de la flore bactérienne avec et sans un mélange de lactate/diacétate www.quality-partner.be www.agrifood-metagenomics.com Etude de cas 3 Maitriise de la durée de vie Carnobacterium avec lactate/dia cetate Bactéries altérantes sans lactate/diacet ate Etude de cas 4 Allongement de la durée de vie Viande de bœuf pour exportation Comparaison de la viande de boeuf belge avec des viandes du Brésil, d’Argentine et de Nouvelle Zélande VS DLC X semaines X mois Comparaison des conditions de stockage www.quality-partner.be www.agrifood-metagenomics.com Etude de cas 4 Produits agroalimentaires Allongement de la durée de vie Viande de bœuf pour exportation 100% 90% 80% 70% 60% 50% 40% 30% 20% 10% 0% -1°C +4°C j15J30 j45 j15 J30 j45 Staphylococcus_vitulinus Staphylococcus_saprophyticus Staphylococcus_equorum Lactococcus_lactis Yersinia_ruckeri Pseudomonas_marincola Planomicrobium_psychrophilum Exiguobacterium_profundum Atopostipes_suicloacalis Jeotgalicoccus_psychrophilus Aeromonas_hydrophila Macrococcus_caseolyticus Leuconostoc_inhae Leuconostoc_carnosum Lactobacillus_graminis Leuconostoc_gelidum Lactobacillus_sakei Brochothrix_thermosphacta Carnobacterium_gallinarum Leuconostoc_gasicomitatum Carnobacterium_divergens Lactococcus_piscium Lactobacillus_algidus 100% 90% 80% 70% 60% 50% 40% 30% 20% 10% 0% -1°C +4°C j15 J30 j45 j15 J30 j45 Staphylococcus_vitulinus Staphylococcus_saprophyticus Staphylococcus_equorum Lactococcus_lactis Yersinia_ruckeri Pseudomonas_marincola Planomicrobium_psychrophilum Exiguobacterium_profundum Atopostipes_suicloacalis Jeotgalicoccus_psychrophilus Aeromonas_hydrophila Macrococcus_caseolyticus Leuconostoc_inhae Leuconostoc_carnosum Lactobacillus_graminis Leuconostoc_gelidum Lactobacillus_sakei Brochothrix_thermosphacta Carnobacterium_gallinarum Leuconostoc_gasicomitatum Carnobacterium_divergens Lactococcus_piscium Lactobacillus_algidus Etude de cas 5 R&D: amélioration du process Contrôle qualité Gestion de la qualité du processus de nettoyage/désinfection Etude de cas 5 R&D: amélioration du process Cleaning / Disinfection procedures Pseudomona s from biofilms Etude de cas 6 Improving Quality Raw beef minced meat during shelf life •Pre embalé vendus au supermarchés (SM1; n=8) à J0 et à J2 •Boucheries internes aux supermarchés (SM2; n=8) et boucheries (Butchery; n=7) à J0 et J+2 •Restaurants (n=6) à J0 •Sandwichs Bars (n=6) à J0 www.quality-partner.be n=59 www.agrifood-metagenomics.com Etude de cas 6 (Bray-Curtis index) Improving Quality Xanthomonas Pseudomonas Brochothrix Leuconostoc gelidum No dominante flora Lactobacillus algidus Lactococcus piscium Photobacterium Lactobacillus algidus Paris, 31 mars 2014 piscium Lactococcus Streptococcus thermophilus J0 G1 G9 G2 G8 G3 G7 G6 G5 G4 Clostridium haemolyticum J2 J0 Lactobacillus algidus Etude de cas 7 R&D: amélioration du process Fromage de Herve • Connaissance de la flore du fromage • Comparaison entre le cœur et la croute • Comparaison entre différents processus de fabrication (lait cru/pasteurisé) • Contrôle qualité • Contrôle de la durée de vie • Situation par rapport aux concurrents www.quality-partner.be www.agrifood-metagenomics.com Echantillons 4 soft cheeses 1 From raw milk Rind Cor e 2 3 From raw milk From pasteurized milk Rind Cor e Rind 4 Cor e Other cheese made with raw milk Rind 8 échantillons Analyse de microbiologie classique et de métagénomique Cor e Etude de cas 7 R&D: amélioration du process Fromage de Herve Microbiologie classique RESULTATS 1 2 3 4 Rind Core Rind Core Rind Core Rind Core RESULTATS 48 genres and 163 espèces Beaucoup d’espèces bactérienne différentes Moins d’espèces, principalement Lactococcus lactis (97,6%) au coeur 1 Rind 3 2 Core Rind Core Rind 4 Core Rind Core RESULTATS Core: Lactoccocus lactis and/or cremoris Rind : - Psychrobacter glacinola - Staphylococcus equorum - Corynebacterium casei - Marinilactibacillus psychrotolerans - Brevibacterium spp - Psychroflexus spp 1 Rind 3 2 Core Rind Core Rind 4 Cor e Rind Core RESULTATS Toutes ces espèces sont présentes en différentes quantité suivant l’origine et le procédé de fabrication du fromage Deux espèces sont présentes en majorité dans ces matrices donnant des indications sur le procédé de fabrication Lactoccocus lactis susp. Cremoris et Leuconostoc citreum 1 Rind 3 2 Core Rind Core Rind 4 Core Rind Core Etude de cas 8 Contrôle qualité Probiotics European Scientific League Probiotics www.quality-partner.be www.agrifood-metagenomics.com Etude de cas 8 Contrôle qualité Probiotiques Bactéries mortes et vivantes Bactéries vivantes Probiotique 1 Probiotique 2 Probiotique 3 Etude de cas 9 Tractus intestinal Maladie de Crohn Health Mucosa Acute inflammation www.quality-partner.be Gram negative proliferation Invasion Crohn’s disease www.agrifood-metagenomics.com Etude de cas 9 Tractus intestinal Maladie de Crohn (Pérez-Brocal, 2013) Conclusions Une approche intégrée Des réponses concrètes à vos questions … • Quel microorganisme cause l’altération de mon produit ? • Quel est l’évolution de la flore durant la conservation ? • Comment augmenter la durée de vie de mon produit ? • Quel est l’impact d’une matière première, d’un changement de recette ? • Le processus de fabrication est-il maitrisé ? www.quality-partner.be www.agrifood-metagenomics.com Conclusions Une approche intégrée Contrôler - qualité du produit fini Contrôler son risque - process de la valeur sur le Ajouter produit - matières premières Créer et développer - Produits innovants Atteindre de nouveaux marchés Créer des process produits innovants - nouveaux Augmenter vos bénéfices - nouveaux critères de qualité Résoudre - contamination problem Arrêt des pertes financières Contrôler son image - spoilage process Contact Quality Partner En Hayeneux 62 B4040 HerstalBelgium +32 (0) 4 240 75 00 [email protected] www.quality-partner.be Laurent Delhalle, PhD [email protected] www.agrifood-metagenomics.com