Rapport sur l`état et les tendances des écosystèmes

C S A S
Canadian Science Advisory Secretariat
S C C S
Secrétariat canadien de consultation scientifique
This series documents the scientific basis for the
evaluation of aquatic resources and ecosystems
in Canada. As such, it addresses the issues of
the day in the time frames required and the
documents it contains are not intended as
definitive statements on the subjects addressed
but rather as progress reports on ongoing
investigations.
La présente série documente les fondements
scientifiques des évaluations des ressources et
des écosystèmes aquatiques du Canada. Elle
traite des problèmes courants selon les
échéanciers dictés. Les documents qu’elle
contient ne doivent pas être considérés comme
des énoncés définitifs sur les sujets traités, mais
plutôt comme des rapports d’étape sur les
études en cours.
Research documents are produced in the official
language in which they are provided to the
Secretariat.
This document is available on the Internet at:
Les documents de recherche sont publiés dans
la langue officielle utilisée dans le manuscrit
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ISSN 1499-3848 (Printed / Imprimé)
ISSN 1919-5044 (Online / En ligne)
© Her Majesty the Queen in Right of Canada, 2010
© Sa Majesté la Reine du Chef du Canada, 2010
Research Document 2010/030
Document de recherche 2010/030
Ecosystem status and trends report:
Estuary and Gulf of St. Lawrence
ecozone
Rapport sur l’état et les tendances des
écosystèmes : écozone de l’estuaire et
du golfe du Saint-Laurent
Réjean Dufour1, Hugues Benoît2, Martin Castonguay1, Joël Chassé2, Laure Devine1, Peter Galbraith1,
Michel Harvey1, Pierre Larouche1, Sylvie Lessard1, Brian Petrie3, Louise Savard1, Claude Savenkoff1,
Liliane St-Amand1 and Michel Starr1
1 Department of Fisheries and Oceans / Ministère des Pêches et Océans
Maurice-Lamontagne Institute / Institut Maurice Lamontagne, Mont-Joli, QC
2 Department of Fisheries and Oceans / Ministère des Pêches et Océans
Gulf Fisheries Centre / Centre des Pêches du Golfe, Moncton, NB
3 Department of Fisheries and Oceans / Ministère des Pêches et Océans
Bedford Institut of Oceanography / Institut d’Océanographie de Bedford, Darthmouth, NS

iii
TABLE OF CONTENTS / TABLE DES MATIÈRES
ABSTRACT ................................................................................................................................. V
RÉSUMÉ...................................................................................................................................... V
1.0 INTRODUCTION ....................................................................................................................1
2.0 PHYSICAL SYSTEM - SYSTÈME PHYSIQUE......................................................................2
2.1 GEOMORPHOLOGIC STRUCTURE AND CHARACTERISTICS - STRUCTURE ET CARACTÉRISTIQUES
GÉOMORPHOLOGIQUES..........................................................................................................2
2.2 WATER MASSES - MASSES D’EAU ..........................................................................................4
2.3 SURFACE LAYER - COUCHE DE SURFACE................................................................................5
2.4 WINTER WATER MASSES, SEA ICE, SUMMER COLD INTERMEDIATE LAYER AND WINTER AIR
TEMPERATURES - MASSES D’EAU HIVERNALE, GLACES DE MER, COUCHE INTERMÉDIAIRE FROIDE
D’ÉTÉ ET TEMPÉRATURES DE L’AIR HIVERNALES......................................................................7
2.5 DEEP LAYER TEMPERATURE, SALINITY AND DISSOLVED OXYGEN INTER-DECADAL VARIABILITY -
VARIABILITÉ INTERDÉCENNALE DE LA TEMPÉRATURE, DE LA SALINITÉ ET DE LA CONCENTRATION
D’OXYGÈNE DISSOUS DE LA COUCHE PROFONDE...................................................................11
2.6 WATER LEVEL - NIVEAUX D’EAU ...........................................................................................12
3.0 SOME ELEMENTS OF THE GULF ECOSYSTEM DYNAMICS - CERTAINS ÉLÉMENTS
DE LA DYNAMIQUE DES ÉCOSYSTÈMES DU GOLFE...................................................13
3.1 SEASONAL BIOLOGICAL PRODUCTION CYCLES - CYCLES SAISONNIERS DE PRODUCTION
BIOLOGIQUE ........................................................................................................................13
3.2 LOWER ESTUARY–GASPÉ CURRENT–SOUTHWESTERN GULF COMPLEX - COMPLEXE ESTUAIRE
MARITIME–COURANT DE GASPÉ–SUD OUEST DU GOLFE.........................................................15
3.3 NORTHWESTERN GULF (ANTICOSTI GYRE) - NORD OUEST DU GOLFE (GYRE D’ANTICOSTI) .....19
3.4 NORTHEASTERN GULF - NORD EST DU GOLFE ......................................................................21
3.5 COASTAL ZONES - ZONES CÔTIÈRES....................................................................................22
4.0 STATUS AND TRENDS OF PHYSICOCHEMICAL VARIABLES AND SELECTED
SPECIES - ÉTAT DES VARIABLES PHYSICO-CHIMIQUES DE CERTAINES ESPÈCES
ET TENDANCES.................................................................................................................23
4.1 PHYSICOCHEMICAL VARIABLES – VARIABLES PHYSICO-CHIMIQUES........................................23
4.1.1 Water quality and hypoxia - Qualité de l’eau et hypoxie ............................................23
4.1.2 Ocean acidification - Acidification de l’océan.............................................................25
4.2 PHYTOPLANKTON - PHYTOPLANCTON..................................................................................27
4.2.1 Trends in productivity - Tendances relatives de la productivité .................................29
4.2.2 Trends in composition - Tendances relatives de la composition................................30
4.2.3 Non indigenous planktonic species - Espèces de plancton non indigènes................31
4.2.4 Trends in harmful algal blooms (HAB) - Tendances relatives aux proliférations
d’algues nuisibles .......................................................................................................34
4.3 ZOOPLANKTON - ZOOPLANCTON ..........................................................................................36
4.3.1 AZMP Sections. - Sections du PMZA ........................................................................37
4.3.2 Macrozooplankton - Macrozooplancton .....................................................................39
4.4 FISH AND MACROINVERTEBRATES - POISSONS ET MACROINVERTÉBRÉS ...............................43
4.4.1 Estuary and Northern Gulf of St. Lawrence - Estuaire et nord du golfe du
Saint-Laurent.......................................................................................................................43
4.4.2 Southern Gulf of St. Lawrence - Sud du golfe du Saint-Laurent................................47
4.5 SEALS AND WHALES - PHOQUES ET BALEINES ......................................................................60

iv
4.5.1 Seals - Phoques.........................................................................................................61
4.5.2 Whales - Baleines ......................................................................................................65
4.6 MARINE BIRDS - OISEAUX MARINS........................................................................................78
4.6.1 Population trends - Tendances des populations........................................................79
4.6.2 Biological indicators - Indicateurs biologiques ...........................................................84
5.0 CONTAMINANTS - CONTAMINANTS.................................................................................88
5.1 CHEMICAL CONTAMINATION – CONTAMINATION CHIMIQUE.....................................................88
5.1.1 Sources, transport and distribution - Sources, transport et diffusion .........................91
5.2 METALS - MÉTAUX ..............................................................................................................93
5.3 PCBS AND OTHER ORGANOCHLORINE CONTAMINANTS - BPC ET AUTRES CONTAMINANTS
ORGANOCHLORÉS ...............................................................................................................98
5.4 POLYCYCLIC AROMATIC HYDROCARBONS (PAHS) - HYDROCARBURES AROMATIQUES
POLYCYCLIQUES (HAP) .....................................................................................................104
5.5 ORGANOMETALLIC COMPOUNDS - COMPOSÉS ORGANOMÉTALLIQUES .................................107
5.6 NEW CONTAMINANTS – NOUVEAUX CONTAMINANTS............................................................112
ACKNOWLEDGEMENTS - REMERCIEMENTS......................................................................115
REFERENCES .........................................................................................................................116
FIGURES..................................................................................................................................152

v
Correct citation for this publication:
La présente publication doit être citée comme suit:
Dufour, R., Benoît, H., Castonguay, M., Chassé, J., Devine, L., Galbraith, P., Harvey, M.,
Larouche, P., Lessard, S., Petrie, B., Savard, L., Savenkoff, C., St-Amand, L. and Starr,
M. 2010. Ecosystem status and trends report: estuary and gulf of St. Lawrence ecozone.
DFO Can. Sci. Advis. Sec. Res. Doc. 2010/030. v + 187 p.
Dufour, R., Benoît, H., Castonguay, M., Chassé, J., Devine, L., Galbraith, P., Harvey, M.,
Larouche, P., Lessard, S., Petrie, B., Savard, L., Savenkoff, C., St-Amand, L. et Starr, M.
2010. Rapport sur le status et les tendances de l’écosystème : écozone de l’estuaire et du
golfe du Saint-Laurent. MPO Sec. Can. Cons. Sci. Doc. Res. 2010/030. v + 187 p.
ABSTRACT
This document was produced under the umbrella of the national ecosystem status and trends
report program and deal with the estuary and gulf of St. Lawrence ecozone. It is structured
around the status and trends of some important marine species and physico-chemical variables
of the ecosystem.
The national ecosystem status and trends report will support priority-setting for a national
biodiversity agenda and will integrate national and provincial ecosystem-based information. It
will report on many large terrestrial and marine ecozones.
RÉSUMÉ
Le présent document a été produit dans la foulée du programme national sur l’état et les
tendances des écosystèmes et traite de l’écozone de l’estuaire et du golfe du Saint-Laurent. Il
s’articule autour de l’état et des tendances de plusieurs espèces marines ainsi que de certaines
variables physico-chimiques importantes de l’écosystème.
Le rapport national sur l’état et les tendances des écosystèmes servira à établir les priorités
pour un programme national sur la biodiversité et intégrera de l’information écosystémique de
portée nationale et provinciale. Il traitera de nombreuses écozones terrestres et marines
d’envergure.