ECBU MDS - Moodle Angers

12/04/2017
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Infections urinaires :
diagnostic et traitement
Matthieu Eveillard
Laboratoire de bactériologie, CHU Angers
Département de Pharmacie, UFR Santé, Université d’Angers
Formation des Maîtres de stage en officine – 25/04/2017
Introduction
- Infections les plus fréquentes
- On parle d’infection urinaire en présence d’une bactérie pathogène dans l’urine
et d’une symptomatologie compatible.
- Les IU peuvent concerner les voies urinaires basses ou les voies urinaires hautes.
Les signes pouvant évoquer une IU haute sont :
- Environ 50% des femmes souffriront d’au moins un épisode symptomatique au cours
de leur vie.
- Certains facteurs de risque peuvent faire évoquer une IU compliquée
Microbiologie : E. coli est responsable de 75 à85% des IU communautaires
Infections urinaires - diagnostic

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Le dépistage : bandelette réactive urinaire
Très bonne valeur prédictive négative
Positive si leucocytes ou nitrites positifs
Leucocytes : activité estérase
Nitrites : activité nitrate réductase
Les nitrites ne sont positifs que si la bactérie a une activité nitrate réductase,
Les leucocytes peuvent ne pas être positifs en cas de neutropénie.
Pour une cystite simple*, la BU est suffisante (ECBU non utile)
Sinon (infections urinaires « hautes », cystites compliquées), en cas de BU positive,
ECBU nécessaire
* Cystite sans risque de survenue de complication
ECBU : le prélèvement
Risques +++ de contamination par
les flores commensales
(peau, vagin, tube digestif)
Précautions au moment du
prélèvement
- Toilette locale
- Éliminer le premier jet
Dans pot stérile : acheminer le plus rapidement possible au laboratoire (ou conserver à +4°C)
Tubes boratés : conservation à température ambiante
ECBU : les étapes non culturales
Examen macroscopique : trouble / limpide
Numération des leucocytes et des hématies
Manuelle Automatisée
Examen microscopique après coloration de Gram :
De moins en moins réalisé en systématique
Limite de sensibilité : entre 10
4
et 10
5
UFC/ml
Normales :
Leucocytes < 10
4
/ ml
Hématies < 10
4
/ ml

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Milieux de culture : chromogènes
Principe : substrats dans le milieu : si enzymes bactériennes, colonies colorées
Colonies roses
et indole + => E. coli
En fonction de la couleur : orientation et
évaluation du polymorphisme de la culture
Culture polymorphe
(> 2 germes)
Ensemencement : 100µl d’urine diluée au 1/100 : 1 colonie correspond à 10
3
UFC/ml
La plupart des bactéries responsables d’IU
cultivent sur milieu chromogène
Si absence de culture et nombreuses bactéries au Gram
Ensemencement de milieux plus riches
(gélose au sang…)
- Nécessite des cultures bactériennes pures
- Résultats très rapides (quelques minutes)
- Identification des bactéries à l’aide des
spectres protéiques obtenus
- Comparaison à des banques de données
validées
Spectrométrie de masse
(Technique MALDI-TOF)
Identifications bactériennes
Profils protéiquesMétabolisme bactérien
Techniques manuelles
Techniques automatisées
Interprétation des résultats d’ECBU
1 colonie sur la gélose = 10
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UFC/ml de l’urine de départ
Culture
mono microbienne
Culture
2 germes
Culture
> 2 germes
- E. coli
- Staphylococcus
saprophyticus
Antibiogramme
si ≥ 10
3
UFC/ml
- Entérobactéries
autres qu’E.coli
- Entérocoques
- Corynebacterium urealyticum
- Pseudomonas aeruginosa
- Staphylococcus aureus
Homme Femme
Antibiogramme
si ≥ 10
3
UFC/ml
Antibiogramme
si ≥ 10
4
UFC/ml
Autre bactérie
Antibiogramme
si ≥ 10
5
UFC/ml
Cas particuliers :
- Femme enceinte sans signe clinique (bactériurie asymptomatique) : Antibiogramme
si ≥ 10
5
UFC/ml
- Sonde urinaire : pas d’antibiogramme (sauf si patient d’oncologie ou maladies du sang)
Mêmes critères
mais identifications
sans antibiogramme
Plus de
2 germes
+
quantification
globale
Souches conservées
si demande

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Antibiogrammes
Milieu liquide (CMI)
Infections urinaires - traitement
Recommandations conférence de consensus SPILF 2015
Quelques données récentes
sur la résistance d’E. coli aux antibiotiques
Antibiotique Population spécifique Souches non sensibles
< 5% Fosfomycine-trométamol
Nitrofurantoïne
3%
2%
Proche de 5% C3G
Aztreonam
Fluoroquinolones Cystite simple et âge < 65
4-5% (BLSE ++)
Env. 5%
3-5%
10 à 20% Fluoroquinolones
Pivmécillinam
IU à risque de
complication
Tous types d’IU confondus
10-25%
12-15%
> 20% Amoxicilline
Amoxicilline + AC
Cotrimoxazole
45%
25-35%
20-25%

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Cystite simple
Cystite à risque de complication
Cystite récidivante
Apports hydriques suffisants
Mictions non retenues
Régularisation du transit
intestinal
Canneberge (36 mg/j de
proanthrocyanidine)
Œstrogènes en application
locale si ménopause sur avis
gynécologique
Pyélonéphrite aiguë (sans signe de gravité)