Lesliaisonsforméespeuventêtreforte(liaisoncovalente)maisellessontgénéralementfaibles.Lorsqu’uneffet
àcourttermeestsouhaitédefaçonàmettrefinàl’actiondumédicament,onpréfèreunemoléculeformantdes
liaisonsfaiblesaveclerécepteur(parexemplelesantidépresseurs)etinversementpouruneactionprolongée
(chimiothérapiesurunetumeur)elledoitformeruncomplexeirréversibleavecsonrécepteur.
‐ Liaisonscovalentes:(
rG=‐40à‐110kcal/mol)liaisonforteavecpartaged’électrons.
‐ Liaisonsioniques(ouélectrostatiques):(
rG=‐5à‐10kcal/mol)cesliaisonssontmoinsfortesqueles
liaisonscovalentesmaisellesrestentefficacesàdesdistancesrelativementplusgrandesquepourles
autrestypesdeliaisons.
‐ InteractionsIon‐dipôleetdipôle‐dipôle:(
rG=‐0,5à‐7kcal/mol) lacharged’undipôleétantplus
faiblequecelled’union,uneinteractiondipôle‐dipôleestplusfaiblequ’uneinteractionion‐dipôle,elle‐
mêmeplusfaiblequ’uneinteractionionique.Cetyped’interactions’établitlorsqueleschargesde
signesopposéssontadéquatementalignées.L’attractionquienrésultepeutcontribuerdefaçon
significativeàl’affinitéentrelemédicamentetsaciblesilasurfacedecontactentrelesatomesdes
deuxmoléculesestgrande.
‐ Laliaisonhydrogène:(
rG=‐3à‐5kcal/mol) cesontdesinteractionsentreunatomed’hydrogène
attachéàunatomeXélectronégatifetunatomeYluiaussiélectronégatifpourvud’undoublet
éléconiquenon‐liant.
‐ Complexationàtransfertdecharge:(
rG=‐1à‐7kcal/mol)cetteinteractions’établitlorsqu’une
molécule(ouungroupe)électro‐donneuse(i.e.,systèmesélectroniquesπtelsquedesalcènes,alcynes
oucyclesaromatiquesporteursdesubstituantsélectro‐donneursoudesgroupesconstituésd’atomes
avecdesdoubletsnon‐liantstelsquel’oxygène,l’azoteetlesouffre)contacteuneautremolécule
électro‐acceptrice(i.e.,systèmespossédantdesorbitalesπdéficientesenélectrontelsquedesalcènes,
alcynesoucyclesaromatiquesporteursdesubstituantsélectro‐accepteursoudesprotonsfaiblement
acides).Ils’agitenfaitd’uneinteractiondipole‐dipolemoléculaire.
‐ Interactionshydrophobes:(
rG=‐1à‐3kcal/mol)lesparticuleshydrophobess'attirentdansunmilieu
aqueuxetsontmaintenuesensembledeparlesforcesexercéesparlesmoléculesd'eauquiles
entourent.Ellescorrespondentàuneassociationdechaîneshydrocarbonées(constituéepardes
atomesdecarboneetd’hydrogènesliésentreeuxpourformerdesgroupementsméthylène–CH2–.)
dansunmilieuaqueuxoupolaire.
Parexemple,l’acétylcholineetlerécepteurnicotiniqueAChn: