MCB-1000 : Microbiologie générale -

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MCB-1000 : Microbiologie générale
NRC80098
Automne 2014
Mode d'enseignement:Présentiel
Temps consacré:3-0-6
Crédit(s):3
Rappel des notions de classification des microorganismes et de microscopie. Étude de la
morphologie, de la nutrition, de la culture et de la génétique des bactéries. Introduction à
la microbiologie des microorganismes eucaryotes, à la virologie, à l'immunologie et à
l'écologie microbienne.
Les étudiants des programmes de biochimie et microbiologie doivent s'inscrire en
concomitance avec le cours COM-1910.
Plage horaire:
Cours en classe
mardi 09h30 à 10h20 PLT-1112 Du 2 sept. 2014 au 12 déc. 2014
jeudi 08h30 à 10h20 PLT-1112 Du 2 sept. 2014 au 12 déc. 2014
Il se peut que l'horaire du cours ait été modifié depuis la dernière synchronisation avec
Capsule.Vérifier l'horaire dans Capsule
Site de cours:https://www.portaildescours.ulaval.ca/ena/site/accueil?idSite=54993
Coordonnées et disponibilités
Michel Frenette
Professeur
VCH-3451, FMD-1766
[email protected]
[phone]poste5502
Soutien technique : Pour recevoir du soutien technique relatif à l'utilisation du Portail des Cours, contactez :
Comptoir LiberT (FSG)
Pavillon Adrien-Pouliot, Local 3709
[email protected]
418-656-2131poste 4651
Toutes sessions (du 1 janvier au 31 décembre)
Lundi 08h00 à 18h45
Mardi 08h00 à 18h45
Mercredi 08h00 à 18h45
Jeudi 08h00 à 18h45
Vendredi 08h00 à 16h45

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Sommaire
Description du cours ....................................................................................................................................................................... 3
Objectifs .................................................................................................................................................................................... 3
Objectifs spécifiques ................................................................................................................................................................. 3
Méthodologie ............................................................................................................................................................................ 6
Place du cours dans le programme .......................................................................................................................................... 6
Contenu et activités ........................................................................................................................................................................ 6
Évaluations et résultats ................................................................................................................................................................... 7
Consignes sur les examens ...................................................................................................................................................... 7
Liste des évaluations ................................................................................................................................................................ 7
Informations détaillées sur les évaluations sommatives ........................................................................................................... 8
Examen I ............................................................................................................................................................................. 8
Examen 2 ............................................................................................................................................................................ 8
Examen 3 ............................................................................................................................................................................ 8
Politique sur les évaluations ..................................................................................................................................................... 8
Échelle des cotes ...................................................................................................................................................................... 9
Politique sur l'utilisation d'appareils électroniques .................................................................................................................... 9
Politique sur le plagiat et la fraude académique ..................................................................................................................... 10
Étudiants ayant un handicap, un trouble d’apprentissage ou un trouble mental .................................................................... 10
Étudiants ayant un handicap, un trouble d’apprentissage ou un trouble mental .................................................................... 10
Matériel didactique ........................................................................................................................................................................ 10
Matériel obligatoire .................................................................................................................................................................. 10
Matériel complémentaire ........................................................................................................................................................ 11
Médiagraphie et annexes .............................................................................................................................................................. 11
Présentations Powerpoint et autres documents ..................................................................................................................... 11

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Description du cours
Objectifs
Ce cours a pour but de familiariser l'étudiante ou l'étudiant aux principaux domaines de la microbiologie, soit: la bactériologie, la
phycologie, la mycologie, la protistologie, la virologie, de l'immunologie et de l’écologie microbienne. Les principales notions de
base, la méthodologie et quelques applications pratiques de la microbiologie seront présentées
À la fin du cours de Microbiologie Générale l'étudiant(e) devrait connaître et maîtriser les objectifs généraux suivants:
- l'historique de la microbiologie,
- les différentes techniques de microscopie, leurs principes et leurs applications,
- la structure des cellules bactériennes ainsi que la composition biochimique et les fonctions de leurs structures cellulaires,
- les principes de la nutrition bactérienne et leurs applications dans la culture des bactéries,
- les différentes caractéristiques identifiables dans une culture bactérienne,
- les processus de division cellulaire retrouvés chez les bactéries,
- la dynamique d'évolution d'une population bactérienne,
- les méthodes employées pour quantifier les populations bactériennes,
- les notions de base de la génétique bactérienne,
- les différents types de caractéristiques qui peuvent être déterminés chez les microorganismes,
- la classification des microorganismes; les caractères distinctifs des grands groupes bactériens,
- les caractères distinctifs des microorganismes eucaryotes ( champignons microscopiques, algues microscopiques eti.e.
protozoaires),
- les caractéristiques propres aux virus,
- les notions élémentaires de l'immunologie.
Finalement, l'étudiant(e) devrait être capable de faire des liens entre les différentes notions acquises.
Objectifs spécifiques
À la fin du cours, l’étudiant sera capable de :
Comprendre les faits saillants de l’historique de la microbiologie (objectif général)
1. Nommer les principales découvertes et découvreurs des microorganismes
2. Situer les principales découvertes et découvreurs des microorganismes dans le temps
3. Reconnaître les liens entre la présence de microorganismes et l’étiologie des maladies
4. Reconnaître les liens entre la présence de microorganismes et les cycles de la matière
5. Reconnaître les principes d’unité de la biochimie et de la génétique dans le monde vivant
Comprendre les principes de base de la microscopie et analyser des images générées par les différents microscopes (objectif
général)
6. Décrire les composantes d’un microscope optique et leurs fonctions
7. Décrire les facteurs limitants en microscopie optique

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7. Décrire les facteurs limitants en microscopie optique
8. Résoudre des situations pratiques et théoriques (simples) impliquant les principes, les applications et les limites en
microscopie i) à fond clair, ii) à fond noir, iii) à contraste de phase, iv) à contraste d’interférence différentielle, v) à fluorescence,
vi) confocal à balayage laser, vii) électronique à transmission ou balayage, et viii) à balayage de sonde (effet tunnel et force
atomique)
Comprendre la morphologie et la structure de la cellule bactérienne. Analyser les fonctions différentes composantes des parois
cellulaires bactériennes (objectifs généraux)
9. Différencier les eucaryotes des procaryotes
10. Reconnaître les différences morphologiques et physiologiques entre les grands groupes de procaryotes
11. Associer les fonctions (rôles) aux différentes composantes des parois cellulaires bactériennes
12. Établir les liens entre la structure des parois cellulaires et la coloration de Gram
13. Associer les structures intracellulaires et extracellulaires des bactéries a leurs fonctions
Connaître ce que la cellule a besoin pour croitre. Analyser les conditions permettant une croissance optimale (objectifs
généraux)
14. Reconnaître l’apport des nutriments essentiels à la croissance des bactéries
15. Identifier les mécanismes d’assimilation des nutriments
16. Identifier les principes du métabolisme bactérien
17. Décrire la composition moléculaire des cellules bactériennes
18. Identifier les types trophiques bactériens basés sur l’utilisation des sources de carbone et d’énergie.
19. Regrouper les groupes bactériens en fonction de leur capacité à croître en présence d’oxygène
20. Nommer les groupes bactériens en fonction de leur température de croissance
21. Identifier les caractéristiques générales d’un milieu de culture
22. Résoudre des situations pratiques impliquant les applications des moyens de stérilisation
23. Identifier les caractéristiques des organismes et les moyens de confinement des groupes de biorisque
Comprendre l’évolution des populations bactériennes. Analyser des situations demandant d’évaluer des population
bactériennes (objectifs généraux)
24. Identifier les mécanismes de division cellulaire chez les bactéries
25. Identifier les mécanismes moléculaires impliqués dans la fission binaire
26. Décrire les aspects mathématiques de la croissance par fission binaire
27. Décrire l’état physiologique des cellules durant les différentes étapes de la courbe de croissance
28. Reconnaître les caractéristiques de la culture continue
29. Résoudre des situations pratiques impliquant les méthodes servant à quantifier les populations bactériennes
Comprendre les caractères des cultures microbiennes. Analyser les différentes caractéristiques des cultures microbiennes
(objectifs généraux)
30. Reconnaître la biodiversité des échantillons microbiens en provenance de l’environnement
31. Identifier les principes et les limites des méthodes d’enrichissement d’un échantillon microbien et l’obtention de
cultures pures
32. Résoudre des situations pratiques impliquant les méthodes permettant la conservation de cultures pures

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32. Résoudre des situations pratiques impliquant les méthodes permettant la conservation de cultures pures
33. Reconnaitre les caractères culturaux des bactéries
34. Reconnaître l’importance de la croissance microbienne sous forme de biofilm
35. Identifier les étapes de formation d’un biofilm
36. Reconnaître les moyens de contrôler les biofilms
Comprendre la génétique bactérienne (objectif général)
37. Identifier les avantages de bactéries comme modèles génétiques
38. Identifier les différences entre les modifications du phénotype et du génotype
39. Décrire les mécanismes de recombinaison
40. Décrire les mécanismes cellulaires et moléculaires de la transformation bactérienne
41. Décrire les mécanismes cellulaires et moléculaires de la conjugaison chez les bactéries à Gram-négatif et à
Gram-positif
42. Décrire les mécanismes cellulaires et moléculaires des transductions généralisée et spécialisée.
43. Reconnaître les impacts des transferts horizontaux de gènes sur l’évolution des bactéries.
Comprendre la taxonomie des microorganismes (objectif général)
44. Appliquer les règles de la nomenclature bactérienne
45. Définir les concepts des culture pure, souche, espèce et souche-type
46. Identifier les types de caractère utilisés dans l’identification des bactéries
47. Décrire les principes et les différences entre les classifications des microorganismes
48. Décrire la classification phylogénétique des microorganismes
49. Décrire la théorie de l’endosymbiose
50. Identifier les différents domaines de l’arbre de la vie
Comprendre la diversité des groupes microbiens (objectif général)
51. Décrire les structures et les caractères physiologiques propres aux Archaea
52. Identifier les caractéristiques des grands groupes d’Archaea
53. Identifier les caractéristiques des grands groupes des Bacteria
54. Reconnaître les caractéristiques des grands groupes des bactéries photosynthétiques
55. Identifier les caractéristiques des microorganismes eucaryotes
56. Nommer les caractéristiques morphologiques et physiologiques des mycètes
57. Décrire les interactions entre les mycètes et les autres organismes (symbioses et antagonismes)
58. Identifier la position phylogénétique des protistes.
59. Reconnaître les caractères distinctifs des différents groupes de protistes.
60. Identifier les caractères morphologiques et physiologiques des protozoaires et des micro-algues
61. Décrire les interactions entre protistes-environnement et protistes-hôtes.
Comprendre les caractéristiques générales des virus et des agents infectieux acellulaires (objectif général)